MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 30171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016929	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022405
2	NC_016929	TTC	2	6	33	38	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022405
3	NC_016929	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022405
4	NC_016929	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	379022405
5	NC_016929	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022405
6	NC_016929	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022405
7	NC_016929	TGG	2	6	572	577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022405
8	NC_016929	TAATA	2	10	672	681	60 %	40 %	0 %	0 %	379022405
9	NC_016929	CTA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022405
10	NC_016929	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022405
11	NC_016929	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022405
12	NC_016929	TA	3	6	786	791	50 %	50 %	0 %	0 %	379022405
13	NC_016929	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	379022405
14	NC_016929	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022405
15	NC_016929	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016929	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016929	TGT	2	6	878	883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016929	A	6	6	897	902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016929	TGC	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016929	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016929	TAAATT	2	12	955	966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016929	AAT	2	6	1016	1021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016929	ATA	2	6	1179	1184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022406
24	NC_016929	AAAGTA	2	12	1212	1223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379022406
25	NC_016929	TGA	2	6	1238	1243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022406
26	NC_016929	GTA	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022406
27	NC_016929	AAT	2	6	1289	1294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022406
28	NC_016929	GCA	2	6	1337	1342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022406
29	NC_016929	A	6	6	1342	1347	100 %	0 %	0 %	0 %	379022406
30	NC_016929	ATTT	2	8	1384	1391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016929	T	9	9	1485	1493	0 %	100 %	0 %	0 %	379022407
32	NC_016929	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	379022407
33	NC_016929	TTTCTC	2	12	1505	1516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022407
34	NC_016929	ATA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022407
35	NC_016929	AT	3	6	1630	1635	50 %	50 %	0 %	0 %	379022407
36	NC_016929	GCA	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022407
37	NC_016929	TA	3	6	1748	1753	50 %	50 %	0 %	0 %	379022407
38	NC_016929	ATA	3	9	1751	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022407
39	NC_016929	A	6	6	1778	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	379022407
40	NC_016929	TGA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022407
41	NC_016929	GCA	2	6	1930	1935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022407
42	NC_016929	GAA	2	6	1974	1979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022407
43	NC_016929	AAT	2	6	2004	2009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022407
44	NC_016929	AAG	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022407
45	NC_016929	TTA	2	6	2059	2064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022407
46	NC_016929	CTT	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022407
47	NC_016929	TGT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016929	TCC	3	9	2227	2235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_016929	TTA	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016929	T	8	8	2306	2313	0 %	100 %	0 %	0 %	379022408
51	NC_016929	A	6	6	2316	2321	100 %	0 %	0 %	0 %	379022408
52	NC_016929	GGCA	2	8	2326	2333	25 %	0 %	50 %	25 %	379022408
53	NC_016929	ATT	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022408
54	NC_016929	T	6	6	2381	2386	0 %	100 %	0 %	0 %	379022408
55	NC_016929	T	6	6	2441	2446	0 %	100 %	0 %	0 %	379022408
56	NC_016929	T	6	6	2450	2455	0 %	100 %	0 %	0 %	379022408
57	NC_016929	AGC	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022408
58	NC_016929	ATA	2	6	2571	2576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022408
59	NC_016929	A	6	6	2576	2581	100 %	0 %	0 %	0 %	379022408
60	NC_016929	T	7	7	2600	2606	0 %	100 %	0 %	0 %	379022408
61	NC_016929	TA	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	379022408
62	NC_016929	TTTTA	2	10	2672	2681	20 %	80 %	0 %	0 %	379022408
63	NC_016929	ATA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022408
64	NC_016929	TAA	2	6	2740	2745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022408
65	NC_016929	TG	3	6	2748	2753	0 %	50 %	50 %	0 %	379022408
66	NC_016929	TTAT	2	8	2833	2840	25 %	75 %	0 %	0 %	379022408
67	NC_016929	AT	3	6	2892	2897	50 %	50 %	0 %	0 %	379022408
68	NC_016929	ATG	2	6	2970	2975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022408
69	NC_016929	TTATT	2	10	3023	3032	20 %	80 %	0 %	0 %	379022408
70	NC_016929	TTAT	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	379022408
71	NC_016929	A	6	6	3119	3124	100 %	0 %	0 %	0 %	379022409
72	NC_016929	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
73	NC_016929	TAT	2	6	3211	3216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
74	NC_016929	ATT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
75	NC_016929	GAT	2	6	3263	3268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
76	NC_016929	T	6	6	3268	3273	0 %	100 %	0 %	0 %	379022409
77	NC_016929	AAG	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
78	NC_016929	ATT	2	6	3338	3343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
79	NC_016929	A	7	7	3382	3388	100 %	0 %	0 %	0 %	379022409
80	NC_016929	A	6	6	3399	3404	100 %	0 %	0 %	0 %	379022409
81	NC_016929	A	6	6	3406	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	379022409
82	NC_016929	AT	3	6	3428	3433	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
83	NC_016929	AAT	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
84	NC_016929	CAA	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022409
85	NC_016929	AG	3	6	3514	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
86	NC_016929	AGA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
87	NC_016929	AGC	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022409
88	NC_016929	A	7	7	3710	3716	100 %	0 %	0 %	0 %	379022409
89	NC_016929	AAC	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022409
90	NC_016929	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
91	NC_016929	CCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022409
92	NC_016929	A	9	9	3888	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	379022409
93	NC_016929	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	379022409
94	NC_016929	A	6	6	3957	3962	100 %	0 %	0 %	0 %	379022409
95	NC_016929	TAT	2	6	4015	4020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
96	NC_016929	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022409
97	NC_016929	TG	3	6	4073	4078	0 %	50 %	50 %	0 %	379022409
98	NC_016929	GAA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
99	NC_016929	AT	3	6	4175	4180	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
100	NC_016929	CTA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022409
101	NC_016929	CTA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022409
102	NC_016929	GGTCA	2	10	4305	4314	20 %	20 %	40 %	20 %	379022409
103	NC_016929	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	379022409
104	NC_016929	TAA	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
105	NC_016929	AT	3	6	4485	4490	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
106	NC_016929	AG	3	6	4504	4509	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
107	NC_016929	TTTAG	2	10	4574	4583	20 %	60 %	20 %	0 %	379022409
108	NC_016929	T	6	6	4678	4683	0 %	100 %	0 %	0 %	379022409
109	NC_016929	GGA	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022409
110	NC_016929	AGG	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022409
111	NC_016929	AG	3	6	4825	4830	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
112	NC_016929	T	6	6	4832	4837	0 %	100 %	0 %	0 %	379022409
113	NC_016929	TA	3	6	4877	4882	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
114	NC_016929	GGA	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022409
115	NC_016929	GAA	2	6	4919	4924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
116	NC_016929	ATT	2	6	4942	4947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
117	NC_016929	AAG	2	6	4950	4955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
118	NC_016929	GAA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
119	NC_016929	TAA	2	6	4987	4992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
120	NC_016929	TGG	2	6	4996	5001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022409
121	NC_016929	TAT	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
122	NC_016929	AT	3	6	5069	5074	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
123	NC_016929	ATC	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022409
124	NC_016929	ATCCAG	2	12	5192	5203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379022409
125	NC_016929	GAT	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
126	NC_016929	AATA	2	8	5324	5331	75 %	25 %	0 %	0 %	379022409
127	NC_016929	GTT	2	6	5372	5377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022409
128	NC_016929	AAGG	2	8	5396	5403	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
129	NC_016929	ATA	2	6	5433	5438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
130	NC_016929	ATT	2	6	5484	5489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
131	NC_016929	CAG	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022409
132	NC_016929	ATAAA	2	10	5508	5517	80 %	20 %	0 %	0 %	379022409
133	NC_016929	GAT	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
134	NC_016929	TCAC	2	8	5551	5558	25 %	25 %	0 %	50 %	379022409
135	NC_016929	TGC	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022409
136	NC_016929	ATT	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
137	NC_016929	TGC	2	6	5620	5625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022409
138	NC_016929	CTA	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022409
139	NC_016929	AGT	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
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405	NC_016929	A	7	7	15822	15828	100 %	0 %	0 %	0 %	379022418
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