MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_016914	TTAC	2	8	847133	847140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21502	NC_016914	AAC	2	6	847165	847170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21503	NC_016914	AAAT	2	8	847177	847184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21504	NC_016914	AAAGCA	2	12	847209	847220	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379018062
21505	NC_016914	AAT	2	6	847221	847226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018062
21506	NC_016914	TTG	2	6	847309	847314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018062
21507	NC_016914	TCA	2	6	847415	847420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018062
21508	NC_016914	TGA	2	6	847468	847473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018062
21509	NC_016914	TGA	2	6	847493	847498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018062
21510	NC_016914	AAT	2	6	847502	847507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018062
21511	NC_016914	GAT	2	6	847560	847565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018062
21512	NC_016914	AAAT	2	8	847658	847665	75 %	25 %	0 %	0 %	379018062
21513	NC_016914	ATAG	2	8	847695	847702	50 %	25 %	25 %	0 %	379018062
21514	NC_016914	TTGC	2	8	847731	847738	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21515	NC_016914	CAA	2	6	847802	847807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21516	NC_016914	ATTA	2	8	847814	847821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21517	NC_016914	AAG	2	6	847840	847845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21518	NC_016914	T	6	6	847852	847857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21519	NC_016914	A	6	6	847911	847916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21520	NC_016914	CTT	2	6	847931	847936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018063
21521	NC_016914	TAA	2	6	847949	847954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21522	NC_016914	AAG	2	6	848063	848068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018063
21523	NC_016914	ATT	2	6	848072	848077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018063
21524	NC_016914	GTA	2	6	848091	848096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018063
21525	NC_016914	CAT	2	6	848152	848157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018063
21526	NC_016914	AGA	2	6	848220	848225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018063
21527	NC_016914	ATTC	2	8	848255	848262	25 %	50 %	0 %	25 %	379018063
21528	NC_016914	A	6	6	848275	848280	100 %	0 %	0 %	0 %	379018063
21529	NC_016914	GCT	2	6	848298	848303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018063
21530	NC_016914	AAT	2	6	848304	848309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21531	NC_016914	TAA	2	6	848353	848358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21532	NC_016914	A	6	6	848421	848426	100 %	0 %	0 %	0 %	379018063
21533	NC_016914	A	7	7	848525	848531	100 %	0 %	0 %	0 %	379018063
21534	NC_016914	TAA	2	6	848575	848580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21535	NC_016914	TA	3	6	848604	848609	50 %	50 %	0 %	0 %	379018063
21536	NC_016914	CTA	2	6	848614	848619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018063
21537	NC_016914	TAA	2	6	848638	848643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21538	NC_016914	TG	3	6	848679	848684	0 %	50 %	50 %	0 %	379018063
21539	NC_016914	A	6	6	848738	848743	100 %	0 %	0 %	0 %	379018063
21540	NC_016914	AT	3	6	848868	848873	50 %	50 %	0 %	0 %	379018063
21541	NC_016914	AAT	2	6	848888	848893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21542	NC_016914	CTA	2	6	848908	848913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018063
21543	NC_016914	TAG	2	6	848956	848961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018063
21544	NC_016914	A	8	8	848966	848973	100 %	0 %	0 %	0 %	379018063
21545	NC_016914	AAT	2	6	848979	848984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21546	NC_016914	ATT	3	9	848999	849007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018063
21547	NC_016914	TAT	2	6	849029	849034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018063
21548	NC_016914	ATT	2	6	849051	849056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018063
21549	NC_016914	TAC	2	6	849095	849100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018063
21550	NC_016914	T	6	6	849175	849180	0 %	100 %	0 %	0 %	379018063
21551	NC_016914	AAT	3	9	849227	849235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21552	NC_016914	TAT	2	6	849253	849258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018063
21553	NC_016914	TAT	2	6	849328	849333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018063
21554	NC_016914	TAC	2	6	849341	849346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018063
21555	NC_016914	TAT	2	6	849425	849430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018063
21556	NC_016914	TAA	2	6	849439	849444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21557	NC_016914	ATT	3	9	849448	849456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018063
21558	NC_016914	GTA	2	6	849505	849510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018063
21559	NC_016914	CGGCA	2	10	849539	849548	20 %	0 %	40 %	40 %	379018063
21560	NC_016914	TATT	2	8	849549	849556	25 %	75 %	0 %	0 %	379018063
21561	NC_016914	ATA	2	6	849574	849579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018063
21562	NC_016914	A	6	6	849582	849587	100 %	0 %	0 %	0 %	379018063
21563	NC_016914	TAT	2	6	849630	849635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018064
21564	NC_016914	TATATC	2	12	849662	849673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379018064
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21566	NC_016914	ATA	3	9	849769	849777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018064
21567	NC_016914	TTA	2	6	849787	849792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018064
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21569	NC_016914	TAC	2	6	849828	849833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018064
21570	NC_016914	TCTA	2	8	849847	849854	25 %	50 %	0 %	25 %	379018064
21571	NC_016914	TATT	2	8	849870	849877	25 %	75 %	0 %	0 %	379018064
21572	NC_016914	TGAT	2	8	849965	849972	25 %	50 %	25 %	0 %	379018064
21573	NC_016914	ATTT	2	8	850008	850015	25 %	75 %	0 %	0 %	379018064
21574	NC_016914	CTT	2	6	850067	850072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018064
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21578	NC_016914	TA	3	6	850244	850249	50 %	50 %	0 %	0 %	379018064
21579	NC_016914	ATTCAT	2	12	850278	850289	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379018064
21580	NC_016914	TAAA	2	8	850321	850328	75 %	25 %	0 %	0 %	379018064
21581	NC_016914	TAATT	2	10	850350	850359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21582	NC_016914	AT	3	6	850367	850372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21583	NC_016914	AT	3	6	850377	850382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21584	NC_016914	ATA	2	6	850387	850392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21585	NC_016914	TTAATA	2	12	850407	850418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21586	NC_016914	AT	3	6	850426	850431	50 %	50 %	0 %	0 %	379018065
21587	NC_016914	ATA	2	6	850436	850441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018065
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21590	NC_016914	A	6	6	850528	850533	100 %	0 %	0 %	0 %	379018065
21591	NC_016914	A	6	6	850575	850580	100 %	0 %	0 %	0 %	379018065
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21594	NC_016914	ATA	2	6	850662	850667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018065
21595	NC_016914	ATT	2	6	850672	850677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018065
21596	NC_016914	GAA	2	6	850697	850702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018065
21597	NC_016914	ATG	2	6	850751	850756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018065
21598	NC_016914	CTA	2	6	850812	850817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018065
21599	NC_016914	T	6	6	850844	850849	0 %	100 %	0 %	0 %	379018065
21600	NC_016914	AGC	2	6	850858	850863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018065
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21602	NC_016914	TTA	2	6	850922	850927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018065
21603	NC_016914	ATG	2	6	850944	850949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018065
21604	NC_016914	CTT	2	6	850950	850955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018065
21605	NC_016914	A	8	8	850968	850975	100 %	0 %	0 %	0 %	379018065
21606	NC_016914	CA	3	6	851020	851025	50 %	0 %	0 %	50 %	379018065
21607	NC_016914	TTAACT	2	12	851029	851040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379018065
21608	NC_016914	A	6	6	851061	851066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21609	NC_016914	GCTT	2	8	851067	851074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21610	NC_016914	ACGGT	2	10	851077	851086	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21611	NC_016914	TCA	2	6	851090	851095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21612	NC_016914	TTC	2	6	851169	851174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21613	NC_016914	CAA	2	6	851202	851207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21614	NC_016914	AAG	2	6	851342	851347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018066
21615	NC_016914	GAA	2	6	851375	851380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018066
21616	NC_016914	TA	3	6	851453	851458	50 %	50 %	0 %	0 %	379018066
21617	NC_016914	CAT	2	6	851464	851469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018066
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21619	NC_016914	ACCT	2	8	851491	851498	25 %	25 %	0 %	50 %	379018066
21620	NC_016914	TGA	2	6	851583	851588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018066
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21622	NC_016914	GTT	2	6	851670	851675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018066
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21624	NC_016914	TTC	2	6	851736	851741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018066
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