MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_016914	T	8	8	568953	568960	0 %	100 %	0 %	0 %	379017761
14503	NC_016914	TAT	2	6	568979	568984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_016914	TA	3	6	569006	569011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_016914	ATA	2	6	569092	569097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_016914	T	8	8	569143	569150	0 %	100 %	0 %	0 %	379017762
14507	NC_016914	A	6	6	569151	569156	100 %	0 %	0 %	0 %	379017762
14508	NC_016914	CTT	2	6	569173	569178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017762
14509	NC_016914	T	7	7	569229	569235	0 %	100 %	0 %	0 %	379017762
14510	NC_016914	ATA	2	6	569298	569303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017762
14511	NC_016914	TA	3	6	569315	569320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_016914	AT	3	6	569374	569379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_016914	AATT	2	8	569399	569406	50 %	50 %	0 %	0 %	379017763
14514	NC_016914	TTGTTA	2	12	569437	569448	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379017763
14515	NC_016914	A	6	6	569492	569497	100 %	0 %	0 %	0 %	379017763
14516	NC_016914	TA	4	8	569576	569583	50 %	50 %	0 %	0 %	379017763
14517	NC_016914	A	6	6	569691	569696	100 %	0 %	0 %	0 %	379017763
14518	NC_016914	ATG	2	6	569713	569718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017763
14519	NC_016914	ATA	2	6	569722	569727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017763
14520	NC_016914	TGAT	2	8	569812	569819	25 %	50 %	25 %	0 %	379017763
14521	NC_016914	A	6	6	569893	569898	100 %	0 %	0 %	0 %	379017763
14522	NC_016914	TTG	2	6	569899	569904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017763
14523	NC_016914	ATT	2	6	569927	569932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017763
14524	NC_016914	ATA	2	6	569971	569976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017763
14525	NC_016914	G	6	6	570001	570006	0 %	0 %	100 %	0 %	379017763
14526	NC_016914	GCTT	2	8	570017	570024	0 %	50 %	25 %	25 %	379017763
14527	NC_016914	TGC	2	6	570050	570055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017763
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14529	NC_016914	TAATA	2	10	570137	570146	60 %	40 %	0 %	0 %	379017763
14530	NC_016914	ATT	2	6	570184	570189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017763
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14535	NC_016914	AGC	2	6	570327	570332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017764
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14537	NC_016914	A	8	8	570367	570374	100 %	0 %	0 %	0 %	379017764
14538	NC_016914	ATT	2	6	570391	570396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017764
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14541	NC_016914	AGTA	2	8	570564	570571	50 %	25 %	25 %	0 %	379017764
14542	NC_016914	TAT	2	6	570639	570644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017764
14543	NC_016914	AGCAG	2	10	570690	570699	40 %	0 %	40 %	20 %	379017764
14544	NC_016914	AGT	2	6	570732	570737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017764
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14548	NC_016914	AATT	2	8	571112	571119	50 %	50 %	0 %	0 %	379017764
14549	NC_016914	GCA	2	6	571180	571185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017764
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14551	NC_016914	GCA	2	6	571225	571230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017764
14552	NC_016914	AAG	2	6	571241	571246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017764
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14554	NC_016914	TTA	2	6	571300	571305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017764
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14559	NC_016914	GTC	2	6	571479	571484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14561	NC_016914	A	7	7	571528	571534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_016914	TCA	2	6	571567	571572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_016914	CAA	2	6	571617	571622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14564	NC_016914	A	6	6	571655	571660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_016914	CAAAAA	2	12	571662	571673	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14566	NC_016914	A	9	9	571669	571677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_016914	TTA	2	6	571728	571733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017765
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14604	NC_016914	GCT	2	6	573800	573805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017766
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14607	NC_016914	A	6	6	574035	574040	100 %	0 %	0 %	0 %	379017766
14608	NC_016914	TTA	2	6	574098	574103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017766
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14612	NC_016914	AG	3	6	574216	574221	50 %	0 %	50 %	0 %	379017766
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14614	NC_016914	AG	3	6	574262	574267	50 %	0 %	50 %	0 %	379017766
14615	NC_016914	ATG	2	6	574314	574319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017766
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14997	NC_016914	TTTTA	2	10	590224	590233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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