MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_016931	ATA	2	6	630829	630834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713661
16003	NC_016931	TGA	2	6	630854	630859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713661
16004	NC_016931	A	6	6	630876	630881	100 %	0 %	0 %	0 %	379713661
16005	NC_016931	ATG	2	6	630889	630894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713661
16006	NC_016931	TTAA	2	8	630906	630913	50 %	50 %	0 %	0 %	379713661
16007	NC_016931	AGA	2	6	630971	630976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713661
16008	NC_016931	TAAA	2	8	630991	630998	75 %	25 %	0 %	0 %	379713661
16009	NC_016931	A	6	6	631000	631005	100 %	0 %	0 %	0 %	379713661
16010	NC_016931	TAT	2	6	631052	631057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713661
16011	NC_016931	AGGT	2	8	631067	631074	25 %	25 %	50 %	0 %	379713661
16012	NC_016931	GAA	2	6	631218	631223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713661
16013	NC_016931	AAG	2	6	631224	631229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713661
16014	NC_016931	AGGC	2	8	631240	631247	25 %	0 %	50 %	25 %	379713661
16015	NC_016931	GATA	2	8	631289	631296	50 %	25 %	25 %	0 %	379713661
16016	NC_016931	TGA	2	6	631361	631366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713661
16017	NC_016931	CCA	2	6	631445	631450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379713661
16018	NC_016931	GAT	2	6	631454	631459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713661
16019	NC_016931	GCA	2	6	631481	631486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713661
16020	NC_016931	TTA	2	6	631524	631529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713661
16021	NC_016931	TGA	2	6	631535	631540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713661
16022	NC_016931	AATG	2	8	631544	631551	50 %	25 %	25 %	0 %	379713661
16023	NC_016931	ATA	2	6	631563	631568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713661
16024	NC_016931	ATT	2	6	631587	631592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713661
16025	NC_016931	TAC	2	6	631625	631630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713661
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16027	NC_016931	T	6	6	631729	631734	0 %	100 %	0 %	0 %	379713661
16028	NC_016931	GTA	2	6	631755	631760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713661
16029	NC_016931	ATG	2	6	631768	631773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713661
16030	NC_016931	GAA	3	9	631779	631787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713661
16031	NC_016931	AT	4	8	631819	631826	50 %	50 %	0 %	0 %	379713661
16032	NC_016931	AGA	2	6	631835	631840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713661
16033	NC_016931	TAG	2	6	631847	631852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713661
16034	NC_016931	AT	3	6	631877	631882	50 %	50 %	0 %	0 %	379713661
16035	NC_016931	ACTA	2	8	631886	631893	50 %	25 %	0 %	25 %	379713661
16036	NC_016931	TA	3	6	631921	631926	50 %	50 %	0 %	0 %	379713661
16037	NC_016931	AAGGC	2	10	631940	631949	40 %	0 %	40 %	20 %	379713661
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16043	NC_016931	GGGTA	2	10	632267	632276	20 %	20 %	60 %	0 %	379713661
16044	NC_016931	AAATAT	2	12	632313	632324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713661
16045	NC_016931	GCA	2	6	632405	632410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_016931	A	6	6	632535	632540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_016931	AT	3	6	632583	632588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_016931	A	6	6	632597	632602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_016931	TAA	2	6	632611	632616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_016931	AAT	2	6	632651	632656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_016931	A	7	7	632720	632726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_016931	GAAA	2	8	632798	632805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_016931	GAA	2	6	632823	632828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_016931	TGAT	2	8	632854	632861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_016931	TCA	2	6	632912	632917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16057	NC_016931	AGA	2	6	632987	632992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_016931	AGT	2	6	633160	633165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713662
16059	NC_016931	GTA	2	6	633245	633250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713662
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16063	NC_016931	A	7	7	633345	633351	100 %	0 %	0 %	0 %	379713662
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16076	NC_016931	TTC	2	6	634080	634085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_016931	TGC	2	6	634214	634219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713664
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16082	NC_016931	GAAA	2	8	634632	634639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16089	NC_016931	A	6	6	634773	634778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16091	NC_016931	ATA	2	6	634841	634846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_016931	ACTC	2	8	634849	634856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16093	NC_016931	TTTAG	2	10	634859	634868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_016931	T	6	6	634884	634889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_016931	GTA	2	6	634928	634933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16097	NC_016931	AAAT	2	8	634985	634992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_016931	TAA	2	6	634995	635000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_016931	ATTG	2	8	635013	635020	25 %	50 %	25 %	0 %	379713665
16100	NC_016931	AT	3	6	635083	635088	50 %	50 %	0 %	0 %	379713665
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16106	NC_016931	TCG	2	6	635564	635569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_016931	AGA	2	6	635585	635590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_016931	GAA	2	6	635703	635708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_016931	CTG	2	6	635719	635724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_016931	TGC	2	6	635750	635755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_016931	ATTA	2	8	635807	635814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_016931	AAG	2	6	635824	635829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_016931	GAT	2	6	635835	635840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_016931	ACA	2	6	635874	635879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_016931	ATC	2	6	635956	635961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_016931	GTT	2	6	636003	636008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_016931	TTTAG	2	10	636021	636030	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_016931	ATG	2	6	636058	636063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_016931	TCCT	2	8	636088	636095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16120	NC_016931	GAT	2	6	636108	636113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_016931	TGC	2	6	636161	636166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_016931	TAG	2	6	636169	636174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_016931	TAT	2	6	636187	636192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_016931	TTA	2	6	636244	636249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_016931	CTGC	2	8	636265	636272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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