MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016931	TTC	2	6	512244	512249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_016931	ATTG	2	8	512259	512266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_016931	AT	4	8	512316	512323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_016931	TAT	2	6	512341	512346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_016931	CAT	2	6	512418	512423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713538
13006	NC_016931	TA	3	6	512457	512462	50 %	50 %	0 %	0 %	379713538
13007	NC_016931	ACC	2	6	512505	512510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379713538
13008	NC_016931	TTGCA	2	10	512534	512543	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13009	NC_016931	T	6	6	512544	512549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_016931	TTGC	2	8	512551	512558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13011	NC_016931	TTC	2	6	512576	512581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_016931	TATCGG	2	12	512666	512677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13013	NC_016931	TAA	2	6	512679	512684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_016931	A	6	6	512695	512700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_016931	ATT	2	6	512731	512736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_016931	T	6	6	512735	512740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_016931	TA	3	6	512773	512778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_016931	ATTT	2	8	512785	512792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_016931	ATA	2	6	512868	512873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_016931	ATTT	2	8	512886	512893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_016931	AT	3	6	512901	512906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_016931	ATT	2	6	512911	512916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_016931	ATT	2	6	512947	512952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_016931	AT	3	6	512965	512970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_016931	A	7	7	512992	512998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_016931	TAT	2	6	513006	513011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_016931	TAA	3	9	513020	513028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_016931	AT	3	6	513037	513042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016931	TTC	2	6	513058	513063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_016931	ATA	2	6	513084	513089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_016931	ATT	2	6	513094	513099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_016931	ATT	2	6	513103	513108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_016931	AT	3	6	513160	513165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_016931	ATT	2	6	513175	513180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_016931	TTTG	2	8	513219	513226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_016931	GT	3	6	513340	513345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_016931	TA	4	8	513366	513373	50 %	50 %	0 %	0 %	379713539
13038	NC_016931	TCT	2	6	513382	513387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713539
13039	NC_016931	AAAT	2	8	513399	513406	75 %	25 %	0 %	0 %	379713539
13040	NC_016931	A	6	6	513433	513438	100 %	0 %	0 %	0 %	379713539
13041	NC_016931	ATTTG	2	10	513472	513481	20 %	60 %	20 %	0 %	379713539
13042	NC_016931	A	6	6	513498	513503	100 %	0 %	0 %	0 %	379713539
13043	NC_016931	GATAAA	2	12	513523	513534	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379713539
13044	NC_016931	TTA	2	6	513572	513577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713539
13045	NC_016931	TAA	2	6	513615	513620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713539
13046	NC_016931	T	6	6	513624	513629	0 %	100 %	0 %	0 %	379713539
13047	NC_016931	TCTAA	2	10	513656	513665	40 %	40 %	0 %	20 %	379713540
13048	NC_016931	TTTC	2	8	513671	513678	0 %	75 %	0 %	25 %	379713540
13049	NC_016931	A	6	6	513681	513686	100 %	0 %	0 %	0 %	379713540
13050	NC_016931	TAT	2	6	513715	513720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713540
13051	NC_016931	AAC	2	6	513737	513742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713540
13052	NC_016931	TGA	2	6	513765	513770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713540
13053	NC_016931	ATG	2	6	513808	513813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713540
13054	NC_016931	TTG	2	6	513837	513842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713540
13055	NC_016931	TCT	2	6	513954	513959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713540
13056	NC_016931	TAT	2	6	513985	513990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713540
13057	NC_016931	CAA	2	6	514072	514077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713540
13058	NC_016931	ATA	2	6	514128	514133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713540
13059	NC_016931	CTT	2	6	514153	514158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713540
13060	NC_016931	AGC	2	6	514172	514177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713540
13061	NC_016931	CCG	2	6	514209	514214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713540
13062	NC_016931	CGC	2	6	514312	514317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713540
13063	NC_016931	CAT	2	6	514334	514339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713540
13064	NC_016931	ATT	2	6	514359	514364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713540
13065	NC_016931	TAA	2	6	514390	514395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713540
13066	NC_016931	CTC	2	6	514423	514428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713540
13067	NC_016931	CGT	2	6	514478	514483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713540
13068	NC_016931	TAC	2	6	514616	514621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713540
13069	NC_016931	ACC	2	6	514688	514693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379713540
13070	NC_016931	TAA	2	6	514708	514713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713540
13071	NC_016931	AGC	2	6	514766	514771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713540
13072	NC_016931	CTA	2	6	514885	514890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713540
13073	NC_016931	ATT	2	6	514925	514930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713540
13074	NC_016931	TTTTA	2	10	515028	515037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_016931	TA	3	6	515036	515041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_016931	TAA	2	6	515057	515062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_016931	ATT	2	6	515104	515109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016931	TTA	2	6	515131	515136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713541
13079	NC_016931	CATG	2	8	515186	515193	25 %	25 %	25 %	25 %	379713541
13080	NC_016931	TAA	2	6	515199	515204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713541
13081	NC_016931	TTG	2	6	515230	515235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713541
13082	NC_016931	AT	3	6	515282	515287	50 %	50 %	0 %	0 %	379713541
13083	NC_016931	GA	3	6	515295	515300	50 %	0 %	50 %	0 %	379713541
13084	NC_016931	A	6	6	515305	515310	100 %	0 %	0 %	0 %	379713541
13085	NC_016931	TAA	2	6	515321	515326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713541
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13089	NC_016931	TAT	2	6	515608	515613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713542
13090	NC_016931	TAT	2	6	515653	515658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713542
13091	NC_016931	AT	4	8	515774	515781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_016931	AATA	2	8	515782	515789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_016931	TA	3	6	515860	515865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_016931	T	6	6	515887	515892	0 %	100 %	0 %	0 %	379713543
13095	NC_016931	TAC	2	6	515897	515902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713543
13096	NC_016931	CTG	2	6	515917	515922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713543
13097	NC_016931	AGA	2	6	515928	515933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713543
13098	NC_016931	T	6	6	515939	515944	0 %	100 %	0 %	0 %	379713543
13099	NC_016931	GCT	2	6	515946	515951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713543
13100	NC_016931	CTT	2	6	515980	515985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713543
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13102	NC_016931	TAT	2	6	516164	516169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713543
13103	NC_016931	TTTAC	2	10	516285	516294	20 %	60 %	0 %	20 %	379713543
13104	NC_016931	ATA	2	6	516300	516305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713543
13105	NC_016931	GAA	2	6	516306	516311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713543
13106	NC_016931	TCA	2	6	516339	516344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713543
13107	NC_016931	CTA	2	6	516436	516441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713543
13108	NC_016931	CGT	2	6	516445	516450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713543
13109	NC_016931	AGC	2	6	516452	516457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713543
13110	NC_016931	TTA	2	6	516471	516476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713543
13111	NC_016931	GTT	2	6	516493	516498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713543
13112	NC_016931	TCC	2	6	516575	516580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713543
13113	NC_016931	AT	3	6	516648	516653	50 %	50 %	0 %	0 %	379713543
13114	NC_016931	TAT	2	6	516763	516768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713543
13115	NC_016931	GAT	2	6	516843	516848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713543
13116	NC_016931	TTA	2	6	516855	516860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713543
13117	NC_016931	GCC	2	6	516890	516895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713543
13118	NC_016931	T	6	6	516896	516901	0 %	100 %	0 %	0 %	379713543
13119	NC_016931	TTC	2	6	516911	516916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713543
13120	NC_016931	TGTT	2	8	516952	516959	0 %	75 %	25 %	0 %	379713543
13121	NC_016931	ACT	2	6	516984	516989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713543
13122	NC_016931	TGC	2	6	517094	517099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713543
13123	NC_016931	T	7	7	517103	517109	0 %	100 %	0 %	0 %	379713543
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