MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_016915	ATTTAA	2	12	1182290	1182301	50 %	50 %	0 %	0 %	379019714
30003	NC_016915	TGCATT	2	12	1182353	1182364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019714
30004	NC_016915	GCA	2	6	1182384	1182389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30005	NC_016915	GTA	2	6	1182405	1182410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019714
30006	NC_016915	TAA	2	6	1182415	1182420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019714
30007	NC_016915	ATTTAA	2	12	1182515	1182526	50 %	50 %	0 %	0 %	379019714
30008	NC_016915	TGCATT	2	12	1182578	1182589	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019714
30009	NC_016915	GCA	2	6	1182609	1182614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30010	NC_016915	GTA	2	6	1182630	1182635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019714
30011	NC_016915	TAA	2	6	1182640	1182645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019714
30012	NC_016915	ATT	2	6	1182755	1182760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019714
30013	NC_016915	TAT	2	6	1182772	1182777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019714
30014	NC_016915	CAC	2	6	1182791	1182796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019714
30015	NC_016915	CTG	2	6	1182817	1182822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30016	NC_016915	GCA	2	6	1182825	1182830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30017	NC_016915	GTA	2	6	1182846	1182851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019714
30018	NC_016915	TAA	2	6	1182856	1182861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019714
30019	NC_016915	ATTTAA	2	12	1182956	1182967	50 %	50 %	0 %	0 %	379019714
30020	NC_016915	TGCATT	2	12	1183019	1183030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019714
30021	NC_016915	GCA	2	6	1183050	1183055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30022	NC_016915	GTA	2	6	1183071	1183076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019714
30023	NC_016915	TAA	2	6	1183081	1183086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019714
30024	NC_016915	ATT	2	6	1183196	1183201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019714
30025	NC_016915	TAT	2	6	1183213	1183218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019714
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30027	NC_016915	CTG	2	6	1183258	1183263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30028	NC_016915	GCA	2	6	1183266	1183271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019714
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30030	NC_016915	TAA	2	6	1183297	1183302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019714
30031	NC_016915	ATTTAA	2	12	1183397	1183408	50 %	50 %	0 %	0 %	379019714
30032	NC_016915	TGCATT	2	12	1183460	1183471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019714
30033	NC_016915	GCA	2	6	1183491	1183496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30034	NC_016915	GTA	2	6	1183512	1183517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019714
30035	NC_016915	TAA	2	6	1183522	1183527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019714
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30037	NC_016915	TAT	2	6	1183654	1183659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019714
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30040	NC_016915	CTTGTA	2	12	1183750	1183761	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019714
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30042	NC_016915	TAT	2	6	1183870	1183875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019714
30043	NC_016915	CAC	2	6	1183889	1183894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019714
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30047	NC_016915	TAA	2	6	1183954	1183959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019714
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30050	NC_016915	GCA	2	6	1184148	1184153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30051	NC_016915	GTA	2	6	1184169	1184174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019714
30052	NC_016915	TAA	2	6	1184179	1184184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019714
30053	NC_016915	GCA	2	6	1184265	1184270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019714
30054	NC_016915	TTA	2	6	1184284	1184289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019714
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30067	NC_016915	TGC	2	6	1184732	1184737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019714
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30075	NC_016915	TAT	2	6	1184950	1184955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30081	NC_016915	TAA	2	6	1185151	1185156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30082	NC_016915	CAT	3	9	1185157	1185165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30084	NC_016915	AAT	2	6	1185198	1185203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30085	NC_016915	TAAT	2	8	1185270	1185277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30086	NC_016915	GT	3	6	1185285	1185290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30087	NC_016915	TTC	2	6	1185311	1185316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30088	NC_016915	ATG	2	6	1185338	1185343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30089	NC_016915	TA	3	6	1185394	1185399	50 %	50 %	0 %	0 %	379019716
30090	NC_016915	CTA	2	6	1185410	1185415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019716
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30092	NC_016915	AT	3	6	1185495	1185500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30093	NC_016915	T	6	6	1185575	1185580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30096	NC_016915	AAT	2	6	1185676	1185681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019717
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30101	NC_016915	TCA	2	6	1185850	1185855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019717
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30104	NC_016915	AT	3	6	1185919	1185924	50 %	50 %	0 %	0 %	379019717
30105	NC_016915	CT	4	8	1185935	1185942	0 %	50 %	0 %	50 %	379019717
30106	NC_016915	ATAA	2	8	1186024	1186031	75 %	25 %	0 %	0 %	379019717
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30108	NC_016915	ATA	3	9	1186183	1186191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019717
30109	NC_016915	TGCC	2	8	1186196	1186203	0 %	25 %	25 %	50 %	379019717
30110	NC_016915	TCA	2	6	1186279	1186284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019717
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30112	NC_016915	CAT	2	6	1186562	1186567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019717
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30480	NC_016915	ATTT	2	8	1199794	1199801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30481	NC_016915	ATA	2	6	1199815	1199820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30482	NC_016915	TCT	2	6	1199826	1199831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30483	NC_016915	CATA	2	8	1199861	1199868	50 %	25 %	0 %	25 %	379019733
30484	NC_016915	T	6	6	1199887	1199892	0 %	100 %	0 %	0 %	379019733
30485	NC_016915	CAAGC	2	10	1199903	1199912	40 %	0 %	20 %	40 %	379019733
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30488	NC_016915	ATC	2	6	1200063	1200068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019733
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30490	NC_016915	TAT	3	9	1200173	1200181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30491	NC_016915	T	6	6	1200214	1200219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30500	NC_016915	ATTT	2	8	1200433	1200440	25 %	75 %	0 %	0 %	379019734

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