MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016915	A	6	6	530135	530140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_016915	A	6	6	530159	530164	100 %	0 %	0 %	0 %	379019045
13503	NC_016915	GAA	2	6	530174	530179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019045
13504	NC_016915	TAAT	2	8	530232	530239	50 %	50 %	0 %	0 %	379019045
13505	NC_016915	T	6	6	530261	530266	0 %	100 %	0 %	0 %	379019045
13506	NC_016915	TTC	2	6	530287	530292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019045
13507	NC_016915	GTA	2	6	530354	530359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019045
13508	NC_016915	GAA	2	6	530381	530386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019045
13509	NC_016915	ATT	3	9	530471	530479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019045
13510	NC_016915	ATT	2	6	530505	530510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019046
13511	NC_016915	AGA	2	6	530528	530533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019046
13512	NC_016915	TTGC	2	8	530565	530572	0 %	50 %	25 %	25 %	379019046
13513	NC_016915	A	6	6	530577	530582	100 %	0 %	0 %	0 %	379019046
13514	NC_016915	ATG	2	6	530584	530589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019046
13515	NC_016915	ATA	2	6	530592	530597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019046
13516	NC_016915	CAC	2	6	530608	530613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019046
13517	NC_016915	TAA	3	9	530695	530703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_016915	GAA	2	6	530723	530728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_016915	ATT	2	6	530731	530736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_016915	TCA	2	6	530771	530776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_016915	ATTT	2	8	530795	530802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_016915	GCAACA	2	12	530816	530827	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_016915	TAAAT	2	10	530908	530917	60 %	40 %	0 %	0 %	379019047
13524	NC_016915	AT	3	6	530974	530979	50 %	50 %	0 %	0 %	379019047
13525	NC_016915	CAAT	2	8	530989	530996	50 %	25 %	0 %	25 %	379019047
13526	NC_016915	CTG	3	9	531000	531008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019047
13527	NC_016915	GAA	2	6	531023	531028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019047
13528	NC_016915	GTG	2	6	531069	531074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_016915	ACA	2	6	531089	531094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_016915	TA	3	6	531099	531104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_016915	A	6	6	531139	531144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_016915	AAAAT	2	10	531151	531160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_016915	GAA	2	6	531213	531218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_016915	ACAAGC	2	12	531269	531280	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_016915	A	6	6	531286	531291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_016915	TAA	2	6	531293	531298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_016915	AAAG	2	8	531344	531351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_016915	ATA	2	6	531373	531378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019048
13539	NC_016915	AAAG	2	8	531438	531445	75 %	0 %	25 %	0 %	379019048
13540	NC_016915	ATATA	2	10	531446	531455	60 %	40 %	0 %	0 %	379019048
13541	NC_016915	ACA	2	6	531459	531464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019048
13542	NC_016915	A	6	6	531493	531498	100 %	0 %	0 %	0 %	379019048
13543	NC_016915	AT	3	6	531542	531547	50 %	50 %	0 %	0 %	379019048
13544	NC_016915	ATC	2	6	531587	531592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_016915	ATG	2	6	531605	531610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_016915	TAA	2	6	531611	531616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_016915	CAT	2	6	531631	531636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_016915	TCA	2	6	531645	531650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_016915	TAA	2	6	531667	531672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_016915	ATT	2	6	531674	531679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_016915	AAT	2	6	531738	531743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019049
13552	NC_016915	TAA	2	6	531816	531821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019049
13553	NC_016915	AGT	2	6	531829	531834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019049
13554	NC_016915	TAG	2	6	531855	531860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019049
13555	NC_016915	AAT	2	6	531862	531867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019049
13556	NC_016915	CTT	2	6	531870	531875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019049
13557	NC_016915	AGT	2	6	531902	531907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019049
13558	NC_016915	CTA	2	6	531938	531943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019049
13559	NC_016915	AAT	2	6	532039	532044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019049
13560	NC_016915	AGA	2	6	532063	532068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019049
13561	NC_016915	TATC	2	8	532131	532138	25 %	50 %	0 %	25 %	379019049
13562	NC_016915	ATT	2	6	532147	532152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019049
13563	NC_016915	A	6	6	532242	532247	100 %	0 %	0 %	0 %	379019049
13564	NC_016915	TCAT	2	8	532283	532290	25 %	50 %	0 %	25 %	379019049
13565	NC_016915	TAT	2	6	532328	532333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_016915	TA	3	6	532383	532388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_016915	TAA	2	6	532446	532451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019050
13568	NC_016915	T	6	6	532486	532491	0 %	100 %	0 %	0 %	379019050
13569	NC_016915	AGA	2	6	532492	532497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019050
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13571	NC_016915	A	7	7	532508	532514	100 %	0 %	0 %	0 %	379019050
13572	NC_016915	TTAA	2	8	532550	532557	50 %	50 %	0 %	0 %	379019050
13573	NC_016915	AT	3	6	532677	532682	50 %	50 %	0 %	0 %	379019050
13574	NC_016915	TAG	2	6	532683	532688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019050
13575	NC_016915	AT	3	6	532712	532717	50 %	50 %	0 %	0 %	379019050
13576	NC_016915	TTA	2	6	532718	532723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019050
13577	NC_016915	TTAATG	2	12	532799	532810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019050
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13582	NC_016915	ATAA	2	8	532939	532946	75 %	25 %	0 %	0 %	379019050
13583	NC_016915	TGC	2	6	533027	533032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13584	NC_016915	AT	3	6	533089	533094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_016915	TAT	2	6	533127	533132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019051
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13588	NC_016915	TAA	2	6	533215	533220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019051
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13590	NC_016915	TAG	2	6	533235	533240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019051
13591	NC_016915	CAAT	2	8	533268	533275	50 %	25 %	0 %	25 %	379019051
13592	NC_016915	TAT	2	6	533363	533368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019051
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13594	NC_016915	GTT	2	6	533478	533483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019051
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13596	NC_016915	TA	3	6	533516	533521	50 %	50 %	0 %	0 %	379019051
13597	NC_016915	T	6	6	533522	533527	0 %	100 %	0 %	0 %	379019051
13598	NC_016915	A	6	6	533536	533541	100 %	0 %	0 %	0 %	379019051
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13600	NC_016915	AGCA	2	8	533577	533584	50 %	0 %	25 %	25 %	379019052
13601	NC_016915	TAC	2	6	533679	533684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019052
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13604	NC_016915	TAA	2	6	533796	533801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019052
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13606	NC_016915	TAA	2	6	533907	533912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_016915	A	7	7	533919	533925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_016915	TTA	3	9	533926	533934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_016915	CTT	2	6	534081	534086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019053
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13611	NC_016915	T	6	6	534165	534170	0 %	100 %	0 %	0 %	379019053
13612	NC_016915	TTTAT	2	10	534183	534192	20 %	80 %	0 %	0 %	379019053
13613	NC_016915	TA	3	6	534199	534204	50 %	50 %	0 %	0 %	379019053
13614	NC_016915	GTTA	2	8	534228	534235	25 %	50 %	25 %	0 %	379019053
13615	NC_016915	T	6	6	534242	534247	0 %	100 %	0 %	0 %	379019053
13616	NC_016915	ATTT	2	8	534280	534287	25 %	75 %	0 %	0 %	379019053
13617	NC_016915	ATTA	2	8	534386	534393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_016915	T	6	6	534399	534404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13620	NC_016915	TTAT	2	8	534454	534461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_016915	TAA	2	6	534555	534560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019054
13622	NC_016915	TATT	2	8	534573	534580	25 %	75 %	0 %	0 %	379019054
13623	NC_016915	T	6	6	534596	534601	0 %	100 %	0 %	0 %	379019054
13624	NC_016915	AT	3	6	534610	534615	50 %	50 %	0 %	0 %	379019054
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