MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_016915	TA	3	6	650425	650430	50 %	50 %	0 %	0 %	379019172
16503	NC_016915	ATATC	2	10	650487	650496	40 %	40 %	0 %	20 %	379019172
16504	NC_016915	TAC	2	6	650505	650510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019172
16505	NC_016915	GCTG	2	8	650519	650526	0 %	25 %	50 %	25 %	379019172
16506	NC_016915	TGA	2	6	650535	650540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019172
16507	NC_016915	ACT	2	6	650587	650592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019172
16508	NC_016915	ATT	2	6	650672	650677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019172
16509	NC_016915	A	6	6	650696	650701	100 %	0 %	0 %	0 %	379019172
16510	NC_016915	ATA	2	6	650710	650715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019172
16511	NC_016915	TTA	4	12	650741	650752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019173
16512	NC_016915	ATTTC	2	10	650769	650778	20 %	60 %	0 %	20 %	379019173
16513	NC_016915	ACT	2	6	650782	650787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019173
16514	NC_016915	AAT	2	6	650792	650797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019173
16515	NC_016915	AAG	2	6	650832	650837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019173
16516	NC_016915	GCA	2	6	650853	650858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019173
16517	NC_016915	CGG	2	6	650914	650919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019173
16518	NC_016915	A	6	6	650944	650949	100 %	0 %	0 %	0 %	379019173
16519	NC_016915	TAA	2	6	650962	650967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019173
16520	NC_016915	A	7	7	650966	650972	100 %	0 %	0 %	0 %	379019173
16521	NC_016915	TCTT	2	8	651019	651026	0 %	75 %	0 %	25 %	379019174
16522	NC_016915	TTA	2	6	651038	651043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019174
16523	NC_016915	TTA	2	6	651089	651094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16524	NC_016915	TAT	2	6	651121	651126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_016915	AT	3	6	651162	651167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16526	NC_016915	AGA	2	6	651172	651177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_016915	TA	3	6	651185	651190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_016915	AAT	2	6	651191	651196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_016915	AT	3	6	651195	651200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16530	NC_016915	T	7	7	651255	651261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_016915	T	6	6	651299	651304	0 %	100 %	0 %	0 %	379019175
16532	NC_016915	GTA	2	6	651320	651325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019175
16533	NC_016915	ACTGAA	2	12	651380	651391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019175
16534	NC_016915	TA	3	6	651395	651400	50 %	50 %	0 %	0 %	379019175
16535	NC_016915	GCA	2	6	651425	651430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019175
16536	NC_016915	ATTTA	2	10	651489	651498	40 %	60 %	0 %	0 %	379019175
16537	NC_016915	TAT	2	6	651506	651511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019175
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16541	NC_016915	ATAA	2	8	651665	651672	75 %	25 %	0 %	0 %	379019175
16542	NC_016915	T	6	6	651680	651685	0 %	100 %	0 %	0 %	379019175
16543	NC_016915	CTACT	2	10	651712	651721	20 %	40 %	0 %	40 %	379019175
16544	NC_016915	TGT	2	6	651769	651774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019175
16545	NC_016915	TC	3	6	651795	651800	0 %	50 %	0 %	50 %	379019175
16546	NC_016915	TAA	2	6	651818	651823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019175
16547	NC_016915	ATAA	2	8	651871	651878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_016915	TGA	3	9	651891	651899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16549	NC_016915	AACC	2	8	651914	651921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16550	NC_016915	TAAA	2	8	651933	651940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16551	NC_016915	ATTAA	2	10	651967	651976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16552	NC_016915	TACA	2	8	651989	651996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16553	NC_016915	TTA	2	6	652142	652147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_016915	GGA	2	6	652155	652160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16555	NC_016915	TTGC	2	8	652183	652190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16556	NC_016915	CGC	2	6	652214	652219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16557	NC_016915	TCA	2	6	652295	652300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16558	NC_016915	CTG	2	6	652313	652318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16559	NC_016915	CTT	2	6	652325	652330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16560	NC_016915	TTA	2	6	652336	652341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_016915	TAAA	2	8	652353	652360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16562	NC_016915	CATA	2	8	652385	652392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16564	NC_016915	CTT	2	6	652436	652441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_016915	ATT	2	6	652449	652454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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