MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_016914	T	6	6	531253	531258	0 %	100 %	0 %	0 %	379017721
13503	NC_016914	TAA	2	6	531310	531315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017721
13504	NC_016914	GTA	2	6	531328	531333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017721
13505	NC_016914	TAT	2	6	531336	531341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_016914	TCATTG	2	12	531344	531355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13507	NC_016914	ATA	2	6	531390	531395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_016914	A	7	7	531395	531401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_016914	T	6	6	531411	531416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_016914	AAT	2	6	531486	531491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_016914	TATT	2	8	531496	531503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_016914	TTA	2	6	531523	531528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017722
13513	NC_016914	A	7	7	531576	531582	100 %	0 %	0 %	0 %	379017722
13514	NC_016914	CCT	2	6	531604	531609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017722
13515	NC_016914	CTT	2	6	531689	531694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017722
13516	NC_016914	A	6	6	531760	531765	100 %	0 %	0 %	0 %	379017722
13517	NC_016914	ATTA	2	8	531858	531865	50 %	50 %	0 %	0 %	379017722
13518	NC_016914	ATG	2	6	531878	531883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017722
13519	NC_016914	CTG	2	6	531884	531889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017722
13520	NC_016914	AATG	2	8	531939	531946	50 %	25 %	25 %	0 %	379017722
13521	NC_016914	GAA	2	6	531969	531974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017722
13522	NC_016914	GCA	2	6	532014	532019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017722
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13524	NC_016914	GTA	2	6	532123	532128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017722
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13526	NC_016914	ACT	2	6	532216	532221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017722
13527	NC_016914	ATTG	2	8	532242	532249	25 %	50 %	25 %	0 %	379017722
13528	NC_016914	GTT	2	6	532252	532257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017722
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13531	NC_016914	CTA	2	6	532376	532381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017722
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13533	NC_016914	TTAC	2	8	532511	532518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13534	NC_016914	CAA	2	6	532556	532561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_016914	CA	3	6	532590	532595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13536	NC_016914	TTG	2	6	532667	532672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017723
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13539	NC_016914	T	7	7	532732	532738	0 %	100 %	0 %	0 %	379017723
13540	NC_016914	T	6	6	532748	532753	0 %	100 %	0 %	0 %	379017723
13541	NC_016914	TAT	2	6	532852	532857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017723
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13543	NC_016914	TTG	2	6	532919	532924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017723
13544	NC_016914	GCA	2	6	532964	532969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017723
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13550	NC_016914	TAA	2	6	533260	533265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017723
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13575	NC_016914	TAT	2	6	534218	534223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13601	NC_016914	ATTTA	2	10	535000	535009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13603	NC_016914	T	7	7	535042	535048	0 %	100 %	0 %	0 %	379017726
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13610	NC_016914	AT	3	6	535374	535379	50 %	50 %	0 %	0 %	379017726
13611	NC_016914	AAG	2	6	535393	535398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017726
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13614	NC_016914	ATA	2	6	535480	535485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017726
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13996	NC_016914	TGC	2	6	549446	549451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017739
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13999	NC_016914	TAAA	2	8	549570	549577	75 %	25 %	0 %	0 %	379017739
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