MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016931	CCT	2	6	58788	58793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_016931	TTA	2	6	58818	58823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016931	TAA	2	6	58844	58849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016931	A	6	6	58848	58853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016931	TAT	3	9	58856	58864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016931	A	6	6	58889	58894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016931	AATACA	2	12	58896	58907	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1508	NC_016931	T	6	6	58909	58914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016931	ATT	2	6	58966	58971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016931	T	6	6	58970	58975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016931	TA	3	6	59007	59012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016931	CATA	2	8	59030	59037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_016931	A	6	6	59059	59064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016931	AAT	2	6	59098	59103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016931	TA	4	8	59235	59242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016931	ACA	2	6	59245	59250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_016931	A	7	7	59264	59270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016931	TGT	2	6	59273	59278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016931	AT	4	8	59280	59287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016931	T	7	7	59339	59345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016931	T	6	6	59375	59380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016931	AT	3	6	59390	59395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016931	TTTTTG	2	12	59433	59444	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016931	AATG	2	8	59458	59465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016931	TAA	2	6	59471	59476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016931	TAA	2	6	59510	59515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016931	ATT	2	6	59524	59529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016931	T	8	8	59560	59567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016931	TAA	2	6	59670	59675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016931	ATT	2	6	59714	59719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016931	TCT	2	6	59762	59767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_016931	TCC	2	6	59782	59787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_016931	AG	3	6	59846	59851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016931	ATT	2	6	59913	59918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016931	TAA	2	6	59986	59991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016931	ATT	2	6	60034	60039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016931	GTT	2	6	60095	60100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016931	CAC	2	6	60158	60163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_016931	GGT	2	6	60204	60209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016931	T	6	6	60240	60245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016931	AAGAAA	2	12	60316	60327	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379713139
1542	NC_016931	ATAA	2	8	60419	60426	75 %	25 %	0 %	0 %	379713139
1543	NC_016931	AT	3	6	60431	60436	50 %	50 %	0 %	0 %	379713139
1544	NC_016931	AACA	2	8	60514	60521	75 %	0 %	0 %	25 %	379713139
1545	NC_016931	TAT	2	6	60532	60537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713139
1546	NC_016931	GGA	2	6	60555	60560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713139
1547	NC_016931	GA	3	6	60564	60569	50 %	0 %	50 %	0 %	379713139
1548	NC_016931	GTG	2	6	60602	60607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713139
1549	NC_016931	TTA	2	6	60642	60647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016931	TTAGT	2	10	60716	60725	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016931	TAG	2	6	60748	60753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016931	T	7	7	60774	60780	0 %	100 %	0 %	0 %	379713140
1553	NC_016931	T	6	6	60805	60810	0 %	100 %	0 %	0 %	379713140
1554	NC_016931	GCC	2	6	60850	60855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713140
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1557	NC_016931	AAT	2	6	61095	61100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713140
1558	NC_016931	TAA	2	6	61195	61200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713140
1559	NC_016931	AGCA	2	8	61252	61259	50 %	0 %	25 %	25 %	379713140
1560	NC_016931	TTC	2	6	61282	61287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713140
1561	NC_016931	TTC	2	6	61300	61305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713140
1562	NC_016931	T	7	7	61386	61392	0 %	100 %	0 %	0 %	379713140
1563	NC_016931	ATT	2	6	61411	61416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713140
1564	NC_016931	CAC	2	6	61462	61467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_016931	ATT	2	6	61573	61578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016931	ATA	2	6	61582	61587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016931	ATG	2	6	61588	61593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016931	GAA	2	6	61601	61606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016931	CAT	2	6	61617	61622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_016931	TCT	2	6	61703	61708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_016931	T	6	6	61743	61748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016931	GAA	2	6	61777	61782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016931	ATT	2	6	61783	61788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016931	ATA	2	6	61814	61819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016931	TTC	2	6	61847	61852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016931	T	6	6	61903	61908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016931	AT	3	6	61912	61917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016931	CTTGA	2	10	61945	61954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1579	NC_016931	ATT	2	6	61965	61970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016931	T	6	6	62019	62024	0 %	100 %	0 %	0 %	379713141
1581	NC_016931	TAA	2	6	62045	62050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713141
1582	NC_016931	TTA	2	6	62052	62057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713141
1583	NC_016931	CTT	2	6	62062	62067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713141
1584	NC_016931	AT	3	6	62077	62082	50 %	50 %	0 %	0 %	379713141
1585	NC_016931	AGC	2	6	62182	62187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713141
1586	NC_016931	TTA	2	6	62214	62219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016931	CTT	2	6	62290	62295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016931	CTGA	2	8	62301	62308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_016931	TAT	2	6	62338	62343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016931	AT	3	6	62359	62364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016931	AAT	2	6	62394	62399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_016931	TA	4	8	62466	62473	50 %	50 %	0 %	0 %	379713142
1594	NC_016931	ATTG	2	8	62476	62483	25 %	50 %	25 %	0 %	379713142
1595	NC_016931	T	6	6	62548	62553	0 %	100 %	0 %	0 %	379713142
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1598	NC_016931	CTTTT	2	10	62605	62614	0 %	80 %	0 %	20 %	379713142
1599	NC_016931	TAAA	2	8	62637	62644	75 %	25 %	0 %	0 %	379713142
1600	NC_016931	AGA	2	6	62729	62734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713142
1601	NC_016931	ATTT	2	8	62742	62749	25 %	75 %	0 %	0 %	379713142
1602	NC_016931	T	6	6	62782	62787	0 %	100 %	0 %	0 %	379713142
1603	NC_016931	TCT	2	6	62825	62830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713142
1604	NC_016931	TAA	2	6	62840	62845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713142
1605	NC_016931	ATT	2	6	62908	62913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016931	T	7	7	62932	62938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016931	TA	3	6	62940	62945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016931	CTT	2	6	62975	62980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_016931	ATTA	2	8	62982	62989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016931	AT	3	6	63007	63012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016931	TTATT	2	10	63035	63044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016931	ATC	2	6	63069	63074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_016931	TGCT	2	8	63105	63112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_016931	TAA	2	6	63126	63131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016931	TTTTA	2	10	63140	63149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016931	TCA	2	6	63198	63203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_016931	ATT	2	6	63227	63232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016931	GCTT	2	8	63233	63240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_016931	AT	3	6	63286	63291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016931	AAT	2	6	63295	63300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016931	AGAGTT	2	12	63357	63368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016931	T	6	6	63382	63387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016931	TAG	2	6	63417	63422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016931	T	6	6	63440	63445	0 %	100 %	0 %	0 %	379713143
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1626	NC_016931	T	6	6	63529	63534	0 %	100 %	0 %	0 %	379713143
1627	NC_016931	T	8	8	63575	63582	0 %	100 %	0 %	0 %	379713143
1628	NC_016931	TCT	2	6	63661	63666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713143
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1631	NC_016931	ATTA	2	8	63738	63745	50 %	50 %	0 %	0 %	379713143
1632	NC_016931	TCT	2	6	63811	63816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713143
1633	NC_016931	T	6	6	63816	63821	0 %	100 %	0 %	0 %	379713143
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