MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016914	TAT	2	6	590432	590437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017783
15003	NC_016914	ACT	2	6	590499	590504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017783
15004	NC_016914	AAT	2	6	590540	590545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017783
15005	NC_016914	CCG	2	6	590577	590582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017783
15006	NC_016914	ATT	2	6	590625	590630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017783
15007	NC_016914	CTT	2	6	590638	590643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017783
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15009	NC_016914	TAA	2	6	590710	590715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017783
15010	NC_016914	GCT	2	6	590802	590807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017783
15011	NC_016914	TCT	2	6	590823	590828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017783
15012	NC_016914	TCA	2	6	590829	590834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017783
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15015	NC_016914	TTTC	2	8	591001	591008	0 %	75 %	0 %	25 %	379017783
15016	NC_016914	TAA	2	6	591103	591108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017783
15017	NC_016914	T	6	6	591109	591114	0 %	100 %	0 %	0 %	379017783
15018	NC_016914	T	6	6	591121	591126	0 %	100 %	0 %	0 %	379017783
15019	NC_016914	CTC	2	6	591148	591153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017783
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15029	NC_016914	TTA	2	6	591549	591554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_016914	TTA	2	6	591628	591633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_016914	AAT	2	6	591657	591662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_016914	AT	3	6	591694	591699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_016914	AT	3	6	591713	591718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_016914	ATTA	2	8	591758	591765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_016914	ATTT	2	8	591793	591800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15037	NC_016914	TTA	2	6	591852	591857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_016914	ATGTT	2	10	591861	591870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_016914	GCT	2	6	591885	591890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15041	NC_016914	TTTACC	2	12	592017	592028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379017784
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15044	NC_016914	T	8	8	592078	592085	0 %	100 %	0 %	0 %	379017784
15045	NC_016914	TA	3	6	592134	592139	50 %	50 %	0 %	0 %	379017784
15046	NC_016914	TAC	2	6	592173	592178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017784
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15049	NC_016914	TAT	2	6	592248	592253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_016914	TAA	2	6	592314	592319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_016914	TGA	2	6	592322	592327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_016914	AAT	2	6	592350	592355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_016914	AGC	2	6	592370	592375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_016914	T	8	8	592387	592394	0 %	100 %	0 %	0 %	379017785
15055	NC_016914	AAAC	2	8	592440	592447	75 %	0 %	0 %	25 %	379017785
15056	NC_016914	ATG	2	6	592461	592466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017785
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15059	NC_016914	TTA	3	9	592618	592626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017786
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15062	NC_016914	ACTT	2	8	592823	592830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15063	NC_016914	A	6	6	592880	592885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_016914	A	6	6	592890	592895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_016914	ATT	2	6	592903	592908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15068	NC_016914	TGCTT	2	10	593206	593215	0 %	60 %	20 %	20 %	379017787
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15097	NC_016914	TCA	2	6	594679	594684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017787
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15102	NC_016914	CGT	2	6	594857	594862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017787
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15105	NC_016914	GACAT	2	10	595064	595073	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15106	NC_016914	CT	3	6	595100	595105	0 %	50 %	0 %	50 %	379017788
15107	NC_016914	CTT	2	6	595130	595135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017788
15108	NC_016914	TTC	2	6	595164	595169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017788
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15113	NC_016914	TTC	2	6	595320	595325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017788
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15115	NC_016914	T	6	6	595368	595373	0 %	100 %	0 %	0 %	379017788
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15119	NC_016914	TAT	2	6	595490	595495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017788
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15122	NC_016914	CTT	2	6	595553	595558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017788
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