MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016915	TAAA	2	8	549312	549319	75 %	25 %	0 %	0 %	379019070
14003	NC_016915	AGA	2	6	549328	549333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019070
14004	NC_016915	AAAG	2	8	549340	549347	75 %	0 %	25 %	0 %	379019070
14005	NC_016915	GCT	2	6	549359	549364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019070
14006	NC_016915	TGT	2	6	549403	549408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_016915	T	8	8	549447	549454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_016915	CAA	2	6	549505	549510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_016915	ATT	2	6	549512	549517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_016915	ACCT	2	8	549568	549575	25 %	25 %	0 %	50 %	379019071
14011	NC_016915	AAT	2	6	549576	549581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019071
14012	NC_016915	ATT	2	6	549737	549742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019071
14013	NC_016915	A	7	7	549800	549806	100 %	0 %	0 %	0 %	379019071
14014	NC_016915	ACA	3	9	549932	549940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019071
14015	NC_016915	GCA	2	6	549990	549995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019071
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14017	NC_016915	T	6	6	550088	550093	0 %	100 %	0 %	0 %	379019071
14018	NC_016915	TTA	2	6	550156	550161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_016915	TAA	2	6	550218	550223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_016915	TAA	2	6	550232	550237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_016915	A	7	7	550273	550279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_016915	CAA	2	6	550295	550300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_016915	AAATT	2	10	550301	550310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_016915	TTA	2	6	550323	550328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_016915	TAG	2	6	550341	550346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_016915	T	7	7	550355	550361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_016915	AAGA	2	8	550407	550414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_016915	GAA	2	6	550419	550424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_016915	TAAT	2	8	550529	550536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_016915	A	7	7	550570	550576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_016915	AGA	3	9	550665	550673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_016915	TA	3	6	550723	550728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_016915	TAA	2	6	550748	550753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_016915	ATA	2	6	550839	550844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_016915	AGC	2	6	550872	550877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_016915	TAC	3	9	550924	550932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_016915	T	8	8	550933	550940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_016915	GGTA	2	8	550951	550958	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_016915	AAC	2	6	551012	551017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_016915	TAA	2	6	551027	551032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_016915	A	6	6	551084	551089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_016915	TAGA	2	8	551115	551122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_016915	GAG	2	6	551161	551166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_016915	ACG	2	6	551210	551215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_016915	TCT	2	6	551273	551278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019072
14046	NC_016915	ATA	2	6	551407	551412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019072
14047	NC_016915	TCA	2	6	551437	551442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019072
14048	NC_016915	TA	3	6	551462	551467	50 %	50 %	0 %	0 %	379019072
14049	NC_016915	TTC	2	6	551499	551504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019072
14050	NC_016915	TAG	2	6	551529	551534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019072
14051	NC_016915	CAG	2	6	551597	551602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019072
14052	NC_016915	TTA	2	6	551713	551718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019072
14053	NC_016915	CAT	2	6	551732	551737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019072
14054	NC_016915	TAA	2	6	551780	551785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019072
14055	NC_016915	AGC	2	6	551792	551797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019072
14056	NC_016915	ACT	2	6	551953	551958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019072
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14058	NC_016915	CTTT	2	8	551968	551975	0 %	75 %	0 %	25 %	379019072
14059	NC_016915	A	6	6	551979	551984	100 %	0 %	0 %	0 %	379019072
14060	NC_016915	ACT	2	6	552001	552006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019072
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14064	NC_016915	A	6	6	552132	552137	100 %	0 %	0 %	0 %	379019072
14065	NC_016915	ATA	2	6	552146	552151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019072
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14069	NC_016915	GAT	2	6	552271	552276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019072
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14071	NC_016915	GAT	3	9	552356	552364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019072
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14079	NC_016915	CTT	2	6	552883	552888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019072
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14082	NC_016915	TAG	2	6	553028	553033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019072
14083	NC_016915	TGAAA	2	10	553055	553064	60 %	20 %	20 %	0 %	379019072
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14093	NC_016915	T	7	7	553741	553747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_016915	TA	3	6	553752	553757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_016915	CATTGT	2	12	553761	553772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14096	NC_016915	TCA	2	6	553799	553804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14098	NC_016915	AT	4	8	553884	553891	50 %	50 %	0 %	0 %	379019073
14099	NC_016915	CT	3	6	553892	553897	0 %	50 %	0 %	50 %	379019073
14100	NC_016915	TTC	2	6	553982	553987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019073
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14105	NC_016915	TGC	2	6	554153	554158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019073
14106	NC_016915	TTA	2	6	554172	554177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019073
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14108	NC_016915	TAG	2	6	554197	554202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019073
14109	NC_016915	ATTC	2	8	554203	554210	25 %	50 %	0 %	25 %	379019073
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14111	NC_016915	A	6	6	554345	554350	100 %	0 %	0 %	0 %	379019073
14112	NC_016915	TTC	2	6	554364	554369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019073
14113	NC_016915	ATA	2	6	554403	554408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_016915	ATT	2	6	554434	554439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_016915	A	7	7	554475	554481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_016915	TAA	2	6	554573	554578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019074
14117	NC_016915	TA	3	6	554702	554707	50 %	50 %	0 %	0 %	379019075
14118	NC_016915	GAC	2	6	554744	554749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019076
14119	NC_016915	TAA	2	6	554779	554784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019076
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14122	NC_016915	TAT	2	6	554896	554901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019076
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14134	NC_016915	T	6	6	555558	555563	0 %	100 %	0 %	0 %	379019076
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14244	NC_016915	CTTG	2	8	560708	560715	0 %	50 %	25 %	25 %	379019079
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