MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_016931	ATT	2	6	1119456	1119461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714136
28503	NC_016931	AAT	2	6	1119492	1119497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714136
28504	NC_016931	GTA	2	6	1119536	1119541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714136
28505	NC_016931	CTG	2	6	1119555	1119560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714136
28506	NC_016931	TAAT	2	8	1119592	1119599	50 %	50 %	0 %	0 %	379714136
28507	NC_016931	ATA	2	6	1119600	1119605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714136
28508	NC_016931	ATA	2	6	1119632	1119637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714136
28509	NC_016931	T	8	8	1119641	1119648	0 %	100 %	0 %	0 %	379714136
28510	NC_016931	T	6	6	1119709	1119714	0 %	100 %	0 %	0 %	379714136
28511	NC_016931	ATG	2	6	1119750	1119755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714136
28512	NC_016931	GCTA	2	8	1119765	1119772	25 %	25 %	25 %	25 %	379714136
28513	NC_016931	T	6	6	1119786	1119791	0 %	100 %	0 %	0 %	379714136
28514	NC_016931	GCA	2	6	1119802	1119807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714136
28515	NC_016931	TAC	3	9	1119821	1119829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714136
28516	NC_016931	T	8	8	1119869	1119876	0 %	100 %	0 %	0 %	379714136
28517	NC_016931	GAA	2	6	1119907	1119912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28518	NC_016931	ACG	2	6	1119925	1119930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28519	NC_016931	TA	3	6	1120011	1120016	50 %	50 %	0 %	0 %	379714137
28520	NC_016931	TTTA	2	8	1120077	1120084	25 %	75 %	0 %	0 %	379714137
28521	NC_016931	CTT	2	6	1120106	1120111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714137
28522	NC_016931	CAG	2	6	1120187	1120192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714137
28523	NC_016931	ACA	2	6	1120273	1120278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714137
28524	NC_016931	TAA	2	6	1120281	1120286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714137
28525	NC_016931	CTT	2	6	1120325	1120330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714137
28526	NC_016931	ATT	2	6	1120350	1120355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714137
28527	NC_016931	AAT	2	6	1120387	1120392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714137
28528	NC_016931	TCT	2	6	1120416	1120421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714137
28529	NC_016931	ATTT	2	8	1120445	1120452	25 %	75 %	0 %	0 %	379714137
28530	NC_016931	ATT	2	6	1120461	1120466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714137
28531	NC_016931	TGT	3	9	1120596	1120604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714137
28532	NC_016931	TA	3	6	1120609	1120614	50 %	50 %	0 %	0 %	379714137
28533	NC_016931	TGT	2	6	1120617	1120622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714137
28534	NC_016931	T	6	6	1120710	1120715	0 %	100 %	0 %	0 %	379714137
28535	NC_016931	ATT	2	6	1120749	1120754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714137
28536	NC_016931	T	8	8	1120757	1120764	0 %	100 %	0 %	0 %	379714137
28537	NC_016931	GTTT	2	8	1120765	1120772	0 %	75 %	25 %	0 %	379714137
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28539	NC_016931	T	8	8	1120790	1120797	0 %	100 %	0 %	0 %	379714137
28540	NC_016931	TTC	2	6	1120829	1120834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714138
28541	NC_016931	TTGT	2	8	1120935	1120942	0 %	75 %	25 %	0 %	379714138
28542	NC_016931	T	6	6	1121002	1121007	0 %	100 %	0 %	0 %	379714138
28543	NC_016931	GAT	2	6	1121062	1121067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714138
28544	NC_016931	TAA	2	6	1121156	1121161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714138
28545	NC_016931	TA	3	6	1121186	1121191	50 %	50 %	0 %	0 %	379714138
28546	NC_016931	TAT	2	6	1121198	1121203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714138
28547	NC_016931	ATC	2	6	1121246	1121251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714138
28548	NC_016931	TAA	2	6	1121302	1121307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714138
28549	NC_016931	T	6	6	1121331	1121336	0 %	100 %	0 %	0 %	379714138
28550	NC_016931	ACA	2	6	1121355	1121360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714138
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28552	NC_016931	AAC	2	6	1121491	1121496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714138
28553	NC_016931	ACTC	2	8	1121624	1121631	25 %	25 %	0 %	50 %	379714138
28554	NC_016931	CAG	2	6	1121662	1121667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714138
28555	NC_016931	CCGC	2	8	1121673	1121680	0 %	0 %	25 %	75 %	379714138
28556	NC_016931	TA	3	6	1121690	1121695	50 %	50 %	0 %	0 %	379714138
28557	NC_016931	TAC	2	6	1121707	1121712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714138
28558	NC_016931	ATATTT	2	12	1121753	1121764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714138
28559	NC_016931	T	6	6	1121772	1121777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28560	NC_016931	TTA	2	6	1121784	1121789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28561	NC_016931	CTAA	2	8	1121805	1121812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28562	NC_016931	TTG	2	6	1121821	1121826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28563	NC_016931	A	6	6	1121914	1121919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28564	NC_016931	T	6	6	1121924	1121929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28565	NC_016931	CAA	2	6	1121979	1121984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28568	NC_016931	TAC	2	6	1122233	1122238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714139
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28570	NC_016931	TTAT	2	8	1122280	1122287	25 %	75 %	0 %	0 %	379714139
28571	NC_016931	TTCA	2	8	1122288	1122295	25 %	50 %	0 %	25 %	379714139
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28573	NC_016931	TTTA	2	8	1122324	1122331	25 %	75 %	0 %	0 %	379714139
28574	NC_016931	AAT	2	6	1122351	1122356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714139
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28580	NC_016931	CTA	2	6	1122605	1122610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714139
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28584	NC_016931	T	6	6	1122846	1122851	0 %	100 %	0 %	0 %	379714139
28585	NC_016931	CAT	2	6	1123068	1123073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714140
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28588	NC_016931	CAT	2	6	1123121	1123126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714140
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28590	NC_016931	TA	3	6	1123231	1123236	50 %	50 %	0 %	0 %	379714140
28591	NC_016931	AGCAA	2	10	1123263	1123272	60 %	0 %	20 %	20 %	379714140
28592	NC_016931	ATC	2	6	1123281	1123286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714140
28593	NC_016931	AAAT	2	8	1123287	1123294	75 %	25 %	0 %	0 %	379714140
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28601	NC_016931	AAT	2	6	1123596	1123601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714140
28602	NC_016931	AGG	2	6	1123649	1123654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714140
28603	NC_016931	CTA	2	6	1123742	1123747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714140
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28606	NC_016931	TAA	2	6	1123852	1123857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714140
28607	NC_016931	GTTA	2	8	1123878	1123885	25 %	50 %	25 %	0 %	379714140
28608	NC_016931	TCA	2	6	1123930	1123935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714140
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28613	NC_016931	AGCA	2	8	1124121	1124128	50 %	0 %	25 %	25 %	379714140
28614	NC_016931	TAA	2	6	1124141	1124146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714140
28615	NC_016931	CTT	2	6	1124168	1124173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714140
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