MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_016914	AAT	2	6	1021902	1021907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018237
26003	NC_016914	ATA	2	6	1021980	1021985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018237
26004	NC_016914	TTCTT	2	10	1021988	1021997	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26005	NC_016914	T	8	8	1022051	1022058	0 %	100 %	0 %	0 %	379018238
26006	NC_016914	GTAA	2	8	1022086	1022093	50 %	25 %	25 %	0 %	379018238
26007	NC_016914	TTTA	2	8	1022130	1022137	25 %	75 %	0 %	0 %	379018238
26008	NC_016914	TAT	2	6	1022183	1022188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018238
26009	NC_016914	TCACT	2	10	1022267	1022276	20 %	40 %	0 %	40 %	379018238
26010	NC_016914	AAT	2	6	1022282	1022287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018238
26011	NC_016914	T	7	7	1022289	1022295	0 %	100 %	0 %	0 %	379018238
26012	NC_016914	TTGT	2	8	1022305	1022312	0 %	75 %	25 %	0 %	379018238
26013	NC_016914	TTG	2	6	1022334	1022339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26014	NC_016914	ATT	2	6	1022406	1022411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26015	NC_016914	A	7	7	1022426	1022432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26016	NC_016914	T	6	6	1022437	1022442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26017	NC_016914	ACA	2	6	1022503	1022508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26018	NC_016914	CAA	2	6	1022512	1022517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26019	NC_016914	ATTA	2	8	1022546	1022553	50 %	50 %	0 %	0 %	379018239
26020	NC_016914	AGA	2	6	1022567	1022572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018239
26021	NC_016914	T	6	6	1022592	1022597	0 %	100 %	0 %	0 %	379018239
26022	NC_016914	T	7	7	1022649	1022655	0 %	100 %	0 %	0 %	379018239
26023	NC_016914	A	6	6	1022725	1022730	100 %	0 %	0 %	0 %	379018239
26024	NC_016914	ATAA	2	8	1022817	1022824	75 %	25 %	0 %	0 %	379018239
26025	NC_016914	CGA	2	6	1022881	1022886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26026	NC_016914	A	6	6	1022959	1022964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26027	NC_016914	TTC	2	6	1022980	1022985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018240
26028	NC_016914	TTA	2	6	1022990	1022995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018240
26029	NC_016914	TTTA	2	8	1023010	1023017	25 %	75 %	0 %	0 %	379018240
26030	NC_016914	T	6	6	1023051	1023056	0 %	100 %	0 %	0 %	379018240
26031	NC_016914	CTT	2	6	1023061	1023066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018240
26032	NC_016914	CTGC	2	8	1023068	1023075	0 %	25 %	25 %	50 %	379018240
26033	NC_016914	T	6	6	1023076	1023081	0 %	100 %	0 %	0 %	379018240
26034	NC_016914	TTC	2	6	1023127	1023132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018240
26035	NC_016914	T	6	6	1023164	1023169	0 %	100 %	0 %	0 %	379018240
26036	NC_016914	TGT	2	6	1023340	1023345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018240
26037	NC_016914	TAA	3	9	1023385	1023393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018240
26038	NC_016914	TTA	2	6	1023414	1023419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018240
26039	NC_016914	T	6	6	1023424	1023429	0 %	100 %	0 %	0 %	379018240
26040	NC_016914	ATT	2	6	1023444	1023449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26041	NC_016914	TAT	3	9	1023456	1023464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26042	NC_016914	CTTA	2	8	1023478	1023485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26043	NC_016914	ATC	2	6	1023487	1023492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26044	NC_016914	T	6	6	1023496	1023501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26045	NC_016914	TCTA	2	8	1023510	1023517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26046	NC_016914	TTC	2	6	1023520	1023525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26047	NC_016914	ATC	2	6	1023532	1023537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26048	NC_016914	T	6	6	1023682	1023687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26049	NC_016914	TAA	2	6	1023702	1023707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26050	NC_016914	TTC	2	6	1023739	1023744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26051	NC_016914	CTTT	2	8	1023776	1023783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26052	NC_016914	TAA	2	6	1023795	1023800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26053	NC_016914	TAT	2	6	1023815	1023820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26054	NC_016914	ATAA	2	8	1023832	1023839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26055	NC_016914	AT	3	6	1023878	1023883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26056	NC_016914	AAAT	2	8	1023896	1023903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26057	NC_016914	A	7	7	1023932	1023938	100 %	0 %	0 %	0 %	379018241
26058	NC_016914	ATATT	2	10	1024011	1024020	40 %	60 %	0 %	0 %	379018241
26059	NC_016914	GATTT	2	10	1024174	1024183	20 %	60 %	20 %	0 %	379018241
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26061	NC_016914	A	6	6	1024251	1024256	100 %	0 %	0 %	0 %	379018241
26062	NC_016914	AAGG	2	8	1024293	1024300	50 %	0 %	50 %	0 %	379018241
26063	NC_016914	CGGT	2	8	1024320	1024327	0 %	25 %	50 %	25 %	379018241
26064	NC_016914	AAG	2	6	1024348	1024353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018241
26065	NC_016914	T	7	7	1024405	1024411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26066	NC_016914	GCT	2	6	1024487	1024492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26071	NC_016914	T	6	6	1024792	1024797	0 %	100 %	0 %	0 %	379018242
26072	NC_016914	CAA	2	6	1024801	1024806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018242
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26075	NC_016914	A	6	6	1025028	1025033	100 %	0 %	0 %	0 %	379018242
26076	NC_016914	T	6	6	1025048	1025053	0 %	100 %	0 %	0 %	379018242
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26080	NC_016914	CA	3	6	1025182	1025187	50 %	0 %	0 %	50 %	379018242
26081	NC_016914	TAC	2	6	1025198	1025203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018242
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26087	NC_016914	T	6	6	1025369	1025374	0 %	100 %	0 %	0 %	379018242
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26091	NC_016914	GTA	2	6	1025467	1025472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018243
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26093	NC_016914	T	6	6	1025584	1025589	0 %	100 %	0 %	0 %	379018243
26094	NC_016914	AAT	2	6	1025636	1025641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018243
26095	NC_016914	TAT	2	6	1025657	1025662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018243
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26098	NC_016914	A	7	7	1025746	1025752	100 %	0 %	0 %	0 %	379018243
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26101	NC_016914	TTAA	2	8	1025926	1025933	50 %	50 %	0 %	0 %	379018243
26102	NC_016914	TAG	2	6	1025957	1025962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018243
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26106	NC_016914	AT	3	6	1026237	1026242	50 %	50 %	0 %	0 %	379018243
26107	NC_016914	TAG	2	6	1026331	1026336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018244
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26109	NC_016914	TAT	2	6	1026368	1026373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018244
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26111	NC_016914	TGAC	2	8	1026470	1026477	25 %	25 %	25 %	25 %	379018244
26112	NC_016914	CAA	2	6	1026530	1026535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018244
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26117	NC_016914	T	6	6	1026646	1026651	0 %	100 %	0 %	0 %	379018244
26118	NC_016914	CTTTT	2	10	1026652	1026661	0 %	80 %	0 %	20 %	379018244
26119	NC_016914	CAT	2	6	1026717	1026722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018244
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