MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_016931	TAA	2	6	569738	569743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_016931	A	6	6	569742	569747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_016931	CAAT	2	8	569801	569808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14505	NC_016931	CAA	2	6	569810	569815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_016931	T	6	6	569877	569882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_016931	TAG	2	6	569964	569969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713602
14508	NC_016931	CAG	2	6	569993	569998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713602
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14510	NC_016931	ATT	2	6	570061	570066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713602
14511	NC_016931	TTA	2	6	570073	570078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713602
14512	NC_016931	T	7	7	570092	570098	0 %	100 %	0 %	0 %	379713602
14513	NC_016931	T	6	6	570127	570132	0 %	100 %	0 %	0 %	379713602
14514	NC_016931	ATA	3	9	570140	570148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713602
14515	NC_016931	TTTAG	2	10	570187	570196	20 %	60 %	20 %	0 %	379713602
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14517	NC_016931	AAG	2	6	570274	570279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713602
14518	NC_016931	TTTA	2	8	570417	570424	25 %	75 %	0 %	0 %	379713602
14519	NC_016931	TGA	2	6	570462	570467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713602
14520	NC_016931	CTA	2	6	570488	570493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713602
14521	NC_016931	TAG	2	6	570500	570505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713602
14522	NC_016931	A	6	6	570562	570567	100 %	0 %	0 %	0 %	379713602
14523	NC_016931	TGG	2	6	570584	570589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713602
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14525	NC_016931	ATTAA	2	10	570625	570634	60 %	40 %	0 %	0 %	379713602
14526	NC_016931	ATG	2	6	570644	570649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713602
14527	NC_016931	TATT	2	8	570652	570659	25 %	75 %	0 %	0 %	379713602
14528	NC_016931	TAG	2	6	570671	570676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713602
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14532	NC_016931	CTT	2	6	570802	570807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713602
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14534	NC_016931	AGC	2	6	570983	570988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713602
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14537	NC_016931	A	7	7	571050	571056	100 %	0 %	0 %	0 %	379713602
14538	NC_016931	GAA	2	6	571116	571121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713602
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14541	NC_016931	TTTA	2	8	571268	571275	25 %	75 %	0 %	0 %	379713602
14542	NC_016931	TTG	2	6	571286	571291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713602
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14545	NC_016931	AAAT	2	8	571376	571383	75 %	25 %	0 %	0 %	379713602
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14554	NC_016931	ATT	2	6	571766	571771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_016931	ATA	2	6	571918	571923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713603
14556	NC_016931	GCA	2	6	571968	571973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14558	NC_016931	AT	3	6	572100	572105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_016931	TAG	2	6	572150	572155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14562	NC_016931	A	6	6	572388	572393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_016931	AT	4	8	572428	572435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_016931	A	6	6	572439	572444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_016931	TAA	2	6	572510	572515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_016931	GAT	3	9	572573	572581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14568	NC_016931	TA	3	6	572758	572763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_016931	ACTAA	2	10	572780	572789	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14570	NC_016931	AAG	2	6	572816	572821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14572	NC_016931	AAAAT	2	10	572846	572855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_016931	A	7	7	572925	572931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_016931	TAGATA	2	12	572960	572971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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14576	NC_016931	TTAG	2	8	573136	573143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_016931	GGA	2	6	573231	573236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14582	NC_016931	GAGT	2	8	573429	573436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14591	NC_016931	CA	4	8	574043	574050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14593	NC_016931	TCGTG	2	10	574074	574083	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14594	NC_016931	GGA	2	6	574179	574184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14597	NC_016931	GGT	2	6	574439	574444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_016931	CCT	2	6	574537	574542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14599	NC_016931	TTTCT	2	10	574647	574656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14600	NC_016931	T	7	7	574656	574662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_016931	TCT	2	6	574676	574681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_016931	AAAG	2	8	574704	574711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_016931	TA	3	6	574745	574750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14606	NC_016931	T	6	6	574906	574911	0 %	100 %	0 %	0 %	379713604
14607	NC_016931	AATG	2	8	574920	574927	50 %	25 %	25 %	0 %	379713604
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14611	NC_016931	ATT	2	6	575097	575102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_016931	AT	3	6	575106	575111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_016931	CTG	2	6	575127	575132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14614	NC_016931	TTA	2	6	575137	575142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_016931	AAT	2	6	575162	575167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_016931	TTG	2	6	575173	575178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_016931	CAA	2	6	575193	575198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_016931	TAT	2	6	575230	575235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_016931	AATTT	2	10	575292	575301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_016931	TAA	2	6	575397	575402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_016931	TAA	2	6	575443	575448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_016931	AC	3	6	575479	575484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14623	NC_016931	A	6	6	575518	575523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_016931	ATA	2	6	575543	575548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_016931	AAC	2	6	575646	575651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14627	NC_016931	TCA	3	9	575767	575775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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