MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_016914	GCA	2	6	1080503	1080508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018308
27503	NC_016914	AAGC	2	8	1080510	1080517	50 %	0 %	25 %	25 %	379018308
27504	NC_016914	CAAG	2	8	1080525	1080532	50 %	0 %	25 %	25 %	379018308
27505	NC_016914	TA	3	6	1080550	1080555	50 %	50 %	0 %	0 %	379018308
27506	NC_016914	TC	4	8	1080584	1080591	0 %	50 %	0 %	50 %	379018308
27507	NC_016914	TA	3	6	1080603	1080608	50 %	50 %	0 %	0 %	379018308
27508	NC_016914	TAC	2	6	1080721	1080726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018308
27509	NC_016914	CTT	2	6	1080788	1080793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018308
27510	NC_016914	AG	3	6	1080799	1080804	50 %	0 %	50 %	0 %	379018308
27511	NC_016914	ACT	2	6	1080834	1080839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018308
27512	NC_016914	GGC	2	6	1080870	1080875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379018308
27513	NC_016914	TAT	2	6	1080881	1080886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018308
27514	NC_016914	CAG	2	6	1080898	1080903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018308
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27516	NC_016914	AGT	2	6	1080918	1080923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018308
27517	NC_016914	CAG	2	6	1080973	1080978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018308
27518	NC_016914	CTC	2	6	1081016	1081021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018308
27519	NC_016914	ATT	2	6	1081035	1081040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018308
27520	NC_016914	TGA	2	6	1081049	1081054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018308
27521	NC_016914	AAT	2	6	1081067	1081072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018308
27522	NC_016914	TAA	2	6	1081073	1081078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018308
27523	NC_016914	ATAAAT	2	12	1081120	1081131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018308
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27525	NC_016914	A	6	6	1081178	1081183	100 %	0 %	0 %	0 %	379018308
27526	NC_016914	TA	3	6	1081230	1081235	50 %	50 %	0 %	0 %	379018308
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27530	NC_016914	TAT	2	6	1081463	1081468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27531	NC_016914	ATC	2	6	1081483	1081488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27532	NC_016914	GCGA	2	8	1081492	1081499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27533	NC_016914	CCT	2	6	1081547	1081552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27534	NC_016914	AAG	2	6	1081629	1081634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27535	NC_016914	TC	3	6	1081669	1081674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27536	NC_016914	A	6	6	1081687	1081692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27537	NC_016914	ATC	2	6	1081713	1081718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27538	NC_016914	AT	3	6	1081735	1081740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27539	NC_016914	ATTT	2	8	1081743	1081750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27540	NC_016914	ATTA	2	8	1081799	1081806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27541	NC_016914	CAT	2	6	1081909	1081914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018309
27542	NC_016914	TCA	2	6	1081940	1081945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018309
27543	NC_016914	TA	3	6	1081947	1081952	50 %	50 %	0 %	0 %	379018309
27544	NC_016914	A	6	6	1081973	1081978	100 %	0 %	0 %	0 %	379018309
27545	NC_016914	TA	3	6	1081982	1081987	50 %	50 %	0 %	0 %	379018309
27546	NC_016914	ATA	2	6	1081992	1081997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018309
27547	NC_016914	TAC	2	6	1082058	1082063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018309
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27552	NC_016914	ACGGT	2	10	1082169	1082178	20 %	20 %	40 %	20 %	379018309
27553	NC_016914	AATG	2	8	1082206	1082213	50 %	25 %	25 %	0 %	379018309
27554	NC_016914	TA	3	6	1082216	1082221	50 %	50 %	0 %	0 %	379018309
27555	NC_016914	TC	3	6	1082223	1082228	0 %	50 %	0 %	50 %	379018309
27556	NC_016914	AATG	2	8	1082273	1082280	50 %	25 %	25 %	0 %	379018309
27557	NC_016914	AGA	2	6	1082287	1082292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018309
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27579	NC_016914	TTA	2	6	1083071	1083076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018309
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27584	NC_016914	AGCTTA	2	12	1083308	1083319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27585	NC_016914	TTA	2	6	1083331	1083336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27586	NC_016914	GGT	2	6	1083393	1083398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27587	NC_016914	AGTTTA	2	12	1083411	1083422	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27588	NC_016914	TCA	2	6	1083474	1083479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27589	NC_016914	ATTT	2	8	1083484	1083491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27590	NC_016914	A	7	7	1083503	1083509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27591	NC_016914	AAC	2	6	1083575	1083580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27592	NC_016914	A	6	6	1083596	1083601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27593	NC_016914	ATC	3	9	1083632	1083640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27594	NC_016914	CTAC	2	8	1083653	1083660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27595	NC_016914	ATT	2	6	1083683	1083688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27596	NC_016914	TCA	2	6	1083747	1083752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27599	NC_016914	ACAT	2	8	1083792	1083799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27600	NC_016914	ATT	2	6	1083825	1083830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27601	NC_016914	AAT	2	6	1083836	1083841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27602	NC_016914	CTA	2	6	1083844	1083849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27603	NC_016914	CCT	2	6	1083880	1083885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27604	NC_016914	TAAT	2	8	1083886	1083893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27605	NC_016914	GGT	2	6	1083909	1083914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27606	NC_016914	GTT	2	6	1083916	1083921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27607	NC_016914	AAT	2	6	1083926	1083931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27608	NC_016914	TA	5	10	1084009	1084018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27609	NC_016914	TGC	3	9	1084074	1084082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27610	NC_016914	TC	3	6	1084092	1084097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27611	NC_016914	TCA	2	6	1084112	1084117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27612	NC_016914	AG	3	6	1084133	1084138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27613	NC_016914	ACT	2	6	1084145	1084150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27614	NC_016914	AT	3	6	1084172	1084177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27615	NC_016914	ATA	2	6	1084191	1084196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27616	NC_016914	CAAT	2	8	1084224	1084231	50 %	25 %	0 %	25 %	379018310
27617	NC_016914	TA	3	6	1084232	1084237	50 %	50 %	0 %	0 %	379018310
27618	NC_016914	GTA	2	6	1084238	1084243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018310
27619	NC_016914	CTA	2	6	1084253	1084258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018310
27620	NC_016914	ATT	2	6	1084262	1084267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018310
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27983	NC_016914	A	6	6	1098585	1098590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27984	NC_016914	TCA	2	6	1098614	1098619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27985	NC_016914	GTTT	2	8	1098661	1098668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27986	NC_016914	AAT	2	6	1098741	1098746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27988	NC_016914	AGT	2	6	1098777	1098782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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