MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016931	ATA	2	6	237162	237167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713299
6003	NC_016931	T	6	6	237247	237252	0 %	100 %	0 %	0 %	379713299
6004	NC_016931	ACA	2	6	237320	237325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713299
6005	NC_016931	TA	3	6	237372	237377	50 %	50 %	0 %	0 %	379713299
6006	NC_016931	ATC	2	6	237382	237387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713299
6007	NC_016931	TTG	2	6	237435	237440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713299
6008	NC_016931	AAAG	2	8	237448	237455	75 %	0 %	25 %	0 %	379713299
6009	NC_016931	CTT	2	6	237495	237500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713299
6010	NC_016931	AGT	2	6	237550	237555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713299
6011	NC_016931	GCT	2	6	237563	237568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713299
6012	NC_016931	TTC	2	6	237640	237645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713299
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6014	NC_016931	TAT	2	6	237801	237806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713299
6015	NC_016931	GCT	2	6	237854	237859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713299
6016	NC_016931	ATG	2	6	237880	237885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713299
6017	NC_016931	ATTT	2	8	237916	237923	25 %	75 %	0 %	0 %	379713299
6018	NC_016931	TTC	2	6	237931	237936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713299
6019	NC_016931	CTT	2	6	238068	238073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713299
6020	NC_016931	ATTT	2	8	238148	238155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_016931	CGA	2	6	238224	238229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_016931	ATT	2	6	238288	238293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_016931	TAT	2	6	238352	238357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
6024	NC_016931	CT	3	6	238395	238400	0 %	50 %	0 %	50 %	379713300
6025	NC_016931	ATT	2	6	238419	238424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
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6028	NC_016931	TTC	2	6	238494	238499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713300
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6030	NC_016931	TAT	2	6	238526	238531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
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6032	NC_016931	T	8	8	238557	238564	0 %	100 %	0 %	0 %	379713300
6033	NC_016931	TAA	2	6	238589	238594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713300
6034	NC_016931	TAT	2	6	238607	238612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
6035	NC_016931	TTGT	2	8	238675	238682	0 %	75 %	25 %	0 %	379713300
6036	NC_016931	AGT	2	6	238719	238724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713300
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6038	NC_016931	ATC	2	6	238812	238817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713300
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6041	NC_016931	ATT	2	6	238881	238886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
6042	NC_016931	GCC	2	6	238891	238896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713300
6043	NC_016931	GCT	2	6	239004	239009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713300
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6046	NC_016931	ATT	2	6	239184	239189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
6047	NC_016931	TA	3	6	239196	239201	50 %	50 %	0 %	0 %	379713300
6048	NC_016931	GTA	2	6	239203	239208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713300
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6051	NC_016931	CAAT	2	8	239338	239345	50 %	25 %	0 %	25 %	379713300
6052	NC_016931	TAGTT	2	10	239433	239442	20 %	60 %	20 %	0 %	379713300
6053	NC_016931	T	7	7	239459	239465	0 %	100 %	0 %	0 %	379713300
6054	NC_016931	GTACGA	2	12	239491	239502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379713300
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6057	NC_016931	ATT	2	6	239616	239621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713300
6058	NC_016931	GTTT	2	8	239675	239682	0 %	75 %	25 %	0 %	379713300
6059	NC_016931	TAA	2	6	239684	239689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713300
6060	NC_016931	CTA	2	6	239765	239770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713300
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6062	NC_016931	CTA	2	6	239899	239904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713300
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6099	NC_016931	TA	3	6	241283	241288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_016931	T	6	6	241303	241308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016931	TAA	2	6	241328	241333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016931	T	7	7	241344	241350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016931	AT	3	6	241402	241407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016931	T	6	6	241439	241444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_016931	AGCC	2	8	241527	241534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_016931	TA	3	6	241729	241734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_016931	TTC	2	6	241751	241756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_016931	CTAC	2	8	241818	241825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_016931	ATAA	2	8	241836	241843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016931	ATA	2	6	241922	241927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_016931	AAT	2	6	241947	241952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_016931	TAG	2	6	241991	241996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016931	TTCT	2	8	242145	242152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_016931	TTTA	2	8	242175	242182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016931	T	6	6	242199	242204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_016931	AAC	2	6	242214	242219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_016931	CTT	2	6	242315	242320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_016931	TAG	3	9	242408	242416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_016931	GCT	2	6	242438	242443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_016931	TC	3	6	242480	242485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_016931	TCA	2	6	242506	242511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_016931	TTC	2	6	242523	242528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_016931	ATT	2	6	242676	242681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016931	GTT	3	9	242724	242732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_016931	TAT	2	6	242744	242749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6127	NC_016931	TGC	2	6	242822	242827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713301
6128	NC_016931	TCC	2	6	242877	242882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713301
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6131	NC_016931	CTA	2	6	243018	243023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713301
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6133	NC_016931	TCA	2	6	243084	243089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713301
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6211	NC_016931	ATA	2	6	245713	245718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6212	NC_016931	TGGAG	2	10	245730	245739	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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6238	NC_016931	TAA	2	6	246876	246881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713304
6239	NC_016931	TAATT	2	10	246892	246901	40 %	60 %	0 %	0 %	379713304
6240	NC_016931	TGA	2	6	246950	246955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6241	NC_016931	CA	3	6	246984	246989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6242	NC_016931	GAC	2	6	247009	247014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6243	NC_016931	CTT	2	6	247025	247030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713305
6244	NC_016931	CTA	2	6	247054	247059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713305
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6246	NC_016931	CAT	2	6	247066	247071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713305
6247	NC_016931	CAG	2	6	247087	247092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713305
6248	NC_016931	TCTTT	2	10	247162	247171	0 %	80 %	0 %	20 %	379713305
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