MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_016915	TCA	2	6	1099448	1099453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28002	NC_016915	GTTT	2	8	1099495	1099502	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28003	NC_016915	AAT	2	6	1099575	1099580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28004	NC_016915	TAAA	2	8	1099593	1099600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28005	NC_016915	A	8	8	1099598	1099605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28006	NC_016915	AGT	2	6	1099611	1099616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28007	NC_016915	AAT	2	6	1099649	1099654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28008	NC_016915	GTG	2	6	1099659	1099664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019640
28009	NC_016915	CTT	2	6	1099700	1099705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019640
28010	NC_016915	CAT	2	6	1099716	1099721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019640
28011	NC_016915	T	6	6	1099791	1099796	0 %	100 %	0 %	0 %	379019640
28012	NC_016915	GCT	4	12	1099798	1099809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019640
28013	NC_016915	CTT	2	6	1099810	1099815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019640
28014	NC_016915	ACCTAA	2	12	1099818	1099829	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379019640
28015	NC_016915	TC	3	6	1099914	1099919	0 %	50 %	0 %	50 %	379019640
28016	NC_016915	CTT	2	6	1099925	1099930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019640
28017	NC_016915	TTC	2	6	1100016	1100021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019640
28018	NC_016915	TGT	2	6	1100061	1100066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019640
28019	NC_016915	CATA	2	8	1100082	1100089	50 %	25 %	0 %	25 %	379019640
28020	NC_016915	TTA	2	6	1100148	1100153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28021	NC_016915	ACTAA	2	10	1100183	1100192	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28022	NC_016915	TA	3	6	1100213	1100218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28023	NC_016915	ATT	2	6	1100221	1100226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28024	NC_016915	TTA	2	6	1100227	1100232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28025	NC_016915	TA	3	6	1100305	1100310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28026	NC_016915	ATAG	2	8	1100321	1100328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28027	NC_016915	TA	4	8	1100382	1100389	50 %	50 %	0 %	0 %	379019641
28028	NC_016915	AGT	2	6	1100414	1100419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019641
28029	NC_016915	AG	3	6	1100462	1100467	50 %	0 %	50 %	0 %	379019641
28030	NC_016915	TAG	3	9	1100556	1100564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019641
28031	NC_016915	TAA	2	6	1100581	1100586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019641
28032	NC_016915	AATG	2	8	1100607	1100614	50 %	25 %	25 %	0 %	379019641
28033	NC_016915	TAG	2	6	1100652	1100657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019642
28034	NC_016915	T	7	7	1100667	1100673	0 %	100 %	0 %	0 %	379019642
28035	NC_016915	AAGC	2	8	1100702	1100709	50 %	0 %	25 %	25 %	379019642
28036	NC_016915	AGC	2	6	1100718	1100723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019642
28037	NC_016915	ACT	2	6	1100755	1100760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019642
28038	NC_016915	TTTA	2	8	1100793	1100800	25 %	75 %	0 %	0 %	379019642
28039	NC_016915	TGA	2	6	1100818	1100823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019642
28040	NC_016915	AAT	2	6	1100831	1100836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019642
28041	NC_016915	TTG	2	6	1100886	1100891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019642
28042	NC_016915	T	6	6	1100894	1100899	0 %	100 %	0 %	0 %	379019642
28043	NC_016915	AAT	2	6	1100914	1100919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019642
28044	NC_016915	ACC	2	6	1100967	1100972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019642
28045	NC_016915	TCA	2	6	1100989	1100994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019642
28046	NC_016915	CTAT	2	8	1101022	1101029	25 %	50 %	0 %	25 %	379019642
28047	NC_016915	ATC	2	6	1101039	1101044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019642
28048	NC_016915	ACT	2	6	1101045	1101050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019642
28049	NC_016915	AGT	2	6	1101096	1101101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019642
28050	NC_016915	TAA	2	6	1101117	1101122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019642
28051	NC_016915	TGA	2	6	1101171	1101176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019642
28052	NC_016915	TAT	2	6	1101299	1101304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019642
28053	NC_016915	AGT	3	9	1101309	1101317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019642
28054	NC_016915	TAA	2	6	1101323	1101328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019642
28055	NC_016915	TGTTCT	2	12	1101444	1101455	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379019642
28056	NC_016915	TCA	2	6	1101493	1101498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019642
28057	NC_016915	ACTA	2	8	1101501	1101508	50 %	25 %	0 %	25 %	379019642
28058	NC_016915	GAAG	2	8	1101514	1101521	50 %	0 %	50 %	0 %	379019642
28059	NC_016915	CGC	2	6	1101527	1101532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379019642
28060	NC_016915	AAT	2	6	1101537	1101542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019642
28061	NC_016915	CTT	3	9	1101570	1101578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019643
28062	NC_016915	TAC	2	6	1101598	1101603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019643
28063	NC_016915	ATT	2	6	1101610	1101615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019643
28064	NC_016915	T	7	7	1101741	1101747	0 %	100 %	0 %	0 %	379019643
28065	NC_016915	ATT	2	6	1101761	1101766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019643
28066	NC_016915	CT	3	6	1101770	1101775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28067	NC_016915	TAT	2	6	1101818	1101823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28068	NC_016915	TAA	2	6	1101831	1101836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28069	NC_016915	ACAT	2	8	1101873	1101880	50 %	25 %	0 %	25 %	379019644
28070	NC_016915	T	7	7	1101897	1101903	0 %	100 %	0 %	0 %	379019644
28071	NC_016915	GAT	2	6	1101948	1101953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019644
28072	NC_016915	A	6	6	1101978	1101983	100 %	0 %	0 %	0 %	379019644
28073	NC_016915	TAAA	2	8	1101985	1101992	75 %	25 %	0 %	0 %	379019644
28074	NC_016915	CTA	2	6	1102021	1102026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019644
28075	NC_016915	TAT	2	6	1102056	1102061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019644
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28078	NC_016915	AGT	3	9	1102160	1102168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019644
28079	NC_016915	GAT	2	6	1102173	1102178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019644
28080	NC_016915	TCA	2	6	1102341	1102346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28081	NC_016915	AAC	2	6	1102421	1102426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28082	NC_016915	TTAC	2	8	1102451	1102458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28083	NC_016915	AACACC	2	12	1102500	1102511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28084	NC_016915	A	6	6	1102520	1102525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28085	NC_016915	TAA	2	6	1102582	1102587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019645
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28087	NC_016915	AGA	2	6	1102654	1102659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019645
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28090	NC_016915	GAA	2	6	1102709	1102714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019645
28091	NC_016915	ATAG	2	8	1102742	1102749	50 %	25 %	25 %	0 %	379019645
28092	NC_016915	AAG	2	6	1102761	1102766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019645
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28095	NC_016915	TGC	2	6	1102897	1102902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019645
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28103	NC_016915	GATG	2	8	1103137	1103144	25 %	25 %	50 %	0 %	379019645
28104	NC_016915	A	7	7	1103170	1103176	100 %	0 %	0 %	0 %	379019645
28105	NC_016915	ATG	2	6	1103262	1103267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019645
28106	NC_016915	CTA	2	6	1103268	1103273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019645
28107	NC_016915	AGT	2	6	1103335	1103340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019645
28108	NC_016915	ATTTA	2	10	1103347	1103356	40 %	60 %	0 %	0 %	379019645
28109	NC_016915	CAAC	2	8	1103407	1103414	50 %	0 %	0 %	50 %	379019645
28110	NC_016915	TAA	3	9	1103526	1103534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28111	NC_016915	TTAC	2	8	1103557	1103564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28112	NC_016915	AAAAT	2	10	1103594	1103603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28113	NC_016915	A	7	7	1103617	1103623	100 %	0 %	0 %	0 %	379019646
28114	NC_016915	ACGGAT	2	12	1103641	1103652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379019646
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28116	NC_016915	TGC	2	6	1103737	1103742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019646
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28240	NC_016915	TGA	2	6	1109072	1109077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019653
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28353	NC_016915	A	7	7	1114171	1114177	100 %	0 %	0 %	0 %	379019655
28354	NC_016915	AATTG	2	10	1114179	1114188	40 %	40 %	20 %	0 %	379019655
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28480	NC_016915	T	7	7	1118711	1118717	0 %	100 %	0 %	0 %	379019657
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