MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016914	CGC	2	6	549675	549680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017739
14003	NC_016914	AAT	2	6	549689	549694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017739
14004	NC_016914	ATA	2	6	549695	549700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017739
14005	NC_016914	ACC	2	6	549742	549747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017739
14006	NC_016914	ATC	2	6	549800	549805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017739
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14008	NC_016914	CAA	2	6	549882	549887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017739
14009	NC_016914	AT	3	6	549995	550000	50 %	50 %	0 %	0 %	379017739
14010	NC_016914	ATA	2	6	550038	550043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017739
14011	NC_016914	CCG	3	9	550052	550060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017739
14012	NC_016914	AAAG	2	8	550069	550076	75 %	0 %	25 %	0 %	379017739
14013	NC_016914	CCA	2	6	550118	550123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017739
14014	NC_016914	ATT	2	6	550142	550147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017739
14015	NC_016914	AGG	2	6	550336	550341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017739
14016	NC_016914	CAA	2	6	550374	550379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017739
14017	NC_016914	AAAAG	2	10	550397	550406	80 %	0 %	20 %	0 %	379017739
14018	NC_016914	TAG	2	6	550414	550419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017739
14019	NC_016914	ATA	2	6	550535	550540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017739
14020	NC_016914	TA	3	6	550566	550571	50 %	50 %	0 %	0 %	379017739
14021	NC_016914	GCC	2	6	550597	550602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017739
14022	NC_016914	A	6	6	550710	550715	100 %	0 %	0 %	0 %	379017739
14023	NC_016914	GTG	2	6	550741	550746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017739
14024	NC_016914	GTA	2	6	550766	550771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017739
14025	NC_016914	ATT	3	9	550784	550792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017740
14026	NC_016914	AATCCC	2	12	550859	550870	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379017740
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14029	NC_016914	ATACT	2	10	550943	550952	40 %	40 %	0 %	20 %	379017740
14030	NC_016914	ATAGCA	2	12	550960	550971	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379017740
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14033	NC_016914	A	6	6	551177	551182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_016914	TAGTTT	2	12	551193	551204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_016914	CTG	2	6	551243	551248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_016914	ATC	2	6	551250	551255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_016914	ACT	2	6	551256	551261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_016914	TAA	2	6	551262	551267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_016914	TAT	2	6	551331	551336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_016914	TTAG	2	8	551364	551371	25 %	50 %	25 %	0 %	379017741
14041	NC_016914	CTT	2	6	551385	551390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017741
14042	NC_016914	TACT	2	8	551444	551451	25 %	50 %	0 %	25 %	379017741
14043	NC_016914	GATG	2	8	551480	551487	25 %	25 %	50 %	0 %	379017741
14044	NC_016914	T	6	6	551523	551528	0 %	100 %	0 %	0 %	379017741
14045	NC_016914	GTA	2	6	551644	551649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017741
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14053	NC_016914	ATT	2	6	551943	551948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017741
14054	NC_016914	T	6	6	551947	551952	0 %	100 %	0 %	0 %	379017741
14055	NC_016914	CAA	2	6	551990	551995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017741
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14063	NC_016914	TAA	2	6	552296	552301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017741
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14065	NC_016914	TAA	2	6	552404	552409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_016914	ATTT	2	8	552496	552503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14070	NC_016914	TTG	2	6	552644	552649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_016914	T	6	6	552674	552679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_016914	TAA	2	6	552685	552690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_016914	GTAAT	2	10	552767	552776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14080	NC_016914	ATA	2	6	552951	552956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14099	NC_016914	AGT	3	9	553339	553347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017742
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14107	NC_016914	GAA	2	6	553616	553621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017742
14108	NC_016914	GTA	2	6	553625	553630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017742
14109	NC_016914	TAAA	2	8	553635	553642	75 %	25 %	0 %	0 %	379017742
14110	NC_016914	TCG	2	6	553655	553660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017742
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14116	NC_016914	AAT	2	6	553922	553927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017742
14117	NC_016914	T	7	7	553934	553940	0 %	100 %	0 %	0 %	379017742
14118	NC_016914	CTTA	2	8	553969	553976	25 %	50 %	0 %	25 %	379017742
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14357	NC_016914	TA	3	6	562625	562630	50 %	50 %	0 %	0 %	379017754
14358	NC_016914	TATC	2	8	562678	562685	25 %	50 %	0 %	25 %	379017754
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