MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_016915	TCA	2	6	1161432	1161437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019695
29503	NC_016915	ATT	2	6	1161457	1161462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019695
29504	NC_016915	TGA	2	6	1161469	1161474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019695
29505	NC_016915	AATG	2	8	1161475	1161482	50 %	25 %	25 %	0 %	379019695
29506	NC_016915	GAA	2	6	1161495	1161500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019695
29507	NC_016915	CGAC	2	8	1161506	1161513	25 %	0 %	25 %	50 %	379019695
29508	NC_016915	AATA	2	8	1161514	1161521	75 %	25 %	0 %	0 %	379019695
29509	NC_016915	GTAA	2	8	1161524	1161531	50 %	25 %	25 %	0 %	379019695
29510	NC_016915	GTA	2	6	1161642	1161647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019695
29511	NC_016915	TTGA	2	8	1161681	1161688	25 %	50 %	25 %	0 %	379019695
29512	NC_016915	ACC	2	6	1161742	1161747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019695
29513	NC_016915	TAA	2	6	1161753	1161758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019695
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29516	NC_016915	ATA	2	6	1161903	1161908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019695
29517	NC_016915	TAC	2	6	1161913	1161918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019695
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29519	NC_016915	TCT	2	6	1162114	1162119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019696
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29521	NC_016915	ATTA	2	8	1162155	1162162	50 %	50 %	0 %	0 %	379019696
29522	NC_016915	ATT	2	6	1162233	1162238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019696
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29524	NC_016915	ATATA	2	10	1162304	1162313	60 %	40 %	0 %	0 %	379019696
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29531	NC_016915	ATA	3	9	1162443	1162451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29532	NC_016915	ATT	2	6	1162455	1162460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29533	NC_016915	AATG	2	8	1162485	1162492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29534	NC_016915	TAA	2	6	1162505	1162510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29535	NC_016915	CTTTA	2	10	1162525	1162534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29536	NC_016915	A	7	7	1162538	1162544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29537	NC_016915	TAAT	2	8	1162548	1162555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29538	NC_016915	AAT	2	6	1162576	1162581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019697
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29543	NC_016915	A	6	6	1162741	1162746	100 %	0 %	0 %	0 %	379019697
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29545	NC_016915	A	6	6	1162769	1162774	100 %	0 %	0 %	0 %	379019697
29546	NC_016915	AAT	2	6	1162815	1162820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019697
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29548	NC_016915	TA	3	6	1162889	1162894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29549	NC_016915	GT	3	6	1162910	1162915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29550	NC_016915	T	6	6	1163010	1163015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29551	NC_016915	CTT	2	6	1163058	1163063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29552	NC_016915	TAG	2	6	1163099	1163104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29553	NC_016915	TAAT	2	8	1163181	1163188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29554	NC_016915	TAG	2	6	1163229	1163234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29555	NC_016915	CCG	2	6	1163250	1163255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29556	NC_016915	AAG	2	6	1163308	1163313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29557	NC_016915	TTTC	2	8	1163383	1163390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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29559	NC_016915	TTAT	2	8	1163541	1163548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29560	NC_016915	TA	3	6	1163554	1163559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29561	NC_016915	TA	3	6	1163565	1163570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29562	NC_016915	TAG	2	6	1163593	1163598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29571	NC_016915	TAT	2	6	1163944	1163949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29593	NC_016915	AGT	2	6	1164815	1164820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29594	NC_016915	TTA	2	6	1164823	1164828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29605	NC_016915	TAT	2	6	1165214	1165219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29606	NC_016915	TAT	2	6	1165277	1165282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29621	NC_016915	GTT	2	6	1165794	1165799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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