MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_016914	TTA	2	6	1099314	1099319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28003	NC_016914	ACTAA	2	10	1099349	1099358	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28004	NC_016914	TA	3	6	1099379	1099384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28005	NC_016914	ATT	2	6	1099387	1099392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28006	NC_016914	TTA	2	6	1099393	1099398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28007	NC_016914	TA	3	6	1099471	1099476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28008	NC_016914	ATAG	2	8	1099487	1099494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28009	NC_016914	TA	4	8	1099548	1099555	50 %	50 %	0 %	0 %	379018326
28010	NC_016914	AGT	2	6	1099580	1099585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018326
28011	NC_016914	AG	3	6	1099628	1099633	50 %	0 %	50 %	0 %	379018326
28012	NC_016914	TAG	3	9	1099722	1099730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018326
28013	NC_016914	TAA	2	6	1099747	1099752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018326
28014	NC_016914	AATG	2	8	1099773	1099780	50 %	25 %	25 %	0 %	379018326
28015	NC_016914	TAG	2	6	1099818	1099823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018327
28016	NC_016914	T	7	7	1099833	1099839	0 %	100 %	0 %	0 %	379018327
28017	NC_016914	AAGC	2	8	1099868	1099875	50 %	0 %	25 %	25 %	379018327
28018	NC_016914	AGC	2	6	1099884	1099889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018327
28019	NC_016914	ACT	2	6	1099921	1099926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018327
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28021	NC_016914	TGA	2	6	1099984	1099989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018327
28022	NC_016914	AAT	2	6	1099997	1100002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018327
28023	NC_016914	TTG	2	6	1100052	1100057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018327
28024	NC_016914	T	6	6	1100060	1100065	0 %	100 %	0 %	0 %	379018327
28025	NC_016914	AAT	2	6	1100080	1100085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018327
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28033	NC_016914	TGA	2	6	1100337	1100342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018327
28034	NC_016914	TAT	2	6	1100465	1100470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018327
28035	NC_016914	AGT	3	9	1100475	1100483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018327
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28037	NC_016914	TGTTCT	2	12	1100610	1100621	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379018327
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28040	NC_016914	GAAG	2	8	1100680	1100687	50 %	0 %	50 %	0 %	379018327
28041	NC_016914	CGC	2	6	1100693	1100698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018327
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28048	NC_016914	CT	3	6	1100936	1100941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28049	NC_016914	TAT	2	6	1100984	1100989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28050	NC_016914	TAA	2	6	1100997	1101002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28051	NC_016914	ACAT	2	8	1101039	1101046	50 %	25 %	0 %	25 %	379018329
28052	NC_016914	T	7	7	1101063	1101069	0 %	100 %	0 %	0 %	379018329
28053	NC_016914	GAT	2	6	1101114	1101119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018329
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28055	NC_016914	TAAA	2	8	1101151	1101158	75 %	25 %	0 %	0 %	379018329
28056	NC_016914	CTA	2	6	1101187	1101192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018329
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28091	NC_016914	TAA	3	9	1102692	1102700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28092	NC_016914	TTAC	2	8	1102723	1102730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28093	NC_016914	AAAAT	2	10	1102760	1102769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28103	NC_016914	TTA	2	6	1103190	1103195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018331
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28105	NC_016914	AT	3	6	1103243	1103248	50 %	50 %	0 %	0 %	379018331
28106	NC_016914	GGA	2	6	1103252	1103257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018331
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28479	NC_016914	GATTA	2	10	1119016	1119025	40 %	40 %	20 %	0 %	379018343
28480	NC_016914	TAC	2	6	1119058	1119063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018343
28481	NC_016914	GAA	2	6	1119068	1119073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018343
28482	NC_016914	AT	3	6	1119091	1119096	50 %	50 %	0 %	0 %	379018343
28483	NC_016914	A	8	8	1119184	1119191	100 %	0 %	0 %	0 %	379018343
28484	NC_016914	GAA	2	6	1119360	1119365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018343
28485	NC_016914	GGA	2	6	1119443	1119448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018343
28486	NC_016914	A	6	6	1119453	1119458	100 %	0 %	0 %	0 %	379018343
28487	NC_016914	AAT	2	6	1119474	1119479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018343
28488	NC_016914	TTA	2	6	1119483	1119488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28489	NC_016914	GTT	3	9	1119511	1119519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28490	NC_016914	TTG	2	6	1119529	1119534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018344
28491	NC_016914	GCT	2	6	1119591	1119596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018344
28492	NC_016914	TA	3	6	1119639	1119644	50 %	50 %	0 %	0 %	379018344
28493	NC_016914	TTA	2	6	1119663	1119668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018344
28494	NC_016914	GAC	2	6	1119758	1119763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28495	NC_016914	AT	4	8	1119854	1119861	50 %	50 %	0 %	0 %	379018345
28496	NC_016914	TACTT	2	10	1119912	1119921	20 %	60 %	0 %	20 %	379018345
28497	NC_016914	TAC	2	6	1119938	1119943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018345
28498	NC_016914	ATA	2	6	1119986	1119991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018345
28499	NC_016914	A	6	6	1120026	1120031	100 %	0 %	0 %	0 %	379018345
28500	NC_016914	TACA	2	8	1120064	1120071	50 %	25 %	0 %	25 %	379018345

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