MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 30171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016929	TAT	2	6	18938	18943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022418
502	NC_016929	AAC	2	6	18954	18959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022418
503	NC_016929	A	6	6	19003	19008	100 %	0 %	0 %	0 %	379022418
504	NC_016929	TAC	2	6	19009	19014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022418
505	NC_016929	ATT	2	6	19032	19037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022418
506	NC_016929	TAAA	2	8	19041	19048	75 %	25 %	0 %	0 %	379022418
507	NC_016929	TCA	2	6	19060	19065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022418
508	NC_016929	TA	3	6	19126	19131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016929	ACC	2	6	19237	19242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_016929	ATT	2	6	19311	19316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016929	TAA	2	6	19321	19326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016929	TTA	2	6	19327	19332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016929	AAT	2	6	19337	19342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016929	A	7	7	19375	19381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016929	ATA	2	6	19395	19400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016929	TAA	2	6	19409	19414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016929	A	6	6	19428	19433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016929	TAA	2	6	19478	19483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016929	T	7	7	19518	19524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016929	ATCT	2	8	19558	19565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_016929	ATT	2	6	19633	19638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016929	AAC	2	6	19751	19756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016929	TTAT	2	8	19757	19764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016929	ATT	2	6	19817	19822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016929	ATAA	3	12	19857	19868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016929	CTA	2	6	19897	19902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016929	ACTT	2	8	19916	19923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_016929	GTG	2	6	20175	20180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016929	A	7	7	20238	20244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016929	ATA	2	6	20248	20253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016929	AAG	2	6	20304	20309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016929	CTA	2	6	20319	20324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_016929	ATA	2	6	20327	20332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016929	AGT	2	6	20342	20347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016929	TA	3	6	20430	20435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016929	CCT	2	6	20456	20461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_016929	TTA	2	6	20478	20483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016929	TAA	2	6	20530	20535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016929	AGA	2	6	20591	20596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016929	GAA	2	6	20600	20605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016929	TTA	2	6	20617	20622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016929	GAA	2	6	20701	20706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016929	ATA	2	6	20710	20715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016929	ATT	2	6	20778	20783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016929	ATC	2	6	20803	20808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016929	TA	3	6	20809	20814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016929	TAA	2	6	20829	20834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016929	AT	3	6	20838	20843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016929	AAT	2	6	20863	20868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016929	TAC	2	6	20869	20874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016929	ATA	2	6	20880	20885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016929	TGA	2	6	20893	20898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016929	AAT	2	6	20941	20946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016929	AT	3	6	20945	20950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016929	GA	3	6	20952	20957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016929	TAA	2	6	20980	20985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016929	ATT	2	6	21043	21048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016929	T	6	6	21094	21099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016929	T	8	8	21108	21115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016929	ATT	2	6	21122	21127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016929	AAT	2	6	21146	21151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016929	GAA	2	6	21217	21222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016929	A	6	6	21238	21243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016929	ATA	2	6	21306	21311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016929	AAG	2	6	21315	21320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016929	TAA	2	6	21350	21355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016929	TTA	2	6	21362	21367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016929	ATT	2	6	21394	21399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016929	AAT	2	6	21448	21453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016929	TAT	2	6	21470	21475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016929	A	7	7	21524	21530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016929	TGT	2	6	21546	21551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016929	AGT	2	6	21565	21570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016929	TGT	2	6	21681	21686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016929	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016929	ACA	2	6	21774	21779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_016929	ATG	2	6	21844	21849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016929	AAT	2	6	21861	21866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016929	TAG	2	6	21874	21879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016929	ATT	2	6	21904	21909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022420
581	NC_016929	CT	3	6	21953	21958	0 %	50 %	0 %	50 %	379022420
582	NC_016929	TCA	2	6	22004	22009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022420
583	NC_016929	AATT	2	8	22057	22064	50 %	50 %	0 %	0 %	379022420
584	NC_016929	T	6	6	22078	22083	0 %	100 %	0 %	0 %	379022420
585	NC_016929	TTC	2	6	22096	22101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022420
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587	NC_016929	T	8	8	22128	22135	0 %	100 %	0 %	0 %	379022420
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589	NC_016929	CGTT	2	8	22197	22204	0 %	50 %	25 %	25 %	379022420
590	NC_016929	TCT	2	6	22226	22231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022420
591	NC_016929	T	7	7	22303	22309	0 %	100 %	0 %	0 %	379022420
592	NC_016929	TAAAT	2	10	22319	22328	60 %	40 %	0 %	0 %	379022420
593	NC_016929	ATT	2	6	22382	22387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022420
594	NC_016929	T	8	8	22391	22398	0 %	100 %	0 %	0 %	379022421
595	NC_016929	AAT	2	6	22437	22442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022421
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598	NC_016929	TTTA	2	8	22521	22528	25 %	75 %	0 %	0 %	379022421
599	NC_016929	T	6	6	22534	22539	0 %	100 %	0 %	0 %	379022421
600	NC_016929	T	8	8	22558	22565	0 %	100 %	0 %	0 %	379022421
601	NC_016929	T	7	7	22602	22608	0 %	100 %	0 %	0 %	379022421
602	NC_016929	CTAT	2	8	22612	22619	25 %	50 %	0 %	25 %	379022421
603	NC_016929	T	6	6	22631	22636	0 %	100 %	0 %	0 %	379022421
604	NC_016929	ATTT	2	8	22655	22662	25 %	75 %	0 %	0 %	379022421
605	NC_016929	TGTC	2	8	22719	22726	0 %	50 %	25 %	25 %	379022421
606	NC_016929	TTA	2	6	22729	22734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022421
607	NC_016929	TTC	2	6	22740	22745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022421
608	NC_016929	TAAA	2	8	22768	22775	75 %	25 %	0 %	0 %	379022421
609	NC_016929	A	6	6	22808	22813	100 %	0 %	0 %	0 %	379022421
610	NC_016929	AAT	2	6	22820	22825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022421
611	NC_016929	A	6	6	22873	22878	100 %	0 %	0 %	0 %	379022422
612	NC_016929	A	6	6	22903	22908	100 %	0 %	0 %	0 %	379022422
613	NC_016929	CTGCAG	2	12	22963	22974	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379022422
614	NC_016929	AG	3	6	22998	23003	50 %	0 %	50 %	0 %	379022422
615	NC_016929	AT	3	6	23008	23013	50 %	50 %	0 %	0 %	379022422
616	NC_016929	CATA	2	8	23035	23042	50 %	25 %	0 %	25 %	379022422
617	NC_016929	TTAA	2	8	23107	23114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016929	CTT	2	6	23127	23132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016929	AG	3	6	23146	23151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016929	AAG	2	6	23259	23264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016929	CAT	2	6	23283	23288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022423
622	NC_016929	ATAC	2	8	23293	23300	50 %	25 %	0 %	25 %	379022423
623	NC_016929	TAA	2	6	23434	23439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022423
624	NC_016929	CAT	2	6	23452	23457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022423
625	NC_016929	AGC	2	6	23461	23466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022423
626	NC_016929	A	6	6	23573	23578	100 %	0 %	0 %	0 %	379022423
627	NC_016929	ATA	2	6	23651	23656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022423
628	NC_016929	ATAA	2	8	23717	23724	75 %	25 %	0 %	0 %	379022423
629	NC_016929	A	6	6	23728	23733	100 %	0 %	0 %	0 %	379022423
630	NC_016929	ACTT	2	8	23812	23819	25 %	50 %	0 %	25 %	379022423
631	NC_016929	T	6	6	23956	23961	0 %	100 %	0 %	0 %	379022423
632	NC_016929	TAT	2	6	24007	24012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022424
633	NC_016929	TAT	2	6	24053	24058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022424
634	NC_016929	AATAA	2	10	24088	24097	80 %	20 %	0 %	0 %	379022424
635	NC_016929	TGAA	2	8	24163	24170	50 %	25 %	25 %	0 %	379022424
636	NC_016929	ATCCAC	2	12	24257	24268	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379022424
637	NC_016929	CGT	2	6	24301	24306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_016929	CTT	2	6	24371	24376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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