MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_016914	GCA	2	6	1181775	1181780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30002	NC_016914	GTA	2	6	1181796	1181801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018401
30003	NC_016914	TAA	2	6	1181806	1181811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30004	NC_016914	ATT	2	6	1181921	1181926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30005	NC_016914	TAT	2	6	1181938	1181943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30006	NC_016914	CAC	2	6	1181957	1181962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018401
30007	NC_016914	CTG	2	6	1181983	1181988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30008	NC_016914	GTA	2	6	1182012	1182017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018401
30009	NC_016914	TAA	2	6	1182022	1182027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30010	NC_016914	ATTTAA	2	12	1182122	1182133	50 %	50 %	0 %	0 %	379018401
30011	NC_016914	TGCATT	2	12	1182185	1182196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379018401
30012	NC_016914	GCA	2	6	1182216	1182221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30013	NC_016914	GTA	2	6	1182237	1182242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018401
30014	NC_016914	TAA	2	6	1182247	1182252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30015	NC_016914	ATT	2	6	1182362	1182367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30016	NC_016914	TAT	2	6	1182379	1182384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30017	NC_016914	CAC	2	6	1182398	1182403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018401
30018	NC_016914	CTG	2	6	1182424	1182429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30019	NC_016914	GCA	2	6	1182432	1182437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30020	NC_016914	GTA	2	6	1182453	1182458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018401
30021	NC_016914	TAA	2	6	1182463	1182468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30022	NC_016914	ATTTAA	2	12	1182563	1182574	50 %	50 %	0 %	0 %	379018401
30023	NC_016914	TGCATT	2	12	1182626	1182637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379018401
30024	NC_016914	GCA	2	6	1182657	1182662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30025	NC_016914	GTA	2	6	1182678	1182683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018401
30026	NC_016914	TAA	2	6	1182688	1182693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30027	NC_016914	ATT	2	6	1182803	1182808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30028	NC_016914	TAT	2	6	1182820	1182825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30029	NC_016914	CAC	2	6	1182839	1182844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018401
30030	NC_016914	CTG	2	6	1182865	1182870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30031	NC_016914	CTTGTA	2	12	1182916	1182927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379018401
30032	NC_016914	ATT	2	6	1183019	1183024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30033	NC_016914	TAT	2	6	1183036	1183041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30034	NC_016914	CAC	2	6	1183055	1183060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018401
30035	NC_016914	CTG	2	6	1183081	1183086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30036	NC_016914	GCA	2	6	1183089	1183094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30037	NC_016914	GTA	2	6	1183110	1183115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018401
30038	NC_016914	TAA	2	6	1183120	1183125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30039	NC_016914	ATTTAA	2	12	1183220	1183231	50 %	50 %	0 %	0 %	379018401
30040	NC_016914	TGCATT	2	12	1183283	1183294	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379018401
30041	NC_016914	GCA	2	6	1183314	1183319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30042	NC_016914	GTA	2	6	1183335	1183340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018401
30043	NC_016914	TAA	2	6	1183345	1183350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30044	NC_016914	GCA	2	6	1183431	1183436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30045	NC_016914	TTA	2	6	1183450	1183455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30046	NC_016914	CCT	2	6	1183458	1183463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018401
30047	NC_016914	GCA	2	6	1183521	1183526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30048	NC_016914	GCA	2	6	1183596	1183601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30049	NC_016914	ATT	2	6	1183607	1183612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30050	NC_016914	CAA	2	6	1183655	1183660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018401
30051	NC_016914	AGT	2	6	1183721	1183726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018401
30052	NC_016914	TAA	2	6	1183747	1183752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30053	NC_016914	CAC	2	6	1183786	1183791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018401
30054	NC_016914	GTAA	2	8	1183793	1183800	50 %	25 %	25 %	0 %	379018401
30055	NC_016914	CAG	2	6	1183825	1183830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30056	NC_016914	ATT	3	9	1183871	1183879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30057	NC_016914	ATT	2	6	1183886	1183891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30058	NC_016914	TGC	2	6	1183898	1183903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018401
30059	NC_016914	ATT	3	9	1183904	1183912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018401
30060	NC_016914	CTA	2	6	1183950	1183955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018401
30061	NC_016914	GGT	2	6	1183979	1183984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018401
30062	NC_016914	TTG	2	6	1184006	1184011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018401
30063	NC_016914	T	6	6	1184018	1184023	0 %	100 %	0 %	0 %	379018401
30064	NC_016914	AAT	2	6	1184025	1184030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018401
30065	NC_016914	T	6	6	1184102	1184107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30066	NC_016914	TAT	2	6	1184116	1184121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30067	NC_016914	TAA	2	6	1184125	1184130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30068	NC_016914	GAT	2	6	1184135	1184140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30069	NC_016914	TTG	2	6	1184185	1184190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018402
30070	NC_016914	CTG	2	6	1184206	1184211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018402
30071	NC_016914	AGGG	2	8	1184244	1184251	25 %	0 %	75 %	0 %	379018402
30072	NC_016914	TAA	2	6	1184317	1184322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30073	NC_016914	CAT	3	9	1184323	1184331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30074	NC_016914	ATA	2	6	1184336	1184341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30075	NC_016914	AAT	2	6	1184364	1184369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30076	NC_016914	TAAT	2	8	1184436	1184443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30077	NC_016914	GT	3	6	1184451	1184456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30078	NC_016914	TTC	2	6	1184477	1184482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30079	NC_016914	ATG	2	6	1184504	1184509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30080	NC_016914	TA	3	6	1184560	1184565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30081	NC_016914	CTA	2	6	1184576	1184581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30082	NC_016914	AT	3	6	1184598	1184603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30083	NC_016914	AT	3	6	1184661	1184666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30084	NC_016914	T	6	6	1184741	1184746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30085	NC_016914	CAA	2	6	1184787	1184792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30086	NC_016914	A	6	6	1184819	1184824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30087	NC_016914	AAT	2	6	1184842	1184847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018403
30088	NC_016914	TC	3	6	1184849	1184854	0 %	50 %	0 %	50 %	379018403
30089	NC_016914	GGT	2	6	1184872	1184877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018403
30090	NC_016914	TCT	2	6	1184900	1184905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018403
30091	NC_016914	T	6	6	1185000	1185005	0 %	100 %	0 %	0 %	379018403
30092	NC_016914	TCA	2	6	1185016	1185021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018403
30093	NC_016914	CTA	2	6	1185046	1185051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018403
30094	NC_016914	TCT	2	6	1185055	1185060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018403
30095	NC_016914	AT	3	6	1185085	1185090	50 %	50 %	0 %	0 %	379018403
30096	NC_016914	CT	4	8	1185101	1185108	0 %	50 %	0 %	50 %	379018403
30097	NC_016914	ATAA	2	8	1185190	1185197	75 %	25 %	0 %	0 %	379018403
30098	NC_016914	TAA	2	6	1185317	1185322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018403
30099	NC_016914	ATA	3	9	1185349	1185357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018403
30100	NC_016914	TGCC	2	8	1185362	1185369	0 %	25 %	25 %	50 %	379018403
30101	NC_016914	TCA	2	6	1185445	1185450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018403
30102	NC_016914	TCA	2	6	1185626	1185631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018403
30103	NC_016914	CAT	2	6	1185728	1185733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018403
30104	NC_016914	ATCA	2	8	1185759	1185766	50 %	25 %	0 %	25 %	379018403
30105	NC_016914	TTC	2	6	1185780	1185785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018403
30106	NC_016914	ATC	2	6	1185814	1185819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018403
30107	NC_016914	GGT	2	6	1185849	1185854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018403
30108	NC_016914	CTA	2	6	1185860	1185865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018403
30109	NC_016914	GCT	2	6	1186001	1186006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018403
30110	NC_016914	TTG	2	6	1186058	1186063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018403
30111	NC_016914	CTA	2	6	1186103	1186108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018403
30112	NC_016914	CTG	2	6	1186127	1186132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018403
30113	NC_016914	ACC	2	6	1186156	1186161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018403
30114	NC_016914	TTGA	2	8	1186167	1186174	25 %	50 %	25 %	0 %	379018403
30115	NC_016914	ATTA	2	8	1186176	1186183	50 %	50 %	0 %	0 %	379018403
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30117	NC_016914	ATG	2	6	1186269	1186274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018403
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30481	NC_016914	TTC	2	6	1199305	1199310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30482	NC_016914	CTG	2	6	1199388	1199393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30483	NC_016914	ATTTA	2	10	1199400	1199409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30484	NC_016914	T	6	6	1199423	1199428	0 %	100 %	0 %	0 %	379018420
30485	NC_016914	T	6	6	1199433	1199438	0 %	100 %	0 %	0 %	379018420
30486	NC_016914	AT	3	6	1199462	1199467	50 %	50 %	0 %	0 %	379018420
30487	NC_016914	ATTT	2	8	1199484	1199491	25 %	75 %	0 %	0 %	379018420
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30497	NC_016914	T	6	6	1199784	1199789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30498	NC_016914	CAT	2	6	1199796	1199801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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