MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016914	A	6	6	629988	629993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_016914	TAA	2	6	630011	630016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_016914	TAT	2	6	630034	630039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_016914	AATT	2	8	630087	630094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_016914	AAT	2	6	630148	630153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_016914	TA	3	6	630170	630175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_016914	T	6	6	630261	630266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_016914	AT	3	6	630311	630316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_016914	ATC	2	6	630318	630323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_016914	A	6	6	630346	630351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_016914	AAT	2	6	630400	630405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_016914	TA	3	6	630412	630417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_016914	AAAT	2	8	630474	630481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_016914	AAT	2	6	630604	630609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_016914	AAT	2	6	630645	630650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_016914	AGG	2	6	630669	630674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_016914	TAT	2	6	630697	630702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_016914	TAA	2	6	630767	630772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_016914	GAT	2	6	630787	630792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_016914	TTCC	2	8	630830	630837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16021	NC_016914	GAA	2	6	630883	630888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_016914	TAT	2	6	630926	630931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_016914	AAT	2	6	630948	630953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_016914	GAA	2	6	631008	631013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_016914	ATG	2	6	631027	631032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_016914	AT	4	8	631038	631045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_016914	AAT	2	6	631095	631100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_016914	TTA	3	9	631186	631194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_016914	TG	3	6	631199	631204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_016914	ACC	2	6	631239	631244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16031	NC_016914	AAT	3	9	631284	631292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_016914	ATT	2	6	631293	631298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_016914	TAT	2	6	631439	631444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017828
16034	NC_016914	ACT	2	6	631446	631451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017828
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16036	NC_016914	ATC	2	6	631570	631575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017828
16037	NC_016914	TAG	2	6	631587	631592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017828
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16039	NC_016914	TGC	2	6	631680	631685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017828
16040	NC_016914	TA	3	6	631729	631734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_016914	A	6	6	631737	631742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_016914	TTC	2	6	631758	631763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_016914	TTGC	2	8	631783	631790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16044	NC_016914	TAT	2	6	631829	631834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_016914	TAT	2	6	631848	631853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_016914	TAAA	2	8	631929	631936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_016914	GAA	2	6	631956	631961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017829
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16053	NC_016914	ACCGCT	2	12	632126	632137	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379017829
16054	NC_016914	TGG	2	6	632156	632161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017829
16055	NC_016914	GAT	2	6	632169	632174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017829
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16057	NC_016914	GAA	2	6	632199	632204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017829
16058	NC_016914	A	6	6	632266	632271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_016914	TA	3	6	632317	632322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_016914	ATG	2	6	632369	632374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017830
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16063	NC_016914	AG	3	6	632470	632475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_016914	TGT	2	6	632487	632492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_016914	TAG	2	6	632507	632512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_016914	TTG	2	6	632527	632532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_016914	TTG	2	6	632625	632630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_016914	TTTC	2	8	632642	632649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16069	NC_016914	ACAA	2	8	632809	632816	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16070	NC_016914	TA	3	6	632820	632825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_016914	GTCAA	2	10	632845	632854	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16072	NC_016914	A	9	9	632861	632869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_016914	ATT	3	9	632890	632898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_016914	T	6	6	632945	632950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_016914	A	8	8	633006	633013	100 %	0 %	0 %	0 %	379017831
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16099	NC_016914	TGC	2	6	633891	633896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017831
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16105	NC_016914	A	7	7	634140	634146	100 %	0 %	0 %	0 %	379017831
16106	NC_016914	AT	4	8	634154	634161	50 %	50 %	0 %	0 %	379017831
16107	NC_016914	CTG	2	6	634162	634167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017831
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16110	NC_016914	GAG	2	6	634404	634409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017831
16111	NC_016914	TAA	2	6	634418	634423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017831
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16116	NC_016914	GAA	2	6	634794	634799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017831
16117	NC_016914	AGTA	2	8	634813	634820	50 %	25 %	25 %	0 %	379017831
16118	NC_016914	CAA	2	6	634845	634850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_016914	ATG	2	6	634851	634856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16121	NC_016914	AT	3	6	634908	634913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_016914	AT	3	6	634953	634958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_016914	TAG	2	6	635003	635008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16125	NC_016914	CTT	2	6	635075	635080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16127	NC_016914	GTA	2	6	635157	635162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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