MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016915	TCT	2	6	450720	450725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018974
11502	NC_016915	TACG	2	8	450829	450836	25 %	25 %	25 %	25 %	379018974
11503	NC_016915	GTA	2	6	450846	450851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018974
11504	NC_016915	CCA	2	6	450864	450869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018974
11505	NC_016915	TGC	2	6	450959	450964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018974
11506	NC_016915	CT	3	6	451003	451008	0 %	50 %	0 %	50 %	379018974
11507	NC_016915	CTT	2	6	451078	451083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018974
11508	NC_016915	GCA	2	6	451176	451181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018974
11509	NC_016915	CTT	2	6	451192	451197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018974
11510	NC_016915	CCG	2	6	451200	451205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018974
11511	NC_016915	AAT	2	6	451223	451228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018974
11512	NC_016915	CAT	2	6	451246	451251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018974
11513	NC_016915	TAA	2	6	451259	451264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018974
11514	NC_016915	ATT	2	6	451373	451378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018974
11515	NC_016915	CTT	2	6	451381	451386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018974
11516	NC_016915	TTA	2	6	451404	451409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018974
11517	NC_016915	ACA	2	6	451428	451433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018974
11518	NC_016915	TTG	2	6	451500	451505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018974
11519	NC_016915	TTATT	2	10	451560	451569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_016915	TGA	2	6	451648	451653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_016915	GCT	2	6	451673	451678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_016915	GAC	2	6	451685	451690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_016915	CT	3	6	451713	451718	0 %	50 %	0 %	50 %	379018975
11524	NC_016915	TGC	2	6	451733	451738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018975
11525	NC_016915	CTA	2	6	451765	451770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018975
11526	NC_016915	TTG	2	6	451804	451809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018975
11527	NC_016915	TTC	2	6	451958	451963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018975
11528	NC_016915	TAT	2	6	451975	451980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018975
11529	NC_016915	CTTT	2	8	451987	451994	0 %	75 %	0 %	25 %	379018975
11530	NC_016915	TTTCA	2	10	452003	452012	20 %	60 %	0 %	20 %	379018975
11531	NC_016915	T	7	7	452031	452037	0 %	100 %	0 %	0 %	379018975
11532	NC_016915	CGCTAC	2	12	452081	452092	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379018975
11533	NC_016915	ATT	2	6	452105	452110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018975
11534	NC_016915	TCT	2	6	452127	452132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018975
11535	NC_016915	CTT	2	6	452158	452163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018975
11536	NC_016915	ATA	2	6	452187	452192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018975
11537	NC_016915	TTG	2	6	452212	452217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018975
11538	NC_016915	TTA	2	6	452238	452243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018975
11539	NC_016915	TCT	2	6	452247	452252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018975
11540	NC_016915	ACATT	2	10	452274	452283	40 %	40 %	0 %	20 %	379018975
11541	NC_016915	ATAA	2	8	452290	452297	75 %	25 %	0 %	0 %	379018975
11542	NC_016915	TGTT	2	8	452309	452316	0 %	75 %	25 %	0 %	379018975
11543	NC_016915	ATT	3	9	452354	452362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018975
11544	NC_016915	TTC	2	6	452378	452383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018975
11545	NC_016915	TAT	2	6	452404	452409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018975
11546	NC_016915	CAT	2	6	452548	452553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018975
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11549	NC_016915	CGGTGA	2	12	452627	452638	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379018975
11550	NC_016915	TAT	2	6	452644	452649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018975
11551	NC_016915	T	6	6	452649	452654	0 %	100 %	0 %	0 %	379018975
11552	NC_016915	T	6	6	452677	452682	0 %	100 %	0 %	0 %	379018975
11553	NC_016915	CTT	2	6	452851	452856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018975
11554	NC_016915	T	7	7	452855	452861	0 %	100 %	0 %	0 %	379018975
11555	NC_016915	ACC	2	6	452863	452868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018975
11556	NC_016915	TTCC	2	8	452878	452885	0 %	50 %	0 %	50 %	379018975
11557	NC_016915	TTG	2	6	452954	452959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_016915	TTA	2	6	452960	452965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_016915	GAG	2	6	452977	452982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_016915	CT	3	6	453040	453045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11561	NC_016915	ATC	2	6	453109	453114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018976
11562	NC_016915	GACC	2	8	453194	453201	25 %	0 %	25 %	50 %	379018976
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11565	NC_016915	ATTTC	2	10	453326	453335	20 %	60 %	0 %	20 %	379018976
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11569	NC_016915	T	6	6	453381	453386	0 %	100 %	0 %	0 %	379018976
11570	NC_016915	ACAG	2	8	453423	453430	50 %	0 %	25 %	25 %	379018976
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11573	NC_016915	ATT	2	6	453585	453590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_016915	TAT	2	6	453612	453617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11577	NC_016915	TTATT	2	10	453648	453657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_016915	TAAA	2	8	453670	453677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_016915	TTTA	2	8	453694	453701	25 %	75 %	0 %	0 %	379018977
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11592	NC_016915	AT	3	6	454059	454064	50 %	50 %	0 %	0 %	379018978
11593	NC_016915	AATT	2	8	454090	454097	50 %	50 %	0 %	0 %	379018978
11594	NC_016915	T	8	8	454105	454112	0 %	100 %	0 %	0 %	379018978
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11603	NC_016915	CT	4	8	454531	454538	0 %	50 %	0 %	50 %	379018980
11604	NC_016915	TGT	2	6	454683	454688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018981
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11611	NC_016915	ATTT	2	8	454950	454957	25 %	75 %	0 %	0 %	379018981
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11614	NC_016915	TGAC	2	8	455221	455228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11615	NC_016915	AGG	2	6	455233	455238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11621	NC_016915	TTA	2	6	455454	455459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_016915	GAA	2	6	455460	455465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_016915	T	6	6	455468	455473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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