MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_016915	AT	3	6	1140300	1140305	50 %	50 %	0 %	0 %	379019674
29003	NC_016915	T	7	7	1140461	1140467	0 %	100 %	0 %	0 %	379019674
29004	NC_016915	TTAC	2	8	1140501	1140508	25 %	50 %	0 %	25 %	379019674
29005	NC_016915	AAG	2	6	1140520	1140525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019674
29006	NC_016915	TTTTA	2	10	1140704	1140713	20 %	80 %	0 %	0 %	379019675
29007	NC_016915	TCT	2	6	1140746	1140751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019675
29008	NC_016915	AT	3	6	1140755	1140760	50 %	50 %	0 %	0 %	379019675
29009	NC_016915	TA	3	6	1140784	1140789	50 %	50 %	0 %	0 %	379019675
29010	NC_016915	TAC	2	6	1140814	1140819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019675
29011	NC_016915	A	6	6	1140946	1140951	100 %	0 %	0 %	0 %	379019675
29012	NC_016915	ATATA	2	10	1140994	1141003	60 %	40 %	0 %	0 %	379019675
29013	NC_016915	TA	4	8	1141000	1141007	50 %	50 %	0 %	0 %	379019675
29014	NC_016915	GTT	2	6	1141095	1141100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29015	NC_016915	AGC	2	6	1141127	1141132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29016	NC_016915	ATA	2	6	1141159	1141164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29017	NC_016915	CT	3	6	1141246	1141251	0 %	50 %	0 %	50 %	379019676
29018	NC_016915	ATA	2	6	1141264	1141269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019676
29019	NC_016915	TA	3	6	1141281	1141286	50 %	50 %	0 %	0 %	379019676
29020	NC_016915	GTTT	2	8	1141345	1141352	0 %	75 %	25 %	0 %	379019676
29021	NC_016915	T	7	7	1141350	1141356	0 %	100 %	0 %	0 %	379019676
29022	NC_016915	GAT	2	6	1141373	1141378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019676
29023	NC_016915	TAT	2	6	1141451	1141456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019676
29024	NC_016915	CTA	2	6	1141490	1141495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019676
29025	NC_016915	TGC	2	6	1141566	1141571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019676
29026	NC_016915	CAT	2	6	1141628	1141633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019676
29027	NC_016915	TGC	2	6	1141669	1141674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019676
29028	NC_016915	T	6	6	1141729	1141734	0 %	100 %	0 %	0 %	379019676
29029	NC_016915	CAT	2	6	1141761	1141766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019676
29030	NC_016915	ATG	2	6	1141821	1141826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019676
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29032	NC_016915	TAC	2	6	1141865	1141870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019676
29033	NC_016915	GTA	2	6	1141891	1141896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019676
29034	NC_016915	TAT	2	6	1141946	1141951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019676
29035	NC_016915	TGC	2	6	1141955	1141960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019676
29036	NC_016915	ATT	2	6	1141983	1141988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019676
29037	NC_016915	AT	3	6	1142069	1142074	50 %	50 %	0 %	0 %	379019676
29038	NC_016915	AATT	2	8	1142102	1142109	50 %	50 %	0 %	0 %	379019676
29039	NC_016915	ATCT	2	8	1142127	1142134	25 %	50 %	0 %	25 %	379019676
29040	NC_016915	CTT	2	6	1142135	1142140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019676
29041	NC_016915	TAAA	2	8	1142160	1142167	75 %	25 %	0 %	0 %	379019676
29042	NC_016915	GCTT	2	8	1142256	1142263	0 %	50 %	25 %	25 %	379019676
29043	NC_016915	CAA	2	6	1142318	1142323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019676
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29045	NC_016915	CTA	2	6	1142405	1142410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019676
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29047	NC_016915	AAG	2	6	1142547	1142552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019676
29048	NC_016915	TGC	2	6	1142553	1142558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019676
29049	NC_016915	TGC	2	6	1142604	1142609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019676
29050	NC_016915	T	6	6	1142661	1142666	0 %	100 %	0 %	0 %	379019676
29051	NC_016915	CAT	2	6	1142726	1142731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019676
29052	NC_016915	CTA	2	6	1142870	1142875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019676
29053	NC_016915	T	6	6	1142888	1142893	0 %	100 %	0 %	0 %	379019676
29054	NC_016915	TAG	2	6	1142984	1142989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019676
29055	NC_016915	CTA	2	6	1143047	1143052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019676
29056	NC_016915	CTTT	2	8	1143053	1143060	0 %	75 %	0 %	25 %	379019676
29057	NC_016915	CCAA	2	8	1143213	1143220	50 %	0 %	0 %	50 %	379019676
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29059	NC_016915	TGA	2	6	1143334	1143339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019676
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29064	NC_016915	TGAA	2	8	1143452	1143459	50 %	25 %	25 %	0 %	379019676
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29070	NC_016915	GCTTT	2	10	1143693	1143702	0 %	60 %	20 %	20 %	379019676
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29073	NC_016915	TTTA	2	8	1143789	1143796	25 %	75 %	0 %	0 %	379019676
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29091	NC_016915	AAT	2	6	1144392	1144397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29092	NC_016915	TAC	2	6	1144408	1144413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29102	NC_016915	ATC	2	6	1144924	1144929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019678
29103	NC_016915	AT	3	6	1144939	1144944	50 %	50 %	0 %	0 %	379019678
29104	NC_016915	TAG	2	6	1144974	1144979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019678
29105	NC_016915	A	6	6	1145110	1145115	100 %	0 %	0 %	0 %	379019678
29106	NC_016915	TTCA	2	8	1145131	1145138	25 %	50 %	0 %	25 %	379019678
29107	NC_016915	CGG	2	6	1145197	1145202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019678
29108	NC_016915	TAA	2	6	1145259	1145264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019678
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29110	NC_016915	CCG	2	6	1145342	1145347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379019678
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29113	NC_016915	AT	3	6	1145481	1145486	50 %	50 %	0 %	0 %	379019678
29114	NC_016915	TA	4	8	1145526	1145533	50 %	50 %	0 %	0 %	379019678
29115	NC_016915	GAA	2	6	1145534	1145539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019678
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