MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016915	TTG	2	6	510135	510140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_016915	AAT	2	6	510164	510169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_016915	ATG	2	6	510180	510185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_016915	ATTAAT	2	12	510224	510235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_016915	TAAT	2	8	510241	510248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_016915	T	6	6	510262	510267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_016915	AAT	2	6	510270	510275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_016915	ACT	2	6	510328	510333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_016915	A	6	6	510351	510356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_016915	CAAA	2	8	510418	510425	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13011	NC_016915	TAC	2	6	510546	510551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_016915	AGT	2	6	510582	510587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_016915	AGC	2	6	510588	510593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_016915	ATT	2	6	510646	510651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_016915	AGT	2	6	510652	510657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_016915	CAA	2	6	510713	510718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_016915	AG	3	6	510758	510763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_016915	TAA	2	6	510768	510773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_016915	TTGA	2	8	510820	510827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_016915	TTACT	2	10	510842	510851	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13021	NC_016915	TTAAT	2	10	510862	510871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_016915	AT	3	6	510870	510875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_016915	TATT	2	8	510901	510908	25 %	75 %	0 %	0 %	379019029
13024	NC_016915	CTTT	2	8	510976	510983	0 %	75 %	0 %	25 %	379019029
13025	NC_016915	CGG	2	6	510990	510995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019029
13026	NC_016915	TTC	2	6	511020	511025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019029
13027	NC_016915	ACC	2	6	511083	511088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019029
13028	NC_016915	TCA	2	6	511160	511165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019029
13029	NC_016915	CAGC	2	8	511192	511199	25 %	0 %	25 %	50 %	379019029
13030	NC_016915	GTGAAT	2	12	511236	511247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019029
13031	NC_016915	TTG	2	6	511286	511291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019029
13032	NC_016915	AAC	2	6	511304	511309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019029
13033	NC_016915	GGT	2	6	511356	511361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019029
13034	NC_016915	GTA	2	6	511441	511446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019029
13035	NC_016915	TCT	2	6	511459	511464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019029
13036	NC_016915	TTC	2	6	511506	511511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019029
13037	NC_016915	GAT	2	6	511514	511519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019029
13038	NC_016915	CTAT	2	8	511522	511529	25 %	50 %	0 %	25 %	379019029
13039	NC_016915	T	6	6	511683	511688	0 %	100 %	0 %	0 %	379019029
13040	NC_016915	AAT	2	6	511721	511726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019029
13041	NC_016915	AT	4	8	511768	511775	50 %	50 %	0 %	0 %	379019029
13042	NC_016915	T	6	6	511775	511780	0 %	100 %	0 %	0 %	379019029
13043	NC_016915	AATA	2	8	511830	511837	75 %	25 %	0 %	0 %	379019029
13044	NC_016915	CAA	2	6	511877	511882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019029
13045	NC_016915	TCA	2	6	511966	511971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019029
13046	NC_016915	AGC	2	6	511972	511977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019029
13047	NC_016915	CCG	2	6	512086	512091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379019029
13048	NC_016915	ATA	2	6	512180	512185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019029
13049	NC_016915	TAT	2	6	512312	512317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019029
13050	NC_016915	AGGC	2	8	512331	512338	25 %	0 %	50 %	25 %	379019029
13051	NC_016915	CTT	2	6	512438	512443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019029
13052	NC_016915	T	7	7	512465	512471	0 %	100 %	0 %	0 %	379019029
13053	NC_016915	TCA	2	6	512500	512505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019029
13054	NC_016915	ATA	2	6	512541	512546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019029
13055	NC_016915	T	6	6	512558	512563	0 %	100 %	0 %	0 %	379019029
13056	NC_016915	TGC	2	6	512584	512589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019029
13057	NC_016915	TAA	2	6	512636	512641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019029
13058	NC_016915	TCT	2	6	512671	512676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019029
13059	NC_016915	TGC	2	6	512683	512688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019029
13060	NC_016915	AT	3	6	512723	512728	50 %	50 %	0 %	0 %	379019029
13061	NC_016915	AAT	2	6	512781	512786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019029
13062	NC_016915	TTA	2	6	512863	512868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019029
13063	NC_016915	TTC	2	6	512880	512885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019029
13064	NC_016915	AAT	2	6	512892	512897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019029
13065	NC_016915	TCG	2	6	512920	512925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019029
13066	NC_016915	TAT	2	6	512981	512986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019029
13067	NC_016915	GT	3	6	513042	513047	0 %	50 %	50 %	0 %	379019029
13068	NC_016915	T	6	6	513069	513074	0 %	100 %	0 %	0 %	379019029
13069	NC_016915	AT	3	6	513091	513096	50 %	50 %	0 %	0 %	379019029
13070	NC_016915	TAT	2	6	513101	513106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019029
13071	NC_016915	GA	3	6	513128	513133	50 %	0 %	50 %	0 %	379019029
13072	NC_016915	TAC	2	6	513189	513194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019029
13073	NC_016915	TC	3	6	513199	513204	0 %	50 %	0 %	50 %	379019029
13074	NC_016915	T	6	6	513225	513230	0 %	100 %	0 %	0 %	379019029
13075	NC_016915	ATT	2	6	513262	513267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_016915	TA	3	6	513271	513276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_016915	ATT	2	6	513306	513311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016915	TAC	2	6	513332	513337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019030
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13080	NC_016915	AGC	2	6	513354	513359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019030
13081	NC_016915	ATA	2	6	513365	513370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019030
13082	NC_016915	T	8	8	513443	513450	0 %	100 %	0 %	0 %	379019030
13083	NC_016915	A	6	6	513467	513472	100 %	0 %	0 %	0 %	379019030
13084	NC_016915	TTA	2	6	513508	513513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019030
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13086	NC_016915	ATTT	2	8	513622	513629	25 %	75 %	0 %	0 %	379019030
13087	NC_016915	AGCA	2	8	513656	513663	50 %	0 %	25 %	25 %	379019030
13088	NC_016915	CGG	2	6	513675	513680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019030
13089	NC_016915	TA	4	8	513687	513694	50 %	50 %	0 %	0 %	379019030
13090	NC_016915	AAG	2	6	513707	513712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019030
13091	NC_016915	GAA	2	6	513715	513720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019030
13092	NC_016915	AGA	2	6	513729	513734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019030
13093	NC_016915	AGCAGG	2	12	513786	513797	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379019030
13094	NC_016915	CAG	2	6	513820	513825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019030
13095	NC_016915	GCG	4	12	513860	513871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019030
13096	NC_016915	ATG	2	6	513953	513958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019030
13097	NC_016915	TTAT	2	8	513960	513967	25 %	75 %	0 %	0 %	379019030
13098	NC_016915	ATA	2	6	513977	513982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019030
13099	NC_016915	A	6	6	514069	514074	100 %	0 %	0 %	0 %	379019030
13100	NC_016915	TGA	2	6	514077	514082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019030
13101	NC_016915	AGA	2	6	514095	514100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019030
13102	NC_016915	AT	3	6	514108	514113	50 %	50 %	0 %	0 %	379019030
13103	NC_016915	AGT	2	6	514165	514170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019030
13104	NC_016915	T	6	6	514194	514199	0 %	100 %	0 %	0 %	379019030
13105	NC_016915	AGC	2	6	514341	514346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019030
13106	NC_016915	A	6	6	514445	514450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_016915	AAC	2	6	514492	514497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_016915	ATG	2	6	514509	514514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_016915	TCT	2	6	514539	514544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019031
13110	NC_016915	CTT	2	6	514550	514555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019031
13111	NC_016915	TAG	2	6	514562	514567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019031
13112	NC_016915	CTT	2	6	514606	514611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019031
13113	NC_016915	TTA	2	6	514616	514621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019031
13114	NC_016915	GATT	2	8	514655	514662	25 %	50 %	25 %	0 %	379019031
13115	NC_016915	AAATTA	2	12	514678	514689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019031
13116	NC_016915	TTG	2	6	514695	514700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019031
13117	NC_016915	CTTTAT	2	12	514766	514777	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379019031
13118	NC_016915	GCA	2	6	514804	514809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019031
13119	NC_016915	AT	3	6	514885	514890	50 %	50 %	0 %	0 %	379019031
13120	NC_016915	T	6	6	514913	514918	0 %	100 %	0 %	0 %	379019031
13121	NC_016915	TTA	2	6	515057	515062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019031
13122	NC_016915	TGA	2	6	515082	515087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019031
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13124	NC_016915	TAA	2	6	515099	515104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019031
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13241	NC_016915	TTC	2	6	519850	519855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13242	NC_016915	CATC	2	8	519863	519870	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13243	NC_016915	TAA	2	6	519880	519885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_016915	ATT	2	6	519901	519906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_016915	TAT	2	6	519919	519924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13246	NC_016915	T	6	6	520088	520093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13247	NC_016915	AAT	2	6	520128	520133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13248	NC_016915	ATT	2	6	520147	520152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_016915	A	6	6	520191	520196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_016915	T	6	6	520226	520231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13251	NC_016915	TAT	2	6	520240	520245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13495	NC_016915	A	6	6	529911	529916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13497	NC_016915	A	6	6	530033	530038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_016915	ATT	2	6	530041	530046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_016915	GAA	2	6	530058	530063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_016915	A	6	6	530066	530071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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