MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_016914	TGT	2	6	1218979	1218984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018441
31003	NC_016914	A	8	8	1219020	1219027	100 %	0 %	0 %	0 %	379018441
31004	NC_016914	TAT	2	6	1219134	1219139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018441
31005	NC_016914	ATT	2	6	1219244	1219249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018441
31006	NC_016914	AT	3	6	1219312	1219317	50 %	50 %	0 %	0 %	379018441
31007	NC_016914	CAAT	2	8	1219353	1219360	50 %	25 %	0 %	25 %	379018441
31008	NC_016914	GAA	2	6	1219487	1219492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018441
31009	NC_016914	ATT	2	6	1219573	1219578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018441
31010	NC_016914	TTA	2	6	1219649	1219654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018441
31011	NC_016914	ATTT	2	8	1219674	1219681	25 %	75 %	0 %	0 %	379018441
31012	NC_016914	T	6	6	1219861	1219866	0 %	100 %	0 %	0 %	379018441
31013	NC_016914	ATT	2	6	1219867	1219872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018441
31014	NC_016914	TAA	2	6	1219876	1219881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018441
31015	NC_016914	TATTT	2	10	1219933	1219942	20 %	80 %	0 %	0 %	379018441
31016	NC_016914	A	6	6	1219957	1219962	100 %	0 %	0 %	0 %	379018441
31017	NC_016914	A	7	7	1219968	1219974	100 %	0 %	0 %	0 %	379018441
31018	NC_016914	ATT	2	6	1220064	1220069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018441
31019	NC_016914	ACA	2	6	1220092	1220097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018441
31020	NC_016914	TAAA	2	8	1220118	1220125	75 %	25 %	0 %	0 %	379018441
31021	NC_016914	ATT	2	6	1220130	1220135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018441
31022	NC_016914	ATC	2	6	1220169	1220174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018441
31023	NC_016914	TAT	2	6	1220209	1220214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018441
31024	NC_016914	CAT	2	6	1220294	1220299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018442
31025	NC_016914	GCA	2	6	1220305	1220310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018442
31026	NC_016914	ATTGCT	2	12	1220406	1220417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379018442
31027	NC_016914	CAG	2	6	1220573	1220578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018442
31028	NC_016914	TAG	2	6	1220600	1220605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018442
31029	NC_016914	GTT	2	6	1220614	1220619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018442
31030	NC_016914	TAAAA	2	10	1220673	1220682	80 %	20 %	0 %	0 %	379018442
31031	NC_016914	CTG	2	6	1220846	1220851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018442
31032	NC_016914	ATC	2	6	1220943	1220948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018442
31033	NC_016914	TGCT	2	8	1220967	1220974	0 %	50 %	25 %	25 %	379018442
31034	NC_016914	GGA	2	6	1220979	1220984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018442
31035	NC_016914	ATT	2	6	1221051	1221056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018442
31036	NC_016914	AAC	2	6	1221099	1221104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018442
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31039	NC_016914	A	6	6	1221254	1221259	100 %	0 %	0 %	0 %	379018443
31040	NC_016914	ATA	2	6	1221286	1221291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018443
31041	NC_016914	CTAT	2	8	1221327	1221334	25 %	50 %	0 %	25 %	379018443
31042	NC_016914	T	6	6	1221349	1221354	0 %	100 %	0 %	0 %	379018443
31043	NC_016914	AAT	2	6	1221366	1221371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018443
31044	NC_016914	TAA	2	6	1221464	1221469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018443
31045	NC_016914	TTGC	2	8	1221470	1221477	0 %	50 %	25 %	25 %	379018443
31046	NC_016914	TCT	2	6	1221483	1221488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018443
31047	NC_016914	TCA	2	6	1221507	1221512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018443
31048	NC_016914	CTA	2	6	1221529	1221534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018443
31049	NC_016914	ATTA	2	8	1221554	1221561	50 %	50 %	0 %	0 %	379018443
31050	NC_016914	A	7	7	1221608	1221614	100 %	0 %	0 %	0 %	379018443
31051	NC_016914	ATT	2	6	1221618	1221623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018443
31052	NC_016914	TA	3	6	1221652	1221657	50 %	50 %	0 %	0 %	379018443
31053	NC_016914	ATTA	2	8	1221671	1221678	50 %	50 %	0 %	0 %	379018443
31054	NC_016914	ATTT	2	8	1221700	1221707	25 %	75 %	0 %	0 %	379018443
31055	NC_016914	TAT	2	6	1221713	1221718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018443
31056	NC_016914	TTA	2	6	1221721	1221726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018443
31057	NC_016914	ATC	2	6	1221789	1221794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018443
31058	NC_016914	CTA	2	6	1221799	1221804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018443
31059	NC_016914	ATA	3	9	1221935	1221943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018443
31060	NC_016914	GCT	2	6	1222014	1222019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018443
31061	NC_016914	TTA	2	6	1222032	1222037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018443
31062	NC_016914	TA	3	6	1222046	1222051	50 %	50 %	0 %	0 %	379018443
31063	NC_016914	T	6	6	1222078	1222083	0 %	100 %	0 %	0 %	379018443
31064	NC_016914	GAA	2	6	1222332	1222337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018443
31065	NC_016914	CTT	2	6	1222345	1222350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018443
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31069	NC_016914	CTT	2	6	1222420	1222425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018443
31070	NC_016914	CTA	2	6	1222426	1222431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018443
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31073	NC_016914	T	6	6	1222580	1222585	0 %	100 %	0 %	0 %	379018443
31074	NC_016914	TAAG	2	8	1222590	1222597	50 %	25 %	25 %	0 %	379018443
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31077	NC_016914	TATT	2	8	1222743	1222750	25 %	75 %	0 %	0 %	379018443
31078	NC_016914	TAA	2	6	1222762	1222767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018443
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31083	NC_016914	TAG	2	6	1222846	1222851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018443
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31086	NC_016914	AT	3	6	1223053	1223058	50 %	50 %	0 %	0 %	379018443
31087	NC_016914	T	7	7	1223079	1223085	0 %	100 %	0 %	0 %	379018443
31088	NC_016914	TTC	2	6	1223102	1223107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018443
31089	NC_016914	TAA	3	9	1223120	1223128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018443
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31091	NC_016914	AAG	2	6	1223199	1223204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018444
31092	NC_016914	TCA	2	6	1223273	1223278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018444
31093	NC_016914	TC	3	6	1223311	1223316	0 %	50 %	0 %	50 %	379018444
31094	NC_016914	CT	3	6	1223464	1223469	0 %	50 %	0 %	50 %	379018444
31095	NC_016914	TCA	2	6	1223474	1223479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018444
31096	NC_016914	AT	3	6	1223489	1223494	50 %	50 %	0 %	0 %	379018444
31097	NC_016914	AAGC	2	8	1223496	1223503	50 %	0 %	25 %	25 %	379018444
31098	NC_016914	ACC	2	6	1223551	1223556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018444
31099	NC_016914	TGC	2	6	1223561	1223566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018444
31100	NC_016914	GCA	2	6	1223624	1223629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018444
31101	NC_016914	ATC	2	6	1223650	1223655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018444
31102	NC_016914	CAA	2	6	1223658	1223663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018444
31103	NC_016914	ATA	2	6	1223767	1223772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018444
31104	NC_016914	TGC	2	6	1223774	1223779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018444
31105	NC_016914	CATAC	2	10	1223794	1223803	40 %	20 %	0 %	40 %	379018444
31106	NC_016914	TCT	2	6	1223818	1223823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018444
31107	NC_016914	AAT	2	6	1223952	1223957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018444
31108	NC_016914	AAT	2	6	1223971	1223976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018444
31109	NC_016914	T	6	6	1223992	1223997	0 %	100 %	0 %	0 %	379018444
31110	NC_016914	TAT	3	9	1224005	1224013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31111	NC_016914	GAAA	2	8	1224017	1224024	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31112	NC_016914	TTAA	2	8	1224055	1224062	50 %	50 %	0 %	0 %	379018445
31113	NC_016914	CTC	2	6	1224178	1224183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018445
31114	NC_016914	T	7	7	1224189	1224195	0 %	100 %	0 %	0 %	379018445
31115	NC_016914	T	6	6	1224210	1224215	0 %	100 %	0 %	0 %	379018445
31116	NC_016914	TAT	3	9	1224226	1224234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018445
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31118	NC_016914	GAAT	2	8	1224347	1224354	50 %	25 %	25 %	0 %	379018445
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31477	NC_016914	TTACTA	2	12	1237559	1237570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379018454
31478	NC_016914	TAA	2	6	1237843	1237848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018455
31479	NC_016914	TAA	2	6	1237852	1237857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018455
31480	NC_016914	TAT	2	6	1237864	1237869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018455
31481	NC_016914	AAT	2	6	1238003	1238008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018455
31482	NC_016914	AGA	2	6	1238049	1238054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018455
31483	NC_016914	A	6	6	1238064	1238069	100 %	0 %	0 %	0 %	379018455
31484	NC_016914	ATC	2	6	1238073	1238078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018455
31485	NC_016914	CGC	2	6	1238089	1238094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018455
31486	NC_016914	TTC	2	6	1238117	1238122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018455
31487	NC_016914	A	7	7	1238140	1238146	100 %	0 %	0 %	0 %	379018455
31488	NC_016914	ATT	2	6	1238174	1238179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018455
31489	NC_016914	TTA	2	6	1238215	1238220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018455
31490	NC_016914	ATA	3	9	1238224	1238232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018455
31491	NC_016914	AATA	3	12	1238252	1238263	75 %	25 %	0 %	0 %	379018455
31492	NC_016914	AGC	2	6	1238265	1238270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018455
31493	NC_016914	TTG	2	6	1238351	1238356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31494	NC_016914	AAT	2	6	1238373	1238378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31495	NC_016914	CAT	2	6	1238384	1238389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31496	NC_016914	AAT	2	6	1238490	1238495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31497	NC_016914	TAT	2	6	1238550	1238555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31498	NC_016914	A	7	7	1238680	1238686	100 %	0 %	0 %	0 %	379018456
31499	NC_016914	ATT	2	6	1238821	1238826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018456
31500	NC_016914	CGA	3	9	1238883	1238891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018456

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