MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_016915	GAA	2	6	1119913	1119918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019658
28502	NC_016915	AT	3	6	1119936	1119941	50 %	50 %	0 %	0 %	379019658
28503	NC_016915	A	8	8	1120029	1120036	100 %	0 %	0 %	0 %	379019658
28504	NC_016915	GAA	2	6	1120205	1120210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019658
28505	NC_016915	GGA	2	6	1120288	1120293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379019658
28506	NC_016915	A	6	6	1120298	1120303	100 %	0 %	0 %	0 %	379019658
28507	NC_016915	AAT	2	6	1120319	1120324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019658
28508	NC_016915	TTA	2	6	1120328	1120333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28509	NC_016915	GTT	3	9	1120356	1120364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28510	NC_016915	TTG	2	6	1120374	1120379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019659
28511	NC_016915	GCT	2	6	1120436	1120441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019659
28512	NC_016915	TA	3	6	1120484	1120489	50 %	50 %	0 %	0 %	379019659
28513	NC_016915	TTA	2	6	1120508	1120513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019659
28514	NC_016915	GAC	2	6	1120603	1120608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28515	NC_016915	AT	4	8	1120699	1120706	50 %	50 %	0 %	0 %	379019660
28516	NC_016915	TACTT	2	10	1120757	1120766	20 %	60 %	0 %	20 %	379019660
28517	NC_016915	TAC	2	6	1120783	1120788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019660
28518	NC_016915	ATA	2	6	1120831	1120836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28519	NC_016915	A	6	6	1120871	1120876	100 %	0 %	0 %	0 %	379019660
28520	NC_016915	TACA	2	8	1120909	1120916	50 %	25 %	0 %	25 %	379019660
28521	NC_016915	AAAAC	2	10	1120925	1120934	80 %	0 %	0 %	20 %	379019660
28522	NC_016915	A	6	6	1120956	1120961	100 %	0 %	0 %	0 %	379019660
28523	NC_016915	TTA	2	6	1120962	1120967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019660
28524	NC_016915	A	6	6	1120997	1121002	100 %	0 %	0 %	0 %	379019660
28525	NC_016915	TA	4	8	1121032	1121039	50 %	50 %	0 %	0 %	379019660
28526	NC_016915	TAA	2	6	1121089	1121094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28527	NC_016915	TAA	2	6	1121105	1121110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28528	NC_016915	ATTA	2	8	1121111	1121118	50 %	50 %	0 %	0 %	379019660
28529	NC_016915	ACT	2	6	1121134	1121139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019660
28530	NC_016915	TAA	2	6	1121174	1121179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28531	NC_016915	T	6	6	1121245	1121250	0 %	100 %	0 %	0 %	379019660
28532	NC_016915	TA	3	6	1121266	1121271	50 %	50 %	0 %	0 %	379019660
28533	NC_016915	TAA	3	9	1121288	1121296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28534	NC_016915	AGC	2	6	1121358	1121363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019660
28535	NC_016915	ATA	2	6	1121395	1121400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28536	NC_016915	CTAT	2	8	1121415	1121422	25 %	50 %	0 %	25 %	379019660
28537	NC_016915	TAA	3	9	1121485	1121493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28538	NC_016915	A	6	6	1121517	1121522	100 %	0 %	0 %	0 %	379019660
28539	NC_016915	TAA	2	6	1121603	1121608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28540	NC_016915	AGA	3	9	1121669	1121677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019660
28541	NC_016915	TAT	2	6	1121735	1121740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019660
28542	NC_016915	AGA	2	6	1121750	1121755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019660
28543	NC_016915	ATA	2	6	1121863	1121868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28544	NC_016915	TAT	2	6	1122016	1122021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019660
28545	NC_016915	CAA	2	6	1122058	1122063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019660
28546	NC_016915	TAA	3	9	1122077	1122085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28547	NC_016915	ACAA	2	8	1122136	1122143	75 %	0 %	0 %	25 %	379019660
28548	NC_016915	TAG	2	6	1122160	1122165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019660
28549	NC_016915	ATTT	2	8	1122188	1122195	25 %	75 %	0 %	0 %	379019660
28550	NC_016915	A	6	6	1122272	1122277	100 %	0 %	0 %	0 %	379019660
28551	NC_016915	GAAAAA	2	12	1122294	1122305	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379019660
28552	NC_016915	T	6	6	1122310	1122315	0 %	100 %	0 %	0 %	379019660
28553	NC_016915	AGA	2	6	1122332	1122337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019660
28554	NC_016915	AGG	2	6	1122343	1122348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379019660
28555	NC_016915	AGG	2	6	1122350	1122355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379019660
28556	NC_016915	GAA	2	6	1122390	1122395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019660
28557	NC_016915	ATT	2	6	1122410	1122415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019660
28558	NC_016915	ATC	2	6	1122422	1122427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019660
28559	NC_016915	GAA	2	6	1122438	1122443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019660
28560	NC_016915	TA	3	6	1122466	1122471	50 %	50 %	0 %	0 %	379019660
28561	NC_016915	TGA	2	6	1122479	1122484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019660
28562	NC_016915	GA	3	6	1122513	1122518	50 %	0 %	50 %	0 %	379019660
28563	NC_016915	TAA	3	9	1122536	1122544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28564	NC_016915	GCA	2	6	1122570	1122575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019660
28565	NC_016915	TGC	2	6	1122632	1122637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019660
28566	NC_016915	TAT	2	6	1122672	1122677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019660
28567	NC_016915	ATA	2	6	1122679	1122684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28568	NC_016915	TAA	2	6	1122698	1122703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019660
28569	NC_016915	TTTA	2	8	1122744	1122751	25 %	75 %	0 %	0 %	379019660
28570	NC_016915	TAAT	2	8	1122796	1122803	50 %	50 %	0 %	0 %	379019660
28571	NC_016915	ATT	2	6	1122810	1122815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019660
28572	NC_016915	AGA	2	6	1122836	1122841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019660
28573	NC_016915	AAGC	2	8	1122863	1122870	50 %	0 %	25 %	25 %	379019660
28574	NC_016915	AGG	2	6	1123003	1123008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379019660
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28578	NC_016915	TA	3	6	1123075	1123080	50 %	50 %	0 %	0 %	379019660
28579	NC_016915	TAT	2	6	1123126	1123131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28580	NC_016915	A	8	8	1123139	1123146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28582	NC_016915	TTA	2	6	1123193	1123198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28583	NC_016915	AAC	2	6	1123210	1123215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28584	NC_016915	A	7	7	1123241	1123247	100 %	0 %	0 %	0 %	379019661
28585	NC_016915	GAT	2	6	1123305	1123310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019661
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28588	NC_016915	AAT	2	6	1123458	1123463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019661
28589	NC_016915	TTA	2	6	1123473	1123478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019661
28590	NC_016915	T	6	6	1123508	1123513	0 %	100 %	0 %	0 %	379019661
28591	NC_016915	AGA	2	6	1123529	1123534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019661
28592	NC_016915	TAG	2	6	1123544	1123549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019661
28593	NC_016915	TTACT	2	10	1123550	1123559	20 %	60 %	0 %	20 %	379019661
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28595	NC_016915	GTA	2	6	1123644	1123649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019661
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28599	NC_016915	TCA	2	6	1123955	1123960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019661
28600	NC_016915	CTT	2	6	1124049	1124054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019661
28601	NC_016915	TCAA	2	8	1124093	1124100	50 %	25 %	0 %	25 %	379019661
28602	NC_016915	T	7	7	1124129	1124135	0 %	100 %	0 %	0 %	379019661
28603	NC_016915	TAA	3	9	1124143	1124151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019661
28604	NC_016915	ATT	2	6	1124154	1124159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019661
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28606	NC_016915	ATGT	2	8	1124290	1124297	25 %	50 %	25 %	0 %	379019661
28607	NC_016915	TCT	2	6	1124331	1124336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019661
28608	NC_016915	TAA	2	6	1124390	1124395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019661
28609	NC_016915	TTC	2	6	1124489	1124494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019661
28610	NC_016915	TTAA	2	8	1124532	1124539	50 %	50 %	0 %	0 %	379019661
28611	NC_016915	TAC	2	6	1124682	1124687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019661
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28614	NC_016915	GCT	2	6	1124991	1124996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019661
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28616	NC_016915	TTA	2	6	1125059	1125064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019661
28617	NC_016915	ACCTCC	2	12	1125158	1125169	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	379019661
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28980	NC_016915	CTA	2	6	1139374	1139379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019674
28981	NC_016915	ATC	2	6	1139382	1139387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019674
28982	NC_016915	TGC	2	6	1139396	1139401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019674
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28987	NC_016915	TAG	2	6	1139632	1139637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019674
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