MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_016914	TAA	2	6	649869	649874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017842
16502	NC_016914	TACTT	2	10	649917	649926	20 %	60 %	0 %	20 %	379017842
16503	NC_016914	TTCA	2	8	650049	650056	25 %	50 %	0 %	25 %	379017842
16504	NC_016914	AAT	2	6	650071	650076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017842
16505	NC_016914	TCTA	2	8	650088	650095	25 %	50 %	0 %	25 %	379017842
16506	NC_016914	A	6	6	650145	650150	100 %	0 %	0 %	0 %	379017842
16507	NC_016914	GCA	2	6	650170	650175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017842
16508	NC_016914	TAAT	2	8	650191	650198	50 %	50 %	0 %	0 %	379017842
16509	NC_016914	GAA	2	6	650207	650212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017842
16510	NC_016914	CTA	2	6	650240	650245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017842
16511	NC_016914	ATA	2	6	650255	650260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017842
16512	NC_016914	CTTGC	2	10	650300	650309	0 %	40 %	20 %	40 %	379017842
16513	NC_016914	ATCTC	2	10	650385	650394	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16514	NC_016914	CGA	2	6	650453	650458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_016914	GCT	2	6	650501	650506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16516	NC_016914	ACT	2	6	650525	650530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017843
16517	NC_016914	CTTA	2	8	650550	650557	25 %	50 %	0 %	25 %	379017843
16518	NC_016914	ATT	2	6	650580	650585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017843
16519	NC_016914	GCG	3	9	650610	650618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017843
16520	NC_016914	TAA	2	6	650631	650636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017843
16521	NC_016914	ATT	2	6	650688	650693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017843
16522	NC_016914	TGCAC	2	10	650719	650728	20 %	20 %	20 %	40 %	379017843
16523	NC_016914	TAAT	2	8	650765	650772	50 %	50 %	0 %	0 %	379017843
16524	NC_016914	TGT	2	6	650773	650778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017843
16525	NC_016914	GTA	2	6	650788	650793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017843
16526	NC_016914	AT	3	6	650819	650824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_016914	AAG	2	6	650841	650846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017844
16528	NC_016914	TTAAA	2	10	650854	650863	60 %	40 %	0 %	0 %	379017844
16529	NC_016914	GCAA	2	8	650907	650914	50 %	0 %	25 %	25 %	379017844
16530	NC_016914	TGC	2	6	651034	651039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017844
16531	NC_016914	CT	3	6	651062	651067	0 %	50 %	0 %	50 %	379017844
16532	NC_016914	TAAA	2	8	651109	651116	75 %	25 %	0 %	0 %	379017844
16533	NC_016914	GTC	2	6	651176	651181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017844
16534	NC_016914	TCT	2	6	651264	651269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017844
16535	NC_016914	TCT	2	6	651339	651344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017844
16536	NC_016914	TA	3	6	651356	651361	50 %	50 %	0 %	0 %	379017844
16537	NC_016914	TCA	2	6	651408	651413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017844
16538	NC_016914	T	8	8	651467	651474	0 %	100 %	0 %	0 %	379017844
16539	NC_016914	CT	3	6	651476	651481	0 %	50 %	0 %	50 %	379017844
16540	NC_016914	CGG	2	6	651530	651535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017844
16541	NC_016914	CTT	3	9	651580	651588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017844
16542	NC_016914	CGC	2	6	651634	651639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017844
16543	NC_016914	TTCC	2	8	651742	651749	0 %	50 %	0 %	50 %	379017844
16544	NC_016914	T	8	8	651799	651806	0 %	100 %	0 %	0 %	379017844
16545	NC_016914	AAT	2	6	651862	651867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017844
16546	NC_016914	AT	3	6	651917	651922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_016914	AAT	2	6	651955	651960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017845
16548	NC_016914	TTC	2	6	651988	651993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017845
16549	NC_016914	TCA	2	6	652074	652079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017845
16550	NC_016914	TTA	2	6	652082	652087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017845
16551	NC_016914	TATTT	2	10	652096	652105	20 %	80 %	0 %	0 %	379017845
16552	NC_016914	TAC	2	6	652144	652149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017845
16553	NC_016914	T	6	6	652207	652212	0 %	100 %	0 %	0 %	379017845
16554	NC_016914	TA	3	6	652222	652227	50 %	50 %	0 %	0 %	379017845
16555	NC_016914	TAA	2	6	652240	652245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017845
16556	NC_016914	AT	3	6	652260	652265	50 %	50 %	0 %	0 %	379017845
16557	NC_016914	TTA	2	6	652272	652277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017845
16558	NC_016914	TGC	2	6	652338	652343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017845
16559	NC_016914	TA	3	6	652439	652444	50 %	50 %	0 %	0 %	379017845
16560	NC_016914	T	6	6	652482	652487	0 %	100 %	0 %	0 %	379017845
16561	NC_016914	TAA	2	6	652498	652503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017845
16562	NC_016914	TAC	2	6	652507	652512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017845
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16565	NC_016914	TAA	2	6	652624	652629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017845
16566	NC_016914	TTGCA	2	10	652632	652641	20 %	40 %	20 %	20 %	379017845
16567	NC_016914	ACTA	2	8	652675	652682	50 %	25 %	0 %	25 %	379017845
16568	NC_016914	AAT	2	6	652699	652704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017845
16569	NC_016914	A	6	6	652784	652789	100 %	0 %	0 %	0 %	379017845
16570	NC_016914	TAG	2	6	652887	652892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017845
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16572	NC_016914	TATTT	2	10	652990	652999	20 %	80 %	0 %	0 %	379017845
16573	NC_016914	AGA	2	6	653024	653029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017845
16574	NC_016914	CGG	2	6	653043	653048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017845
16575	NC_016914	TTA	2	6	653073	653078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017845
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16577	NC_016914	T	6	6	653090	653095	0 %	100 %	0 %	0 %	379017845
16578	NC_016914	TAA	2	6	653101	653106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017845
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16580	NC_016914	CAA	2	6	653232	653237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017845
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16582	NC_016914	GCT	2	6	653288	653293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017845
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16584	NC_016914	TA	3	6	653527	653532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16585	NC_016914	A	6	6	653562	653567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16586	NC_016914	A	7	7	653606	653612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16587	NC_016914	AAAT	2	8	653615	653622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16588	NC_016914	TTTAA	2	10	653629	653638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16589	NC_016914	AAC	2	6	653717	653722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16590	NC_016914	TAAT	2	8	653757	653764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16591	NC_016914	AGA	2	6	653849	653854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017846
16592	NC_016914	TCT	2	6	653952	653957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017846
16593	NC_016914	TC	3	6	653998	654003	0 %	50 %	0 %	50 %	379017846
16594	NC_016914	A	6	6	654133	654138	100 %	0 %	0 %	0 %	379017846
16595	NC_016914	AGA	3	9	654149	654157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017846
16596	NC_016914	AAAAGA	2	12	654158	654169	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379017846
16597	NC_016914	T	6	6	654185	654190	0 %	100 %	0 %	0 %	379017846
16598	NC_016914	ATA	2	6	654292	654297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017846
16599	NC_016914	TGG	2	6	654323	654328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017846
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16601	NC_016914	ATG	2	6	654394	654399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017846
16602	NC_016914	TGA	2	6	654404	654409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017846
16603	NC_016914	AAC	2	6	654428	654433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017846
16604	NC_016914	GAA	2	6	654624	654629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017846
16605	NC_016914	TA	3	6	654714	654719	50 %	50 %	0 %	0 %	379017846
16606	NC_016914	TGG	2	6	654725	654730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017846
16607	NC_016914	ATG	2	6	654774	654779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017846
16608	NC_016914	AGG	2	6	654781	654786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017846
16609	NC_016914	AGGACA	2	12	654842	654853	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379017846
16610	NC_016914	AAC	2	6	654862	654867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017846
16611	NC_016914	TAA	2	6	654871	654876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017846
16612	NC_016914	ACA	2	6	654888	654893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017846
16613	NC_016914	ACC	2	6	654908	654913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017846
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16615	NC_016914	ACC	2	6	654932	654937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017846
16616	NC_016914	CTA	2	6	654946	654951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017846
16617	NC_016914	ACCA	2	8	654952	654959	50 %	0 %	0 %	50 %	379017846
16618	NC_016914	TCT	2	6	655010	655015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017846
16619	NC_016914	GCA	2	6	655039	655044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017846
16620	NC_016914	TTA	2	6	655053	655058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017846
16621	NC_016914	CAAC	2	8	655097	655104	50 %	0 %	0 %	50 %	379017846
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16997	NC_016914	TATT	2	8	670043	670050	25 %	75 %	0 %	0 %	379017858
16998	NC_016914	ATA	2	6	670091	670096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017858
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17000	NC_016914	GGA	2	6	670204	670209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017858

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