MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_016914	T	6	6	728740	728745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_016914	TCA	2	6	728751	728756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18503	NC_016914	ATA	3	9	728757	728765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_016914	TTC	2	6	728792	728797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18505	NC_016914	AATC	2	8	728848	728855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18506	NC_016914	TA	4	8	728856	728863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_016914	GTT	2	6	728874	728879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_016914	A	6	6	728918	728923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_016914	ATA	2	6	728975	728980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_016914	TAAA	2	8	729014	729021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_016914	T	6	6	729044	729049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_016914	A	7	7	729094	729100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18513	NC_016914	GCA	2	6	729112	729117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18514	NC_016914	A	6	6	729117	729122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18515	NC_016914	AATTA	2	10	729124	729133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_016914	ATTT	2	8	729143	729150	25 %	75 %	0 %	0 %	379017934
18517	NC_016914	CAT	2	6	729166	729171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017934
18518	NC_016914	AGC	2	6	729457	729462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017934
18519	NC_016914	GAT	2	6	729537	729542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017934
18520	NC_016914	AGCAT	2	10	729563	729572	40 %	20 %	20 %	20 %	379017934
18521	NC_016914	ATC	2	6	729574	729579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017934
18522	NC_016914	TTG	2	6	729702	729707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017934
18523	NC_016914	T	6	6	729731	729736	0 %	100 %	0 %	0 %	379017934
18524	NC_016914	T	6	6	729789	729794	0 %	100 %	0 %	0 %	379017934
18525	NC_016914	TTC	2	6	729807	729812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017934
18526	NC_016914	ACAA	2	8	729874	729881	75 %	0 %	0 %	25 %	379017934
18527	NC_016914	CAG	2	6	729912	729917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017934
18528	NC_016914	T	7	7	729981	729987	0 %	100 %	0 %	0 %	379017934
18529	NC_016914	CAAG	2	8	729990	729997	50 %	0 %	25 %	25 %	379017934
18530	NC_016914	ACC	2	6	730030	730035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017934
18531	NC_016914	TAA	2	6	730077	730082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017934
18532	NC_016914	A	6	6	730111	730116	100 %	0 %	0 %	0 %	379017934
18533	NC_016914	GT	3	6	730145	730150	0 %	50 %	50 %	0 %	379017934
18534	NC_016914	CTA	2	6	730208	730213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017935
18535	NC_016914	ATA	2	6	730270	730275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017935
18536	NC_016914	GAT	2	6	730280	730285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017935
18537	NC_016914	CTG	2	6	730307	730312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017935
18538	NC_016914	TAAA	2	8	730344	730351	75 %	25 %	0 %	0 %	379017935
18539	NC_016914	ATT	2	6	730405	730410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017935
18540	NC_016914	T	6	6	730438	730443	0 %	100 %	0 %	0 %	379017935
18541	NC_016914	TAT	2	6	730539	730544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017935
18542	NC_016914	T	6	6	730544	730549	0 %	100 %	0 %	0 %	379017935
18543	NC_016914	AAG	2	6	730580	730585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017935
18544	NC_016914	GAATGA	2	12	730591	730602	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379017935
18545	NC_016914	TAT	2	6	730737	730742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017935
18546	NC_016914	ATA	2	6	730747	730752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017935
18547	NC_016914	TAG	2	6	730760	730765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017935
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18550	NC_016914	TCT	2	6	730900	730905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017935
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18554	NC_016914	A	6	6	731033	731038	100 %	0 %	0 %	0 %	379017935
18555	NC_016914	ATC	2	6	731043	731048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017935
18556	NC_016914	TTG	2	6	731154	731159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017935
18557	NC_016914	TTA	2	6	731161	731166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017935
18558	NC_016914	T	7	7	731174	731180	0 %	100 %	0 %	0 %	379017935
18559	NC_016914	ATA	2	6	731182	731187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017935
18560	NC_016914	A	6	6	731230	731235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_016914	GTT	2	6	731248	731253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_016914	T	6	6	731252	731257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_016914	AGT	2	6	731355	731360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_016914	CCT	2	6	731446	731451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017936
18565	NC_016914	ATT	2	6	731553	731558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017936
18566	NC_016914	TAT	2	6	731583	731588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_016914	TAT	2	6	731616	731621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017937
18568	NC_016914	TG	3	6	731634	731639	0 %	50 %	50 %	0 %	379017937
18569	NC_016914	ATT	2	6	731682	731687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017937
18570	NC_016914	T	6	6	731792	731797	0 %	100 %	0 %	0 %	379017937
18571	NC_016914	CAT	2	6	731806	731811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017937
18572	NC_016914	ATT	2	6	731843	731848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017937
18573	NC_016914	ATTTA	2	10	731858	731867	40 %	60 %	0 %	0 %	379017937
18574	NC_016914	TAA	2	6	731956	731961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017937
18575	NC_016914	GCG	2	6	731971	731976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017937
18576	NC_016914	CT	3	6	732044	732049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18577	NC_016914	T	6	6	732078	732083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18578	NC_016914	CTA	2	6	732138	732143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18579	NC_016914	TAC	2	6	732160	732165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18580	NC_016914	TTGAA	2	10	732167	732176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18581	NC_016914	TAAT	2	8	732189	732196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18582	NC_016914	AGT	2	6	732254	732259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18583	NC_016914	AACT	2	8	732336	732343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18584	NC_016914	AAGATA	2	12	732400	732411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_016914	TAAT	2	8	732454	732461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18586	NC_016914	GCA	2	6	732465	732470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18587	NC_016914	TGGTA	2	10	732481	732490	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18588	NC_016914	AAT	2	6	732491	732496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18589	NC_016914	TA	3	6	732499	732504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18590	NC_016914	ATT	2	6	732519	732524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18591	NC_016914	AT	3	6	732540	732545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18592	NC_016914	AAAT	2	8	732568	732575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_016914	TC	4	8	732681	732688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18594	NC_016914	ATT	2	6	732696	732701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18595	NC_016914	A	6	6	732770	732775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_016914	ATA	2	6	732852	732857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18597	NC_016914	A	7	7	732884	732890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_016914	AAT	2	6	732966	732971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_016914	TTA	2	6	732982	732987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18600	NC_016914	ATA	2	6	733008	733013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18601	NC_016914	TA	3	6	733043	733048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18602	NC_016914	T	6	6	733067	733072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18603	NC_016914	ATA	2	6	733143	733148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_016914	TA	3	6	733175	733180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18605	NC_016914	AAT	3	9	733236	733244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_016914	TAA	2	6	733268	733273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_016914	AAT	2	6	733278	733283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18608	NC_016914	CCGT	2	8	733284	733291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18609	NC_016914	AT	3	6	733292	733297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_016914	A	6	6	733314	733319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18611	NC_016914	T	6	6	733407	733412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18612	NC_016914	ATA	3	9	733523	733531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18613	NC_016914	A	7	7	733537	733543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18614	NC_016914	AAAC	2	8	733545	733552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18615	NC_016914	A	6	6	733570	733575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18616	NC_016914	T	8	8	733669	733676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18617	NC_016914	GACAT	2	10	733712	733721	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18618	NC_016914	ACA	2	6	733765	733770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18619	NC_016914	ATG	2	6	733815	733820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18620	NC_016914	TTA	2	6	733835	733840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18621	NC_016914	TCA	2	6	733856	733861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18622	NC_016914	TCA	2	6	733883	733888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18623	NC_016914	T	7	7	733899	733905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18624	NC_016914	CTG	2	6	733920	733925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18625	NC_016914	TACC	2	8	733936	733943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18626	NC_016914	TTTA	2	8	733979	733986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18627	NC_016914	ATT	2	6	734037	734042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017938
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