MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_016915	CTT	2	6	1022158	1022163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019550
26003	NC_016915	TAC	2	6	1022179	1022184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019550
26004	NC_016915	ATA	2	6	1022217	1022222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019550
26005	NC_016915	ATT	2	6	1022240	1022245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019550
26006	NC_016915	T	7	7	1022264	1022270	0 %	100 %	0 %	0 %	379019550
26007	NC_016915	T	6	6	1022420	1022425	0 %	100 %	0 %	0 %	379019550
26008	NC_016915	TCT	2	6	1022487	1022492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019550
26009	NC_016915	AGC	2	6	1022507	1022512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019550
26010	NC_016915	ACT	2	6	1022529	1022534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019550
26011	NC_016915	CCA	2	6	1022544	1022549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019550
26012	NC_016915	TC	3	6	1022631	1022636	0 %	50 %	0 %	50 %	379019550
26013	NC_016915	AGC	2	6	1022696	1022701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019550
26014	NC_016915	CTT	2	6	1022749	1022754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019550
26015	NC_016915	GAT	2	6	1022765	1022770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019550
26016	NC_016915	CTT	2	6	1022788	1022793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019550
26017	NC_016915	TAA	2	6	1022812	1022817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019550
26018	NC_016915	CTT	2	6	1022821	1022826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019550
26019	NC_016915	TTCT	2	8	1022847	1022854	0 %	75 %	0 %	25 %	379019550
26020	NC_016915	ACG	2	6	1022861	1022866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019550
26021	NC_016915	AAT	2	6	1022901	1022906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019550
26022	NC_016915	ATA	2	6	1022979	1022984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019550
26023	NC_016915	TTCTT	2	10	1022987	1022996	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26024	NC_016915	T	8	8	1023050	1023057	0 %	100 %	0 %	0 %	379019551
26025	NC_016915	GTAA	2	8	1023085	1023092	50 %	25 %	25 %	0 %	379019551
26026	NC_016915	TTTA	2	8	1023129	1023136	25 %	75 %	0 %	0 %	379019551
26027	NC_016915	TAT	2	6	1023182	1023187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019551
26028	NC_016915	TCACT	2	10	1023266	1023275	20 %	40 %	0 %	40 %	379019551
26029	NC_016915	AAT	2	6	1023281	1023286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019551
26030	NC_016915	T	7	7	1023288	1023294	0 %	100 %	0 %	0 %	379019551
26031	NC_016915	TTGT	2	8	1023304	1023311	0 %	75 %	25 %	0 %	379019551
26032	NC_016915	TTG	2	6	1023333	1023338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26033	NC_016915	ATT	2	6	1023405	1023410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26034	NC_016915	A	7	7	1023425	1023431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26035	NC_016915	T	6	6	1023436	1023441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26036	NC_016915	ACA	2	6	1023502	1023507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26037	NC_016915	CAA	2	6	1023511	1023516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26038	NC_016915	ATTA	2	8	1023545	1023552	50 %	50 %	0 %	0 %	379019552
26039	NC_016915	AGA	2	6	1023566	1023571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019552
26040	NC_016915	T	6	6	1023591	1023596	0 %	100 %	0 %	0 %	379019552
26041	NC_016915	T	7	7	1023648	1023654	0 %	100 %	0 %	0 %	379019552
26042	NC_016915	A	6	6	1023724	1023729	100 %	0 %	0 %	0 %	379019552
26043	NC_016915	ATA	2	6	1023816	1023821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019552
26044	NC_016915	CGA	2	6	1023876	1023881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26046	NC_016915	TTC	2	6	1023975	1023980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019553
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26049	NC_016915	T	6	6	1024046	1024051	0 %	100 %	0 %	0 %	379019553
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26051	NC_016915	T	6	6	1024071	1024076	0 %	100 %	0 %	0 %	379019553
26052	NC_016915	TTC	2	6	1024122	1024127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019553
26053	NC_016915	T	6	6	1024159	1024164	0 %	100 %	0 %	0 %	379019553
26054	NC_016915	TGT	2	6	1024335	1024340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019553
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26057	NC_016915	T	6	6	1024419	1024424	0 %	100 %	0 %	0 %	379019553
26058	NC_016915	ATT	2	6	1024439	1024444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26059	NC_016915	TAT	3	9	1024451	1024459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26060	NC_016915	CTTA	2	8	1024473	1024480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26061	NC_016915	ATC	2	6	1024482	1024487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26062	NC_016915	T	6	6	1024491	1024496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26063	NC_016915	TCTA	2	8	1024505	1024512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26064	NC_016915	TTC	2	6	1024515	1024520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26065	NC_016915	ATC	2	6	1024527	1024532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26068	NC_016915	TTC	2	6	1024734	1024739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26069	NC_016915	CTTT	2	8	1024771	1024778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26070	NC_016915	TAA	2	6	1024790	1024795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26072	NC_016915	ATAA	2	8	1024827	1024834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26073	NC_016915	AT	3	6	1024873	1024878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26074	NC_016915	AAAT	2	8	1024891	1024898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26075	NC_016915	A	7	7	1024927	1024933	100 %	0 %	0 %	0 %	379019554
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26081	NC_016915	CGGT	2	8	1025315	1025322	0 %	25 %	50 %	25 %	379019554
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26088	NC_016915	A	6	6	1025759	1025764	100 %	0 %	0 %	0 %	379019555
26089	NC_016915	T	6	6	1025787	1025792	0 %	100 %	0 %	0 %	379019555
26090	NC_016915	CAA	2	6	1025796	1025801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019555
26091	NC_016915	GAA	2	6	1025973	1025978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019555
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26094	NC_016915	T	6	6	1026043	1026048	0 %	100 %	0 %	0 %	379019555
26095	NC_016915	ATT	2	6	1026065	1026070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019555
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26098	NC_016915	CA	3	6	1026177	1026182	50 %	0 %	0 %	50 %	379019555
26099	NC_016915	TAC	2	6	1026193	1026198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019555
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26105	NC_016915	T	6	6	1026364	1026369	0 %	100 %	0 %	0 %	379019555
26106	NC_016915	TAA	2	6	1026374	1026379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019556
26107	NC_016915	AGAC	2	8	1026411	1026418	50 %	0 %	25 %	25 %	379019556
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26112	NC_016915	AAT	2	6	1026631	1026636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019556
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26356	NC_016915	A	7	7	1036219	1036225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26357	NC_016915	TA	3	6	1036229	1036234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26359	NC_016915	GATA	2	8	1036255	1036262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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26362	NC_016915	TGT	2	6	1036474	1036479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26364	NC_016915	TA	3	6	1036520	1036525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26365	NC_016915	TA	3	6	1036539	1036544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26366	NC_016915	GAA	2	6	1036560	1036565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26368	NC_016915	GA	3	6	1036770	1036775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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