MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_016914	A	6	6	1120111	1120116	100 %	0 %	0 %	0 %	379018345
28503	NC_016914	TTA	2	6	1120117	1120122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018345
28504	NC_016914	A	6	6	1120152	1120157	100 %	0 %	0 %	0 %	379018345
28505	NC_016914	TA	4	8	1120187	1120194	50 %	50 %	0 %	0 %	379018345
28506	NC_016914	TAA	2	6	1120244	1120249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28507	NC_016914	TAA	2	6	1120260	1120265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28508	NC_016914	ATTA	2	8	1120266	1120273	50 %	50 %	0 %	0 %	379018345
28509	NC_016914	ACT	2	6	1120289	1120294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018345
28510	NC_016914	TAA	2	6	1120329	1120334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28511	NC_016914	T	6	6	1120400	1120405	0 %	100 %	0 %	0 %	379018345
28512	NC_016914	TA	3	6	1120421	1120426	50 %	50 %	0 %	0 %	379018345
28513	NC_016914	TAA	3	9	1120443	1120451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28514	NC_016914	AGC	2	6	1120513	1120518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018345
28515	NC_016914	ATA	2	6	1120550	1120555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28516	NC_016914	CTAT	2	8	1120570	1120577	25 %	50 %	0 %	25 %	379018345
28517	NC_016914	TAA	3	9	1120640	1120648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28518	NC_016914	A	6	6	1120672	1120677	100 %	0 %	0 %	0 %	379018345
28519	NC_016914	TAA	2	6	1120758	1120763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28520	NC_016914	AGA	3	9	1120824	1120832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018345
28521	NC_016914	TAT	2	6	1120890	1120895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018345
28522	NC_016914	AGA	2	6	1120905	1120910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018345
28523	NC_016914	ATA	2	6	1121018	1121023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28524	NC_016914	TAT	2	6	1121171	1121176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018345
28525	NC_016914	CAA	2	6	1121213	1121218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018345
28526	NC_016914	TAA	3	9	1121232	1121240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28527	NC_016914	ACAA	2	8	1121291	1121298	75 %	0 %	0 %	25 %	379018345
28528	NC_016914	TAG	2	6	1121315	1121320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018345
28529	NC_016914	ATTT	2	8	1121343	1121350	25 %	75 %	0 %	0 %	379018345
28530	NC_016914	A	6	6	1121427	1121432	100 %	0 %	0 %	0 %	379018345
28531	NC_016914	GAAAAA	2	12	1121449	1121460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379018345
28532	NC_016914	T	6	6	1121465	1121470	0 %	100 %	0 %	0 %	379018345
28533	NC_016914	AGA	2	6	1121487	1121492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018345
28534	NC_016914	AGG	2	6	1121498	1121503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018345
28535	NC_016914	AGG	2	6	1121505	1121510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018345
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28539	NC_016914	TA	3	6	1121621	1121626	50 %	50 %	0 %	0 %	379018345
28540	NC_016914	TGA	2	6	1121634	1121639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018345
28541	NC_016914	GA	3	6	1121668	1121673	50 %	0 %	50 %	0 %	379018345
28542	NC_016914	TAA	2	6	1121691	1121696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28543	NC_016914	GCA	2	6	1121725	1121730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018345
28544	NC_016914	TGC	2	6	1121787	1121792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018345
28545	NC_016914	TAT	2	6	1121827	1121832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018345
28546	NC_016914	ATA	2	6	1121834	1121839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28547	NC_016914	TAA	2	6	1121853	1121858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28548	NC_016914	TTTA	2	8	1121899	1121906	25 %	75 %	0 %	0 %	379018345
28549	NC_016914	TAAT	2	8	1121951	1121958	50 %	50 %	0 %	0 %	379018345
28550	NC_016914	ATT	2	6	1121965	1121970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018345
28551	NC_016914	AGA	2	6	1121991	1121996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018345
28552	NC_016914	AAGC	2	8	1122018	1122025	50 %	0 %	25 %	25 %	379018345
28553	NC_016914	AGG	2	6	1122158	1122163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018345
28554	NC_016914	A	7	7	1122178	1122184	100 %	0 %	0 %	0 %	379018345
28555	NC_016914	AAC	2	6	1122191	1122196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018345
28556	NC_016914	TCC	2	6	1122204	1122209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018345
28557	NC_016914	TA	3	6	1122230	1122235	50 %	50 %	0 %	0 %	379018345
28558	NC_016914	TAT	2	6	1122281	1122286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28559	NC_016914	A	8	8	1122294	1122301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28560	NC_016914	AAT	2	6	1122342	1122347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28561	NC_016914	TTA	2	6	1122348	1122353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28562	NC_016914	AAC	2	6	1122365	1122370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28563	NC_016914	A	7	7	1122396	1122402	100 %	0 %	0 %	0 %	379018346
28564	NC_016914	GAT	2	6	1122460	1122465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018346
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28567	NC_016914	AAT	2	6	1122613	1122618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018346
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28569	NC_016914	T	6	6	1122663	1122668	0 %	100 %	0 %	0 %	379018346
28570	NC_016914	AGA	2	6	1122684	1122689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018346
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28572	NC_016914	TTACT	2	10	1122705	1122714	20 %	60 %	0 %	20 %	379018346
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28591	NC_016914	TTAA	2	8	1123687	1123694	50 %	50 %	0 %	0 %	379018346
28592	NC_016914	TAC	2	6	1123837	1123842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018346
28593	NC_016914	ACA	2	6	1124006	1124011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018346
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28598	NC_016914	ACCTCC	2	12	1124313	1124324	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	379018346
28599	NC_016914	TTC	2	6	1124376	1124381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018346
28600	NC_016914	AT	3	6	1124418	1124423	50 %	50 %	0 %	0 %	379018346
28601	NC_016914	GA	3	6	1124441	1124446	50 %	0 %	50 %	0 %	379018346
28602	NC_016914	AT	3	6	1124553	1124558	50 %	50 %	0 %	0 %	379018346
28603	NC_016914	AT	3	6	1124568	1124573	50 %	50 %	0 %	0 %	379018346
28604	NC_016914	TGC	2	6	1124630	1124635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018346
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28606	NC_016914	CAA	2	6	1124712	1124717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018346
28607	NC_016914	A	9	9	1124743	1124751	100 %	0 %	0 %	0 %	379018346
28608	NC_016914	A	6	6	1124785	1124790	100 %	0 %	0 %	0 %	379018346
28609	NC_016914	AGA	2	6	1124817	1124822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018346
28610	NC_016914	ATAA	2	8	1124869	1124876	75 %	25 %	0 %	0 %	379018346
28611	NC_016914	CTC	2	6	1125047	1125052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018346
28612	NC_016914	CGA	2	6	1125245	1125250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018346
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28615	NC_016914	A	6	6	1125466	1125471	100 %	0 %	0 %	0 %	379018346
28616	NC_016914	CAA	2	6	1125527	1125532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018346
28617	NC_016914	ACAAT	2	10	1125542	1125551	60 %	20 %	0 %	20 %	379018346
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