MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 32764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016930	TTA	2	6	159928	159933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711899
4002	NC_016930	AAT	3	9	159944	159952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711900
4003	NC_016930	GAA	2	6	160004	160009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711900
4004	NC_016930	AGCA	2	8	160063	160070	50 %	0 %	25 %	25 %	379711900
4005	NC_016930	GTA	2	6	160072	160077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711900
4006	NC_016930	CTA	2	6	160165	160170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711900
4007	NC_016930	AAT	2	6	160272	160277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711900
4008	NC_016930	GAA	2	6	160290	160295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711900
4009	NC_016930	TAA	2	6	160307	160312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711900
4010	NC_016930	TTA	3	9	160366	160374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711900
4011	NC_016930	GTT	2	6	160385	160390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711900
4012	NC_016930	AG	3	6	160407	160412	50 %	0 %	50 %	0 %	379711900
4013	NC_016930	CTA	2	6	160438	160443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711900
4014	NC_016930	AAG	2	6	160444	160449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711900
4015	NC_016930	T	6	6	160460	160465	0 %	100 %	0 %	0 %	379711900
4016	NC_016930	TTC	2	6	160500	160505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711900
4017	NC_016930	A	7	7	160518	160524	100 %	0 %	0 %	0 %	379711900
4018	NC_016930	CAA	2	6	160533	160538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711900
4019	NC_016930	AT	3	6	160549	160554	50 %	50 %	0 %	0 %	379711900
4020	NC_016930	TC	3	6	160571	160576	0 %	50 %	0 %	50 %	379711900
4021	NC_016930	TAT	2	6	160604	160609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711900
4022	NC_016930	TA	3	6	160674	160679	50 %	50 %	0 %	0 %	379711901
4023	NC_016930	TCA	2	6	160682	160687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711901
4024	NC_016930	TCA	2	6	160754	160759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711901
4025	NC_016930	CAA	2	6	160773	160778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711901
4026	NC_016930	CTT	2	6	160794	160799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711901
4027	NC_016930	GAA	2	6	160809	160814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016930	TCT	2	6	160911	160916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_016930	TAAA	2	8	160928	160935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016930	AT	3	6	160995	161000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016930	T	7	7	161003	161009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016930	AT	3	6	161016	161021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016930	CAATAT	2	12	161107	161118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4034	NC_016930	TTA	2	6	161197	161202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016930	AT	4	8	161207	161214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016930	TAA	2	6	161262	161267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711902
4037	NC_016930	TTC	2	6	161311	161316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711902
4038	NC_016930	TCT	2	6	161352	161357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711902
4039	NC_016930	CTA	2	6	161361	161366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711902
4040	NC_016930	GAA	2	6	161393	161398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711902
4041	NC_016930	TGG	2	6	161407	161412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711902
4042	NC_016930	AT	3	6	161418	161423	50 %	50 %	0 %	0 %	379711902
4043	NC_016930	GCT	2	6	161444	161449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711902
4044	NC_016930	ATTGAG	2	12	161459	161470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711902
4045	NC_016930	TA	3	6	161485	161490	50 %	50 %	0 %	0 %	379711902
4046	NC_016930	ATAGC	2	10	161502	161511	40 %	20 %	20 %	20 %	379711902
4047	NC_016930	TA	3	6	161512	161517	50 %	50 %	0 %	0 %	379711902
4048	NC_016930	TTCG	2	8	161536	161543	0 %	50 %	25 %	25 %	379711902
4049	NC_016930	TAA	2	6	161546	161551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711902
4050	NC_016930	GGA	2	6	161560	161565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379711902
4051	NC_016930	ATT	2	6	161572	161577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711902
4052	NC_016930	TAA	2	6	161580	161585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711902
4053	NC_016930	TG	3	6	161598	161603	0 %	50 %	50 %	0 %	379711902
4054	NC_016930	CTA	2	6	161612	161617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711902
4055	NC_016930	TAA	2	6	161622	161627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711902
4056	NC_016930	A	7	7	161626	161632	100 %	0 %	0 %	0 %	379711902
4057	NC_016930	T	6	6	161637	161642	0 %	100 %	0 %	0 %	379711902
4058	NC_016930	TA	3	6	161649	161654	50 %	50 %	0 %	0 %	379711902
4059	NC_016930	TAA	2	6	161662	161667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711902
4060	NC_016930	CTTCAT	2	12	161685	161696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379711902
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4062	NC_016930	T	6	6	161707	161712	0 %	100 %	0 %	0 %	379711902
4063	NC_016930	ATT	2	6	161713	161718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711902
4064	NC_016930	GCG	2	6	161786	161791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379711902
4065	NC_016930	GTT	2	6	161806	161811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711902
4066	NC_016930	GAT	2	6	161830	161835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711902
4067	NC_016930	GTC	2	6	161845	161850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711902
4068	NC_016930	A	6	6	161890	161895	100 %	0 %	0 %	0 %	379711902
4069	NC_016930	ATT	2	6	161996	162001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711902
4070	NC_016930	T	6	6	162029	162034	0 %	100 %	0 %	0 %	379711902
4071	NC_016930	TTC	3	9	162057	162065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711902
4072	NC_016930	TATCA	2	10	162076	162085	40 %	40 %	0 %	20 %	379711902
4073	NC_016930	ATA	2	6	162139	162144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711902
4074	NC_016930	TAGCT	2	10	162163	162172	20 %	40 %	20 %	20 %	379711902
4075	NC_016930	TTG	2	6	162195	162200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711902
4076	NC_016930	TTC	2	6	162205	162210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711902
4077	NC_016930	ATC	2	6	162259	162264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711902
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4079	NC_016930	TATAT	2	10	162390	162399	40 %	60 %	0 %	0 %	379711903
4080	NC_016930	TCC	2	6	162414	162419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379711903
4081	NC_016930	TAT	2	6	162422	162427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711903
4082	NC_016930	ATT	2	6	162454	162459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711903
4083	NC_016930	T	6	6	162524	162529	0 %	100 %	0 %	0 %	379711903
4084	NC_016930	GTG	2	6	162530	162535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711903
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4088	NC_016930	ATA	2	6	162653	162658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711903
4089	NC_016930	AAT	2	6	162696	162701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711903
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4091	NC_016930	TAT	2	6	162765	162770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711903
4092	NC_016930	AT	3	6	162809	162814	50 %	50 %	0 %	0 %	379711903
4093	NC_016930	CTA	2	6	162845	162850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711903
4094	NC_016930	CTG	2	6	162879	162884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711903
4095	NC_016930	CTA	2	6	162935	162940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711903
4096	NC_016930	T	8	8	162947	162954	0 %	100 %	0 %	0 %	379711903
4097	NC_016930	T	6	6	162987	162992	0 %	100 %	0 %	0 %	379711903
4098	NC_016930	TTATT	2	10	163025	163034	20 %	80 %	0 %	0 %	379711903
4099	NC_016930	TTC	2	6	163080	163085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711903
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4102	NC_016930	A	6	6	163171	163176	100 %	0 %	0 %	0 %	379711903
4103	NC_016930	TA	3	6	163288	163293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016930	AT	4	8	163299	163306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016930	ATA	2	6	163326	163331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016930	TAA	2	6	163353	163358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711904
4107	NC_016930	A	6	6	163357	163362	100 %	0 %	0 %	0 %	379711904
4108	NC_016930	A	7	7	163377	163383	100 %	0 %	0 %	0 %	379711904
4109	NC_016930	AGA	2	6	163413	163418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711904
4110	NC_016930	AATTT	2	10	163448	163457	40 %	60 %	0 %	0 %	379711904
4111	NC_016930	TCAATT	2	12	163461	163472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379711904
4112	NC_016930	AAT	2	6	163497	163502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711904
4113	NC_016930	GTT	3	9	163507	163515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711904
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4115	NC_016930	TAA	2	6	163580	163585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711904
4116	NC_016930	ATA	2	6	163654	163659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711904
4117	NC_016930	CT	3	6	163713	163718	0 %	50 %	0 %	50 %	379711904
4118	NC_016930	ATA	2	6	163733	163738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711904
4119	NC_016930	TGA	2	6	163776	163781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711904
4120	NC_016930	TAA	2	6	163821	163826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711904
4121	NC_016930	ATTTT	2	10	163835	163844	20 %	80 %	0 %	0 %	379711904
4122	NC_016930	TAT	2	6	163931	163936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711904
4123	NC_016930	AGA	2	6	163982	163987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711904
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4125	NC_016930	AGCCG	2	10	164040	164049	20 %	0 %	40 %	40 %	379711904
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4253	NC_016930	GTA	2	6	168751	168756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711910
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4499	NC_016930	AGT	2	6	178406	178411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711921
4500	NC_016930	GCT	2	6	178419	178424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711921

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