MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016914	CTC	2	6	510687	510692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_016914	TTTA	2	8	510720	510727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_016914	TTC	2	6	510774	510779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_016914	TCT	2	6	510814	510819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_016914	CTT	2	6	510842	510847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_016914	TTG	2	6	510849	510854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_016914	AATTA	2	10	510948	510957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_016914	GCT	2	6	510963	510968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_016914	TTC	2	6	510990	510995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_016914	AGA	3	9	511023	511031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_016914	TGT	2	6	511069	511074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_016914	TGAA	2	8	511130	511137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_016914	GTA	2	6	511258	511263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017700
13014	NC_016914	ATTT	2	8	511297	511304	25 %	75 %	0 %	0 %	379017700
13015	NC_016914	ATA	2	6	511318	511323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017700
13016	NC_016914	TTGTTA	2	12	511332	511343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379017700
13017	NC_016914	CCT	2	6	511369	511374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017700
13018	NC_016914	TAT	2	6	511390	511395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017700
13019	NC_016914	AAC	2	6	511399	511404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017700
13020	NC_016914	ATT	2	6	511434	511439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_016914	TA	3	6	511468	511473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_016914	CTT	2	6	511526	511531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_016914	T	6	6	511534	511539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_016914	AAAT	2	8	511548	511555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_016914	CTT	2	6	511606	511611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_016914	CAT	2	6	511682	511687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_016914	TTTCA	2	10	511695	511704	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13028	NC_016914	T	6	6	511730	511735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016914	TC	3	6	511740	511745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13030	NC_016914	TGT	2	6	511775	511780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_016914	A	6	6	511786	511791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_016914	TGA	2	6	511874	511879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_016914	ATT	2	6	511888	511893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_016914	TTA	2	6	511922	511927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_016914	TTC	2	6	511930	511935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_016914	ATT	2	6	511936	511941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_016914	ATT	2	6	511985	511990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_016914	TCT	2	6	511991	511996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_016914	TTG	2	6	512017	512022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_016914	GT	3	6	512026	512031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_016914	T	6	6	512045	512050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_016914	T	6	6	512064	512069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_016914	AAC	2	6	512109	512114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_016914	TTC	2	6	512115	512120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_016914	T	6	6	512311	512316	0 %	100 %	0 %	0 %	379017701
13046	NC_016914	AAAT	2	8	512317	512324	75 %	25 %	0 %	0 %	379017701
13047	NC_016914	TTG	3	9	512376	512384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017701
13048	NC_016914	TTA	2	6	512423	512428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017701
13049	NC_016914	ATT	2	6	512484	512489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017701
13050	NC_016914	T	6	6	512500	512505	0 %	100 %	0 %	0 %	379017701
13051	NC_016914	TAAA	2	8	512508	512515	75 %	25 %	0 %	0 %	379017701
13052	NC_016914	TTA	2	6	512522	512527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017701
13053	NC_016914	ATTC	2	8	512537	512544	25 %	50 %	0 %	25 %	379017701
13054	NC_016914	TAA	2	6	512569	512574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_016914	TAA	2	6	512619	512624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_016914	AAT	2	6	512669	512674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_016914	ATTT	2	8	512686	512693	25 %	75 %	0 %	0 %	379017702
13058	NC_016914	T	6	6	512709	512714	0 %	100 %	0 %	0 %	379017702
13059	NC_016914	CTT	2	6	512789	512794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017702
13060	NC_016914	ATA	2	6	512803	512808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017702
13061	NC_016914	ATA	2	6	512931	512936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017702
13062	NC_016914	CAA	2	6	512960	512965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017702
13063	NC_016914	CCG	3	9	512971	512979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017702
13064	NC_016914	ATT	2	6	512995	513000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017702
13065	NC_016914	T	6	6	512999	513004	0 %	100 %	0 %	0 %	379017702
13066	NC_016914	CCG	2	6	513106	513111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017702
13067	NC_016914	TGA	2	6	513177	513182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017702
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13069	NC_016914	T	6	6	513303	513308	0 %	100 %	0 %	0 %	379017702
13070	NC_016914	TGC	2	6	513315	513320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017702
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13073	NC_016914	ACC	2	6	513582	513587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017702
13074	NC_016914	TGT	2	6	513622	513627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017702
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13077	NC_016914	TAA	2	6	513810	513815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016914	A	8	8	513823	513830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_016914	TAA	2	6	513855	513860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_016914	A	6	6	514134	514139	100 %	0 %	0 %	0 %	379017703
13081	NC_016914	TAG	2	6	514170	514175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017703
13082	NC_016914	ATT	2	6	514184	514189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_016914	TAA	2	6	514284	514289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017704
13084	NC_016914	A	6	6	514299	514304	100 %	0 %	0 %	0 %	379017704
13085	NC_016914	AG	3	6	514306	514311	50 %	0 %	50 %	0 %	379017704
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13087	NC_016914	AAG	2	6	514329	514334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017704
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13089	NC_016914	A	6	6	514375	514380	100 %	0 %	0 %	0 %	379017704
13090	NC_016914	TAG	2	6	514402	514407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017704
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13092	NC_016914	TTA	2	6	514479	514484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_016914	ATT	2	6	514511	514516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017705
13094	NC_016914	TA	3	6	514541	514546	50 %	50 %	0 %	0 %	379017705
13095	NC_016914	AGT	2	6	514611	514616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017705
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13097	NC_016914	T	7	7	514740	514746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_016914	T	7	7	514754	514760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_016914	AATA	2	8	514761	514768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_016914	TTG	2	6	514820	514825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_016914	ATT	3	9	514890	514898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_016914	CAA	2	6	514965	514970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_016914	GCAA	2	8	515054	515061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_016914	ATC	2	6	515097	515102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017706
13105	NC_016914	TTA	2	6	515103	515108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017706
13106	NC_016914	ATA	2	6	515143	515148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017706
13107	NC_016914	ATA	2	6	515157	515162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017706
13108	NC_016914	TATG	2	8	515194	515201	25 %	50 %	25 %	0 %	379017706
13109	NC_016914	TGAAT	2	10	515227	515236	40 %	40 %	20 %	0 %	379017706
13110	NC_016914	AT	3	6	515322	515327	50 %	50 %	0 %	0 %	379017706
13111	NC_016914	CCG	2	6	515391	515396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017706
13112	NC_016914	TGAA	2	8	515473	515480	50 %	25 %	25 %	0 %	379017706
13113	NC_016914	CAT	2	6	515504	515509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017706
13114	NC_016914	ACT	2	6	515558	515563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017706
13115	NC_016914	ACTA	2	8	515576	515583	50 %	25 %	0 %	25 %	379017706
13116	NC_016914	A	7	7	515602	515608	100 %	0 %	0 %	0 %	379017706
13117	NC_016914	AAG	2	6	515717	515722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017706
13118	NC_016914	ATT	2	6	515754	515759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017706
13119	NC_016914	AT	3	6	515788	515793	50 %	50 %	0 %	0 %	379017706
13120	NC_016914	TAA	2	6	515899	515904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017706
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13122	NC_016914	ATAA	2	8	515981	515988	75 %	25 %	0 %	0 %	379017706
13123	NC_016914	A	6	6	516032	516037	100 %	0 %	0 %	0 %	379017706
13124	NC_016914	CTT	2	6	516055	516060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017706
13125	NC_016914	ATA	2	6	516132	516137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017706
13126	NC_016914	ATA	2	6	516142	516147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017706
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