MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_016931	ATAA	2	8	1099538	1099545	75 %	25 %	0 %	0 %	379714118
28003	NC_016931	AATT	2	8	1099609	1099616	50 %	50 %	0 %	0 %	379714118
28004	NC_016931	TGC	2	6	1099696	1099701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714118
28005	NC_016931	A	7	7	1099732	1099738	100 %	0 %	0 %	0 %	379714118
28006	NC_016931	ATT	2	6	1099742	1099747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714118
28007	NC_016931	AAT	2	6	1099763	1099768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714118
28008	NC_016931	TAA	2	6	1099780	1099785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714118
28009	NC_016931	TA	3	6	1099792	1099797	50 %	50 %	0 %	0 %	379714118
28010	NC_016931	T	6	6	1099821	1099826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28011	NC_016931	AAT	2	6	1099849	1099854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28012	NC_016931	CAAA	2	8	1099968	1099975	75 %	0 %	0 %	25 %	379714119
28013	NC_016931	GCC	2	6	1100056	1100061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714119
28014	NC_016931	ACA	2	6	1100077	1100082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714119
28015	NC_016931	TTA	2	6	1100180	1100185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714119
28016	NC_016931	AT	3	6	1100232	1100237	50 %	50 %	0 %	0 %	379714119
28017	NC_016931	CTT	2	6	1100259	1100264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714119
28018	NC_016931	GCT	2	6	1100321	1100326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714119
28019	NC_016931	CTT	2	6	1100367	1100372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714119
28020	NC_016931	T	6	6	1100395	1100400	0 %	100 %	0 %	0 %	379714119
28021	NC_016931	TA	4	8	1100418	1100425	50 %	50 %	0 %	0 %	379714119
28022	NC_016931	TCT	2	6	1100444	1100449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714119
28023	NC_016931	T	7	7	1100454	1100460	0 %	100 %	0 %	0 %	379714119
28024	NC_016931	CAT	2	6	1100512	1100517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714119
28025	NC_016931	GCA	2	6	1100522	1100527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714119
28026	NC_016931	TGC	2	6	1100609	1100614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714119
28027	NC_016931	CAG	2	6	1100658	1100663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714119
28028	NC_016931	GATAT	2	10	1100672	1100681	40 %	40 %	20 %	0 %	379714119
28029	NC_016931	ATA	2	6	1100756	1100761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714119
28030	NC_016931	TTA	2	6	1100771	1100776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714119
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28032	NC_016931	T	6	6	1100869	1100874	0 %	100 %	0 %	0 %	379714119
28033	NC_016931	T	6	6	1100882	1100887	0 %	100 %	0 %	0 %	379714119
28034	NC_016931	TAA	2	6	1100910	1100915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714119
28035	NC_016931	CATA	2	8	1100955	1100962	50 %	25 %	0 %	25 %	379714119
28036	NC_016931	GAAAC	2	10	1101063	1101072	60 %	0 %	20 %	20 %	379714119
28037	NC_016931	TCC	2	6	1101136	1101141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714119
28038	NC_016931	AGT	2	6	1101151	1101156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714119
28039	NC_016931	CTT	2	6	1101232	1101237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714119
28040	NC_016931	AT	3	6	1101297	1101302	50 %	50 %	0 %	0 %	379714119
28041	NC_016931	ATT	2	6	1101317	1101322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714119
28042	NC_016931	CT	3	6	1101384	1101389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28043	NC_016931	ACA	2	6	1101437	1101442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28044	NC_016931	CTT	2	6	1101463	1101468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714120
28045	NC_016931	TC	3	6	1101473	1101478	0 %	50 %	0 %	50 %	379714120
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28052	NC_016931	GCA	2	6	1101792	1101797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714120
28053	NC_016931	T	7	7	1101832	1101838	0 %	100 %	0 %	0 %	379714120
28054	NC_016931	TCT	2	6	1101915	1101920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714120
28055	NC_016931	TAT	2	6	1101962	1101967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714120
28056	NC_016931	ATA	2	6	1101982	1101987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714120
28057	NC_016931	ATC	2	6	1101996	1102001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714120
28058	NC_016931	AATA	2	8	1102183	1102190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28059	NC_016931	AAT	2	6	1102280	1102285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28060	NC_016931	ATG	2	6	1102393	1102398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714121
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28064	NC_016931	CCT	2	6	1102599	1102604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714122
28065	NC_016931	CT	3	6	1102608	1102613	0 %	50 %	0 %	50 %	379714122
28066	NC_016931	ATAA	2	8	1102662	1102669	75 %	25 %	0 %	0 %	379714122
28067	NC_016931	ATA	2	6	1102794	1102799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28068	NC_016931	ATT	2	6	1102860	1102865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714123
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28071	NC_016931	CAAA	2	8	1103154	1103161	75 %	0 %	0 %	25 %	379714123
28072	NC_016931	TTA	2	6	1103209	1103214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714123
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28084	NC_016931	CTAT	2	8	1103994	1104001	25 %	50 %	0 %	25 %	379714123
28085	NC_016931	TAT	2	6	1104016	1104021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714123
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28089	NC_016931	TGA	3	9	1104080	1104088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714123
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28098	NC_016931	CGAG	2	8	1104581	1104588	25 %	0 %	50 %	25 %	379714123
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28100	NC_016931	A	6	6	1104700	1104705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28101	NC_016931	A	6	6	1104785	1104790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28102	NC_016931	TAA	2	6	1104814	1104819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714124
28103	NC_016931	AAT	2	6	1104938	1104943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714124
28104	NC_016931	CTT	2	6	1104950	1104955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714124
28105	NC_016931	A	6	6	1104993	1104998	100 %	0 %	0 %	0 %	379714124
28106	NC_016931	CTT	2	6	1105004	1105009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714124
28107	NC_016931	CCA	2	6	1105010	1105015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714124
28108	NC_016931	T	7	7	1105031	1105037	0 %	100 %	0 %	0 %	379714124
28109	NC_016931	TAT	2	6	1105047	1105052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714124
28110	NC_016931	CAAT	2	8	1105099	1105106	50 %	25 %	0 %	25 %	379714124
28111	NC_016931	GCA	2	6	1105129	1105134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714124
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28114	NC_016931	A	7	7	1105276	1105282	100 %	0 %	0 %	0 %	379714124
28115	NC_016931	TCT	2	6	1105330	1105335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714124
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28117	NC_016931	TGT	2	6	1105402	1105407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714124
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