MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016914	T	6	6	825552	825557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_016914	TAT	2	6	825593	825598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21004	NC_016914	TAT	2	6	825606	825611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21005	NC_016914	TTAT	2	8	825616	825623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_016914	TCA	2	6	825760	825765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21007	NC_016914	TA	3	6	825788	825793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21008	NC_016914	T	6	6	825794	825799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21009	NC_016914	CT	4	8	825829	825836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21010	NC_016914	TTA	2	6	825843	825848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21011	NC_016914	TTC	2	6	825883	825888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018039
21012	NC_016914	CAA	2	6	825940	825945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018039
21013	NC_016914	GTA	2	6	826046	826051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_016914	A	6	6	826056	826061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21015	NC_016914	A	6	6	826083	826088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_016914	TCT	2	6	826096	826101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21017	NC_016914	TCT	2	6	826105	826110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21018	NC_016914	T	7	7	826231	826237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21019	NC_016914	A	6	6	826248	826253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21020	NC_016914	TAA	2	6	826265	826270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21021	NC_016914	TAT	2	6	826273	826278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21022	NC_016914	TTTC	2	8	826324	826331	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21023	NC_016914	ATT	3	9	826368	826376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21024	NC_016914	CTG	2	6	826389	826394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21025	NC_016914	AAT	2	6	826416	826421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21026	NC_016914	T	7	7	826437	826443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21027	NC_016914	GTG	2	6	826529	826534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21028	NC_016914	ATT	2	6	826606	826611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21029	NC_016914	AGC	2	6	826743	826748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018040
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21031	NC_016914	AAGC	2	8	827004	827011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21032	NC_016914	TAT	2	6	827033	827038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21033	NC_016914	TCGC	2	8	827066	827073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21034	NC_016914	ATT	2	6	827183	827188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21035	NC_016914	TTA	2	6	827195	827200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018041
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21037	NC_016914	TCA	2	6	827286	827291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018041
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21039	NC_016914	CTG	2	6	827418	827423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018041
21040	NC_016914	CTC	2	6	827448	827453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21041	NC_016914	TTC	2	6	827534	827539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21042	NC_016914	T	8	8	827569	827576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21043	NC_016914	ATT	2	6	827609	827614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21044	NC_016914	AGT	2	6	827636	827641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21045	NC_016914	ACT	3	9	827759	827767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21046	NC_016914	TTAT	2	8	827828	827835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21047	NC_016914	GCTT	2	8	827887	827894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21048	NC_016914	AGC	2	6	827917	827922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21049	NC_016914	ATA	2	6	827949	827954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_016914	TTA	2	6	828045	828050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21051	NC_016914	GAA	2	6	828325	828330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21052	NC_016914	T	6	6	828387	828392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_016914	TAT	2	6	828449	828454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_016914	ATATTT	2	12	828486	828497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018042
21055	NC_016914	TACCC	2	10	828534	828543	20 %	20 %	0 %	60 %	379018042
21056	NC_016914	TAG	2	6	828548	828553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018042
21057	NC_016914	ATC	2	6	828555	828560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018042
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21059	NC_016914	T	6	6	828684	828689	0 %	100 %	0 %	0 %	379018042
21060	NC_016914	TCT	2	6	828706	828711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018042
21061	NC_016914	T	6	6	828721	828726	0 %	100 %	0 %	0 %	379018042
21062	NC_016914	AATA	2	8	828756	828763	75 %	25 %	0 %	0 %	379018042
21063	NC_016914	ATT	2	6	828774	828779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018042
21064	NC_016914	TA	3	6	828884	828889	50 %	50 %	0 %	0 %	379018042
21065	NC_016914	TAA	2	6	828921	828926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018042
21066	NC_016914	AT	3	6	828928	828933	50 %	50 %	0 %	0 %	379018042
21067	NC_016914	CTA	2	6	828958	828963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018042
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21069	NC_016914	TA	4	8	828983	828990	50 %	50 %	0 %	0 %	379018042
21070	NC_016914	TCT	2	6	829024	829029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018042
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21073	NC_016914	A	6	6	829076	829081	100 %	0 %	0 %	0 %	379018042
21074	NC_016914	TCT	2	6	829120	829125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018042
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21079	NC_016914	CAT	2	6	829268	829273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018042
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21108	NC_016914	GCA	2	6	830764	830769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018042
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21115	NC_016914	T	6	6	831233	831238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21116	NC_016914	TTTA	2	8	831262	831269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21117	NC_016914	AAT	2	6	831274	831279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21118	NC_016914	T	7	7	831279	831285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_016914	ATT	3	9	831303	831311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_016914	AATA	2	8	831312	831319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21121	NC_016914	TA	3	6	831347	831352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21122	NC_016914	A	6	6	831405	831410	100 %	0 %	0 %	0 %	379018043
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21126	NC_016914	TAA	2	6	831623	831628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018043
21127	NC_016914	AGA	2	6	831641	831646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018043
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21245	NC_016914	TAA	2	6	836510	836515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018047
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21497	NC_016914	ATT	2	6	846976	846981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018061
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21500	NC_016914	AGCGA	2	10	847082	847091	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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