MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016931	T	6	6	217896	217901	0 %	100 %	0 %	0 %	379713279
5502	NC_016931	TGC	2	6	217934	217939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713279
5503	NC_016931	ATC	2	6	217946	217951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713279
5504	NC_016931	TTC	2	6	218024	218029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713279
5505	NC_016931	TTTG	2	8	218074	218081	0 %	75 %	25 %	0 %	379713279
5506	NC_016931	TA	3	6	218089	218094	50 %	50 %	0 %	0 %	379713279
5507	NC_016931	ATG	2	6	218098	218103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713279
5508	NC_016931	TTC	2	6	218108	218113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713279
5509	NC_016931	T	7	7	218131	218137	0 %	100 %	0 %	0 %	379713279
5510	NC_016931	GTT	2	6	218154	218159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713279
5511	NC_016931	TTA	2	6	218172	218177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713279
5512	NC_016931	TAA	2	6	218185	218190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713279
5513	NC_016931	TA	3	6	218206	218211	50 %	50 %	0 %	0 %	379713279
5514	NC_016931	TAGC	2	8	218224	218231	25 %	25 %	25 %	25 %	379713279
5515	NC_016931	GTT	2	6	218244	218249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713279
5516	NC_016931	TAAA	2	8	218260	218267	75 %	25 %	0 %	0 %	379713279
5517	NC_016931	T	7	7	218268	218274	0 %	100 %	0 %	0 %	379713279
5518	NC_016931	TTA	2	6	218328	218333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713279
5519	NC_016931	CTA	2	6	218359	218364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713279
5520	NC_016931	ATT	2	6	218379	218384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713279
5521	NC_016931	GCC	2	6	218438	218443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713279
5522	NC_016931	ATT	2	6	218454	218459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713279
5523	NC_016931	AGTT	2	8	218483	218490	25 %	50 %	25 %	0 %	379713279
5524	NC_016931	TAG	2	6	218491	218496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713279
5525	NC_016931	TAAG	2	8	218515	218522	50 %	25 %	25 %	0 %	379713279
5526	NC_016931	TAA	2	6	218528	218533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713279
5527	NC_016931	AT	4	8	218537	218544	50 %	50 %	0 %	0 %	379713279
5528	NC_016931	CTT	2	6	218575	218580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713279
5529	NC_016931	TTTA	2	8	218588	218595	25 %	75 %	0 %	0 %	379713279
5530	NC_016931	CAGT	2	8	218650	218657	25 %	25 %	25 %	25 %	379713279
5531	NC_016931	ATC	2	6	218723	218728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713279
5532	NC_016931	TA	3	6	218753	218758	50 %	50 %	0 %	0 %	379713279
5533	NC_016931	T	6	6	218845	218850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_016931	A	6	6	218853	218858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_016931	GTCAA	2	10	218860	218869	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5536	NC_016931	TTA	2	6	218880	218885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_016931	TAT	2	6	218889	218894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016931	TAAA	2	8	218895	218902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_016931	TA	3	6	218926	218931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_016931	TGCATT	2	12	218933	218944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5541	NC_016931	AAC	2	6	218952	218957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_016931	ATT	2	6	219001	219006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713280
5543	NC_016931	TAA	2	6	219028	219033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713280
5544	NC_016931	TTAC	2	8	219039	219046	25 %	50 %	0 %	25 %	379713280
5545	NC_016931	AAAAGC	2	12	219061	219072	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379713280
5546	NC_016931	AGT	2	6	219125	219130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713280
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5548	NC_016931	TAG	2	6	219142	219147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713280
5549	NC_016931	TAA	2	6	219168	219173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713280
5550	NC_016931	AT	3	6	219358	219363	50 %	50 %	0 %	0 %	379713280
5551	NC_016931	ATA	2	6	219383	219388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713280
5552	NC_016931	TGG	2	6	219454	219459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713280
5553	NC_016931	TAG	2	6	219468	219473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713280
5554	NC_016931	AAAT	2	8	219529	219536	75 %	25 %	0 %	0 %	379713280
5555	NC_016931	TTCT	2	8	219555	219562	0 %	75 %	0 %	25 %	379713280
5556	NC_016931	TAT	2	6	219574	219579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713280
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5559	NC_016931	AAG	2	6	219744	219749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713280
5560	NC_016931	AAAT	2	8	219783	219790	75 %	25 %	0 %	0 %	379713280
5561	NC_016931	TAT	2	6	219804	219809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713280
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5564	NC_016931	TAA	2	6	219871	219876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713280
5565	NC_016931	ATG	2	6	219882	219887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713280
5566	NC_016931	AT	4	8	219925	219932	50 %	50 %	0 %	0 %	379713280
5567	NC_016931	AG	3	6	219968	219973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5572	NC_016931	CTG	2	6	220142	220147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713281
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5574	NC_016931	CAT	2	6	220226	220231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713281
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5578	NC_016931	AAGGC	2	10	220434	220443	40 %	0 %	40 %	20 %	379713281
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5582	NC_016931	TGC	2	6	220648	220653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713282
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5598	NC_016931	ATG	2	6	221328	221333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713283
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5601	NC_016931	AT	3	6	221388	221393	50 %	50 %	0 %	0 %	379713283
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5607	NC_016931	TA	3	6	221640	221645	50 %	50 %	0 %	0 %	379713284
5608	NC_016931	AAT	2	6	221658	221663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713284
5609	NC_016931	AAAATT	2	12	221691	221702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713284
5610	NC_016931	AGA	2	6	221739	221744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713284
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5612	NC_016931	AGT	2	6	221757	221762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713284
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5614	NC_016931	TATT	2	8	221783	221790	25 %	75 %	0 %	0 %	379713284
5615	NC_016931	TTG	2	6	221829	221834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_016931	TAT	2	6	221902	221907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_016931	TG	3	6	221951	221956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_016931	CAA	2	6	221973	221978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_016931	AAT	2	6	221990	221995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_016931	CTA	2	6	222020	222025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_016931	TTA	2	6	222045	222050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713285
5622	NC_016931	CTT	2	6	222054	222059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713285
5623	NC_016931	AT	3	6	222069	222074	50 %	50 %	0 %	0 %	379713285
5624	NC_016931	TCC	2	6	222117	222122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713285
5625	NC_016931	AGC	3	9	222150	222158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713285
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