MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016915	TTTTGA	2	12	629282	629293	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379019150
16002	NC_016915	CATAA	2	10	629326	629335	60 %	20 %	0 %	20 %	379019150
16003	NC_016915	CGG	2	6	629342	629347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019150
16004	NC_016915	TCC	2	6	629351	629356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019150
16005	NC_016915	TA	3	6	629504	629509	50 %	50 %	0 %	0 %	379019150
16006	NC_016915	TACCT	2	10	629579	629588	20 %	40 %	0 %	40 %	379019150
16007	NC_016915	TCA	2	6	629703	629708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019150
16008	NC_016915	CCA	2	6	629869	629874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019150
16009	NC_016915	ATC	2	6	629921	629926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019150
16010	NC_016915	TTAGT	2	10	629938	629947	20 %	60 %	20 %	0 %	379019150
16011	NC_016915	ATA	2	6	630055	630060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019150
16012	NC_016915	TCT	2	6	630103	630108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019150
16013	NC_016915	CAA	2	6	630115	630120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019150
16014	NC_016915	TAAT	2	8	630184	630191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_016915	ATTT	3	12	630212	630223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_016915	GCGA	2	8	630252	630259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16017	NC_016915	TCA	2	6	630280	630285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_016915	TCGC	2	8	630316	630323	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16019	NC_016915	A	7	7	630339	630345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_016915	TAT	2	6	630361	630366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019151
16021	NC_016915	AT	4	8	630457	630464	50 %	50 %	0 %	0 %	379019151
16022	NC_016915	ACGA	2	8	630495	630502	50 %	0 %	25 %	25 %	379019151
16023	NC_016915	ATC	2	6	630545	630550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019151
16024	NC_016915	TAAG	2	8	630558	630565	50 %	25 %	25 %	0 %	379019151
16025	NC_016915	ATTC	2	8	630577	630584	25 %	50 %	0 %	25 %	379019151
16026	NC_016915	TAT	2	6	630609	630614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019151
16027	NC_016915	TCA	2	6	630668	630673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019151
16028	NC_016915	ACA	2	6	630703	630708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019151
16029	NC_016915	CAAA	2	8	630712	630719	75 %	0 %	0 %	25 %	379019151
16030	NC_016915	TCT	2	6	630814	630819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019151
16031	NC_016915	CTC	2	6	630830	630835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019151
16032	NC_016915	TAA	2	6	630856	630861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019151
16033	NC_016915	ATA	2	6	630928	630933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_016915	ATG	2	6	630957	630962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_016915	CAAC	2	8	630966	630973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16036	NC_016915	AAT	2	6	630975	630980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019152
16037	NC_016915	GTA	2	6	631003	631008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019152
16038	NC_016915	AAT	2	6	631027	631032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019152
16039	NC_016915	A	7	7	631086	631092	100 %	0 %	0 %	0 %	379019152
16040	NC_016915	GAA	2	6	631196	631201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019153
16041	NC_016915	GAT	2	6	631218	631223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019153
16042	NC_016915	AAAAT	2	10	631225	631234	80 %	20 %	0 %	0 %	379019153
16043	NC_016915	ATTA	2	8	631244	631251	50 %	50 %	0 %	0 %	379019153
16044	NC_016915	GAT	2	6	631278	631283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019153
16045	NC_016915	AG	3	6	631290	631295	50 %	0 %	50 %	0 %	379019153
16046	NC_016915	ATA	2	6	631332	631337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019153
16047	NC_016915	AGC	2	6	631357	631362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_016915	AAC	2	6	631375	631380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_016915	ACT	2	6	631382	631387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_016915	AGC	2	6	631399	631404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_016915	GTAC	2	8	631415	631422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16052	NC_016915	AT	3	6	631436	631441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_016915	AGC	2	6	631486	631491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_016915	AATT	2	8	631521	631528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_016915	ATT	2	6	631576	631581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_016915	TTA	2	6	631613	631618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_016915	GGC	2	6	631675	631680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_016915	AGC	2	6	631695	631700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_016915	A	8	8	631710	631717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_016915	TTA	2	6	631803	631808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019154
16061	NC_016915	GGC	2	6	631845	631850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019154
16062	NC_016915	CTA	2	6	631869	631874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019154
16063	NC_016915	ATA	2	6	631921	631926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019154
16064	NC_016915	GTG	2	6	631951	631956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019154
16065	NC_016915	GAC	2	6	632035	632040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019154
16066	NC_016915	AAT	2	6	632055	632060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019154
16067	NC_016915	AAAGA	2	10	632106	632115	80 %	0 %	20 %	0 %	379019154
16068	NC_016915	TACA	2	8	632146	632153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16069	NC_016915	GAA	2	6	632230	632235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019155
16070	NC_016915	A	6	6	632244	632249	100 %	0 %	0 %	0 %	379019155
16071	NC_016915	AC	3	6	632251	632256	50 %	0 %	0 %	50 %	379019155
16072	NC_016915	ATT	2	6	632262	632267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019155
16073	NC_016915	ATT	2	6	632314	632319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019155
16074	NC_016915	ATA	2	6	632399	632404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019155
16075	NC_016915	GTA	2	6	632410	632415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019155
16076	NC_016915	TAG	2	6	632450	632455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019155
16077	NC_016915	AGA	2	6	632478	632483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019155
16078	NC_016915	TGAAG	2	10	632496	632505	40 %	20 %	40 %	0 %	379019155
16079	NC_016915	GAT	2	6	632532	632537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019155
16080	NC_016915	ATT	2	6	632538	632543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019155
16081	NC_016915	CTT	2	6	632553	632558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019155
16082	NC_016915	CAGA	2	8	632636	632643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16083	NC_016915	GGT	2	6	632703	632708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019156
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16086	NC_016915	CTG	2	6	632830	632835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019156
16087	NC_016915	T	7	7	632836	632842	0 %	100 %	0 %	0 %	379019156
16088	NC_016915	AAG	2	6	632854	632859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019156
16089	NC_016915	ATA	2	6	632896	632901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019156
16090	NC_016915	CAG	2	6	632930	632935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019156
16091	NC_016915	ATC	2	6	632937	632942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019156
16092	NC_016915	AAC	2	6	633021	633026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019156
16093	NC_016915	TTC	2	6	633083	633088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019156
16094	NC_016915	CT	3	6	633111	633116	0 %	50 %	0 %	50 %	379019156
16095	NC_016915	AC	3	6	633194	633199	50 %	0 %	0 %	50 %	379019156
16096	NC_016915	TAG	2	6	633208	633213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019156
16097	NC_016915	ACA	2	6	633279	633284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019156
16098	NC_016915	CTT	2	6	633289	633294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019156
16099	NC_016915	AGT	2	6	633308	633313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019156
16100	NC_016915	GGTTC	2	10	633327	633336	0 %	40 %	40 %	20 %	379019156
16101	NC_016915	ATAA	2	8	633370	633377	75 %	25 %	0 %	0 %	379019156
16102	NC_016915	CT	3	6	633391	633396	0 %	50 %	0 %	50 %	379019157
16103	NC_016915	ATA	2	6	633501	633506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019157
16104	NC_016915	ATT	2	6	633547	633552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019157
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16106	NC_016915	CAG	2	6	633717	633722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019157
16107	NC_016915	TTA	2	6	633749	633754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019157
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16109	NC_016915	TAA	2	6	633793	633798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019157
16110	NC_016915	ATA	2	6	633815	633820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019157
16111	NC_016915	ATT	2	6	633830	633835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019157
16112	NC_016915	ATA	2	6	633873	633878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019157
16113	NC_016915	AT	3	6	633900	633905	50 %	50 %	0 %	0 %	379019157
16114	NC_016915	TTC	2	6	633989	633994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019157
16115	NC_016915	ACTA	2	8	634003	634010	50 %	25 %	0 %	25 %	379019157
16116	NC_016915	TA	3	6	634153	634158	50 %	50 %	0 %	0 %	379019157
16117	NC_016915	GCA	2	6	634176	634181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019157
16118	NC_016915	TTA	2	6	634182	634187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019157
16119	NC_016915	TAC	2	6	634224	634229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019158
16120	NC_016915	CG	3	6	634245	634250	0 %	0 %	50 %	50 %	379019158
16121	NC_016915	TAA	2	6	634312	634317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019158
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16500	NC_016915	GCT	2	6	650340	650345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019172

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