MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016915	CAA	2	6	276834	276839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_016915	TAC	2	6	276904	276909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_016915	TAT	2	6	276937	276942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_016915	TA	3	6	276977	276982	50 %	50 %	0 %	0 %	379018773
7005	NC_016915	TAT	2	6	277025	277030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018773
7006	NC_016915	AAG	2	6	277053	277058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018773
7007	NC_016915	CTT	2	6	277065	277070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018773
7008	NC_016915	TTA	2	6	277100	277105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018773
7009	NC_016915	TTG	2	6	277149	277154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018773
7010	NC_016915	GTC	2	6	277167	277172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018773
7011	NC_016915	AGC	2	6	277179	277184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018773
7012	NC_016915	TGC	2	6	277224	277229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_016915	A	7	7	277263	277269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_016915	A	6	6	277312	277317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_016915	TAT	2	6	277387	277392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_016915	TAG	2	6	277436	277441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_016915	TAT	2	6	277483	277488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_016915	ACC	2	6	277521	277526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_016915	GGT	2	6	277543	277548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_016915	ATA	2	6	277603	277608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018774
7021	NC_016915	ATT	2	6	277610	277615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018774
7022	NC_016915	AGC	2	6	277688	277693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018774
7023	NC_016915	AGC	2	6	277726	277731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_016915	AAT	2	6	277756	277761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_016915	AT	3	6	277766	277771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_016915	GTC	2	6	277823	277828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_016915	TTG	2	6	277849	277854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_016915	A	6	6	277897	277902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_016915	TA	3	6	277935	277940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_016915	A	6	6	277949	277954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_016915	CAA	2	6	277995	278000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_016915	GAAA	2	8	278030	278037	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_016915	TAT	2	6	278040	278045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_016915	TAT	2	6	278051	278056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_016915	TCT	3	9	278104	278112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018775
7036	NC_016915	AGATG	2	10	278136	278145	40 %	20 %	40 %	0 %	379018775
7037	NC_016915	TATCT	2	10	278150	278159	20 %	60 %	0 %	20 %	379018775
7038	NC_016915	AGTA	2	8	278181	278188	50 %	25 %	25 %	0 %	379018775
7039	NC_016915	CATG	2	8	278247	278254	25 %	25 %	25 %	25 %	379018775
7040	NC_016915	GATG	2	8	278427	278434	25 %	25 %	50 %	0 %	379018775
7041	NC_016915	GCG	2	6	278440	278445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379018775
7042	NC_016915	GCA	2	6	278446	278451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018775
7043	NC_016915	GAA	2	6	278551	278556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018775
7044	NC_016915	CGGT	2	8	278618	278625	0 %	25 %	50 %	25 %	379018775
7045	NC_016915	TA	4	8	278681	278688	50 %	50 %	0 %	0 %	379018775
7046	NC_016915	ATA	2	6	278690	278695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018775
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7048	NC_016915	GTA	2	6	278807	278812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018775
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7050	NC_016915	AAGGC	2	10	278899	278908	40 %	0 %	40 %	20 %	379018775
7051	NC_016915	TTG	2	6	278909	278914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018775
7052	NC_016915	TGA	2	6	278970	278975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018775
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7054	NC_016915	AGT	2	6	279033	279038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018775
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7056	NC_016915	TGCT	2	8	279092	279099	0 %	50 %	25 %	25 %	379018775
7057	NC_016915	TGA	2	6	279122	279127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018775
7058	NC_016915	AAG	2	6	279134	279139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018775
7059	NC_016915	AGT	3	9	279168	279176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018775
7060	NC_016915	TA	3	6	279189	279194	50 %	50 %	0 %	0 %	379018775
7061	NC_016915	ACTA	2	8	279237	279244	50 %	25 %	0 %	25 %	379018775
7062	NC_016915	ATA	2	6	279268	279273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018775
7063	NC_016915	TAT	2	6	279276	279281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018775
7064	NC_016915	GTTG	2	8	279366	279373	0 %	50 %	50 %	0 %	379018775
7065	NC_016915	TTAAAG	2	12	279584	279595	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379018775
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7069	NC_016915	TGA	2	6	279783	279788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018775
7070	NC_016915	GTA	2	6	279815	279820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018775
7071	NC_016915	TGT	2	6	279833	279838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018775
7072	NC_016915	TCT	2	6	279839	279844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018775
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7089	NC_016915	GAT	2	6	280702	280707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018775
7090	NC_016915	GTCT	2	8	280722	280729	0 %	50 %	25 %	25 %	379018775
7091	NC_016915	CTG	2	6	280745	280750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018775
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7095	NC_016915	TTG	2	6	280913	280918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_016915	CAA	2	6	280991	280996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7099	NC_016915	TTA	2	6	281097	281102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_016915	A	9	9	281135	281143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_016915	TC	3	6	281177	281182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7103	NC_016915	TAA	2	6	281185	281190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_016915	T	7	7	281231	281237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_016915	ACT	2	6	281238	281243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7108	NC_016915	TAT	2	6	281365	281370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_016915	TCTA	2	8	281437	281444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7110	NC_016915	ATT	2	6	281458	281463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_016915	ATT	2	6	281474	281479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_016915	TGT	2	6	281500	281505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_016915	T	6	6	281535	281540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_016915	ATT	2	6	281544	281549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_016915	TGTT	2	8	281568	281575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_016915	TA	3	6	281601	281606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_016915	AT	3	6	281608	281613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7123	NC_016915	ATTGG	2	10	281767	281776	20 %	40 %	40 %	0 %	379018776
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