MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_016915	A	7	7	1219404	1219410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31002	NC_016915	ATA	2	6	1219422	1219427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31003	NC_016915	AAT	2	6	1219447	1219452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019753
31004	NC_016915	TAA	2	6	1219531	1219536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019753
31005	NC_016915	A	6	6	1219562	1219567	100 %	0 %	0 %	0 %	379019753
31006	NC_016915	TAAAT	2	10	1219677	1219686	60 %	40 %	0 %	0 %	379019754
31007	NC_016915	CGC	2	6	1219703	1219708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379019754
31008	NC_016915	TAC	2	6	1219727	1219732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019754
31009	NC_016915	TAAA	2	8	1219742	1219749	75 %	25 %	0 %	0 %	379019754
31010	NC_016915	TTA	2	6	1219766	1219771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31011	NC_016915	TGA	2	6	1219776	1219781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019754
31012	NC_016915	TA	3	6	1219853	1219858	50 %	50 %	0 %	0 %	379019754
31013	NC_016915	TAA	2	6	1219899	1219904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019754
31014	NC_016915	AAG	2	6	1219920	1219925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019754
31015	NC_016915	TGG	2	6	1219940	1219945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019754
31016	NC_016915	TGT	2	6	1219947	1219952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019754
31017	NC_016915	A	8	8	1219988	1219995	100 %	0 %	0 %	0 %	379019754
31018	NC_016915	TAT	2	6	1220102	1220107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31019	NC_016915	ATT	2	6	1220212	1220217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31020	NC_016915	AT	3	6	1220280	1220285	50 %	50 %	0 %	0 %	379019754
31021	NC_016915	CAAT	2	8	1220321	1220328	50 %	25 %	0 %	25 %	379019754
31022	NC_016915	GAA	2	6	1220455	1220460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019754
31023	NC_016915	ATT	2	6	1220541	1220546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31024	NC_016915	TTA	2	6	1220617	1220622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31025	NC_016915	ATTT	2	8	1220642	1220649	25 %	75 %	0 %	0 %	379019754
31026	NC_016915	T	6	6	1220829	1220834	0 %	100 %	0 %	0 %	379019754
31027	NC_016915	ATT	2	6	1220835	1220840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31028	NC_016915	TAA	2	6	1220844	1220849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019754
31029	NC_016915	TATTT	2	10	1220901	1220910	20 %	80 %	0 %	0 %	379019754
31030	NC_016915	A	6	6	1220925	1220930	100 %	0 %	0 %	0 %	379019754
31031	NC_016915	A	7	7	1220936	1220942	100 %	0 %	0 %	0 %	379019754
31032	NC_016915	ATT	2	6	1221032	1221037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31033	NC_016915	ACA	2	6	1221060	1221065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019754
31034	NC_016915	TAAA	2	8	1221086	1221093	75 %	25 %	0 %	0 %	379019754
31035	NC_016915	ATT	2	6	1221098	1221103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31036	NC_016915	ATC	2	6	1221137	1221142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019754
31037	NC_016915	TAT	2	6	1221177	1221182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019754
31038	NC_016915	CAT	2	6	1221262	1221267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019755
31039	NC_016915	GCA	2	6	1221273	1221278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019755
31040	NC_016915	ATTGCT	2	12	1221374	1221385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019755
31041	NC_016915	CAG	2	6	1221541	1221546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019755
31042	NC_016915	TAG	2	6	1221568	1221573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019755
31043	NC_016915	GTT	2	6	1221582	1221587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019755
31044	NC_016915	TAAAA	2	10	1221641	1221650	80 %	20 %	0 %	0 %	379019755
31045	NC_016915	CTG	2	6	1221814	1221819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019755
31046	NC_016915	ATC	2	6	1221911	1221916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019755
31047	NC_016915	TGCT	2	8	1221935	1221942	0 %	50 %	25 %	25 %	379019755
31048	NC_016915	GGA	2	6	1221947	1221952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379019755
31049	NC_016915	ATT	2	6	1222019	1222024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019755
31050	NC_016915	AAC	2	6	1222067	1222072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019755
31051	NC_016915	AAT	2	6	1222142	1222147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019756
31052	NC_016915	TAA	2	6	1222162	1222167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019756
31053	NC_016915	A	6	6	1222222	1222227	100 %	0 %	0 %	0 %	379019756
31054	NC_016915	ATA	2	6	1222254	1222259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019756
31055	NC_016915	CTAT	2	8	1222295	1222302	25 %	50 %	0 %	25 %	379019756
31056	NC_016915	T	6	6	1222317	1222322	0 %	100 %	0 %	0 %	379019756
31057	NC_016915	AAT	2	6	1222334	1222339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019756
31058	NC_016915	TAA	2	6	1222432	1222437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019756
31059	NC_016915	TTGC	2	8	1222438	1222445	0 %	50 %	25 %	25 %	379019756
31060	NC_016915	TCT	2	6	1222451	1222456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019756
31061	NC_016915	TCA	2	6	1222475	1222480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019756
31062	NC_016915	CTA	2	6	1222497	1222502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019756
31063	NC_016915	ATTA	2	8	1222522	1222529	50 %	50 %	0 %	0 %	379019756
31064	NC_016915	A	7	7	1222576	1222582	100 %	0 %	0 %	0 %	379019756
31065	NC_016915	ATT	2	6	1222586	1222591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019756
31066	NC_016915	TA	3	6	1222620	1222625	50 %	50 %	0 %	0 %	379019756
31067	NC_016915	ATTA	2	8	1222639	1222646	50 %	50 %	0 %	0 %	379019756
31068	NC_016915	ATTT	2	8	1222668	1222675	25 %	75 %	0 %	0 %	379019756
31069	NC_016915	TAT	2	6	1222681	1222686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019756
31070	NC_016915	TTA	2	6	1222689	1222694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019756
31071	NC_016915	ATC	2	6	1222757	1222762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019756
31072	NC_016915	CTA	2	6	1222767	1222772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019756
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31077	NC_016915	T	6	6	1223046	1223051	0 %	100 %	0 %	0 %	379019756
31078	NC_016915	GAA	2	6	1223300	1223305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019756
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31086	NC_016915	T	6	6	1223548	1223553	0 %	100 %	0 %	0 %	379019756
31087	NC_016915	ATT	2	6	1223584	1223589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019756
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31089	NC_016915	TATT	2	8	1223711	1223718	25 %	75 %	0 %	0 %	379019756
31090	NC_016915	TAA	2	6	1223730	1223735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019756
31091	NC_016915	CTTC	2	8	1223762	1223769	0 %	50 %	0 %	50 %	379019756
31092	NC_016915	T	7	7	1223772	1223778	0 %	100 %	0 %	0 %	379019756
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31094	NC_016915	TAAT	2	8	1223805	1223812	50 %	50 %	0 %	0 %	379019756
31095	NC_016915	TAG	2	6	1223814	1223819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019756
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31099	NC_016915	T	7	7	1224047	1224053	0 %	100 %	0 %	0 %	379019756
31100	NC_016915	TTC	2	6	1224070	1224075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019756
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31106	NC_016915	CT	3	6	1224432	1224437	0 %	50 %	0 %	50 %	379019757
31107	NC_016915	TCA	2	6	1224442	1224447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019757
31108	NC_016915	AT	3	6	1224457	1224462	50 %	50 %	0 %	0 %	379019757
31109	NC_016915	AAGC	2	8	1224464	1224471	50 %	0 %	25 %	25 %	379019757
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31480	NC_016915	T	8	8	1237936	1237943	0 %	100 %	0 %	0 %	379019767
31481	NC_016915	T	6	6	1237988	1237993	0 %	100 %	0 %	0 %	379019767
31482	NC_016915	CCCCT	2	10	1238034	1238043	0 %	20 %	0 %	80 %	379019767
31483	NC_016915	TA	3	6	1238120	1238125	50 %	50 %	0 %	0 %	379019767
31484	NC_016915	A	6	6	1238196	1238201	100 %	0 %	0 %	0 %	379019767
31485	NC_016915	TAT	2	6	1238213	1238218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019767
31486	NC_016915	TTC	2	6	1238256	1238261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019767
31487	NC_016915	TTC	2	6	1238361	1238366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019767
31488	NC_016915	TTCT	2	8	1238373	1238380	0 %	75 %	0 %	25 %	379019767
31489	NC_016915	GCT	2	6	1238491	1238496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019767
31490	NC_016915	TTACTA	2	12	1238524	1238535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019767
31491	NC_016915	TAA	2	6	1238808	1238813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019768
31492	NC_016915	TAA	2	6	1238817	1238822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019768
31493	NC_016915	TAT	2	6	1238829	1238834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019768
31494	NC_016915	AAT	2	6	1238968	1238973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019768
31495	NC_016915	AGA	2	6	1239014	1239019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019768
31496	NC_016915	A	6	6	1239029	1239034	100 %	0 %	0 %	0 %	379019768
31497	NC_016915	ATC	2	6	1239038	1239043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019768
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31499	NC_016915	TTC	2	6	1239082	1239087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019768
31500	NC_016915	A	7	7	1239105	1239111	100 %	0 %	0 %	0 %	379019768

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