MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016914	A	6	6	432853	432858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_016914	T	7	7	432914	432920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_016914	GTT	3	9	432987	432995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017611
11004	NC_016914	TAC	2	6	433005	433010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017611
11005	NC_016914	ATT	2	6	433052	433057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017611
11006	NC_016914	TCT	2	6	433061	433066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017611
11007	NC_016914	ATT	2	6	433075	433080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017611
11008	NC_016914	AAT	2	6	433089	433094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017611
11009	NC_016914	CAATAA	2	12	433287	433298	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379017611
11010	NC_016914	ATT	3	9	433300	433308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017611
11011	NC_016914	T	7	7	433307	433313	0 %	100 %	0 %	0 %	379017611
11012	NC_016914	TA	3	6	433337	433342	50 %	50 %	0 %	0 %	379017611
11013	NC_016914	ATT	2	6	433346	433351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017611
11014	NC_016914	AAT	2	6	433381	433386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_016914	CGT	2	6	433438	433443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017612
11016	NC_016914	CGCTC	2	10	433479	433488	0 %	20 %	20 %	60 %	379017612
11017	NC_016914	TTAA	2	8	433566	433573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_016914	TAT	2	6	433597	433602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017613
11019	NC_016914	ACA	2	6	433628	433633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017613
11020	NC_016914	A	6	6	433645	433650	100 %	0 %	0 %	0 %	379017613
11021	NC_016914	GAA	2	6	433655	433660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017613
11022	NC_016914	AGC	2	6	433669	433674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017613
11023	NC_016914	ATA	2	6	433743	433748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017613
11024	NC_016914	ATT	2	6	433751	433756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017613
11025	NC_016914	ATG	2	6	433907	433912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017613
11026	NC_016914	TTG	2	6	433914	433919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017613
11027	NC_016914	AT	3	6	433932	433937	50 %	50 %	0 %	0 %	379017613
11028	NC_016914	AAT	2	6	433976	433981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017613
11029	NC_016914	GCA	2	6	433985	433990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017613
11030	NC_016914	AAT	2	6	434048	434053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017613
11031	NC_016914	CTG	2	6	434058	434063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017613
11032	NC_016914	TG	3	6	434103	434108	0 %	50 %	50 %	0 %	379017613
11033	NC_016914	ATA	2	6	434121	434126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017613
11034	NC_016914	CTA	2	6	434153	434158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017614
11035	NC_016914	ACT	2	6	434161	434166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017614
11036	NC_016914	A	6	6	434170	434175	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11037	NC_016914	TGAA	2	8	434207	434214	50 %	25 %	25 %	0 %	379017614
11038	NC_016914	A	6	6	434248	434253	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11039	NC_016914	GTC	2	6	434282	434287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017614
11040	NC_016914	A	6	6	434328	434333	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11041	NC_016914	ACG	2	6	434379	434384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017614
11042	NC_016914	AAT	2	6	434472	434477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017614
11043	NC_016914	A	6	6	434510	434515	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11044	NC_016914	GA	3	6	434563	434568	50 %	0 %	50 %	0 %	379017614
11045	NC_016914	TAG	2	6	434582	434587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11046	NC_016914	TAG	2	6	434598	434603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11047	NC_016914	A	6	6	434627	434632	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11048	NC_016914	TGA	2	6	434649	434654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11049	NC_016914	GAAATT	2	12	434659	434670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379017614
11050	NC_016914	TAC	2	6	434682	434687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017614
11051	NC_016914	CGG	2	6	434694	434699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017614
11052	NC_016914	AGT	2	6	434782	434787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11053	NC_016914	A	8	8	434799	434806	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11054	NC_016914	TAT	3	9	434829	434837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017614
11055	NC_016914	GAA	2	6	434842	434847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017614
11056	NC_016914	A	6	6	434870	434875	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11057	NC_016914	ATG	2	6	434906	434911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11058	NC_016914	TGA	2	6	434925	434930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11059	NC_016914	A	6	6	434967	434972	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11060	NC_016914	AG	3	6	434986	434991	50 %	0 %	50 %	0 %	379017614
11061	NC_016914	ACG	2	6	435028	435033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017614
11062	NC_016914	AT	3	6	435068	435073	50 %	50 %	0 %	0 %	379017614
11063	NC_016914	TATT	2	8	435074	435081	25 %	75 %	0 %	0 %	379017614
11064	NC_016914	TTA	2	6	435118	435123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017614
11065	NC_016914	AAGG	2	8	435134	435141	50 %	0 %	50 %	0 %	379017614
11066	NC_016914	GAT	2	6	435178	435183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11067	NC_016914	TAA	2	6	435218	435223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017614
11068	NC_016914	ACGT	2	8	435254	435261	25 %	25 %	25 %	25 %	379017614
11069	NC_016914	TGC	2	6	435270	435275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017614
11070	NC_016914	ATACT	2	10	435353	435362	40 %	40 %	0 %	20 %	379017614
11071	NC_016914	A	7	7	435412	435418	100 %	0 %	0 %	0 %	379017614
11072	NC_016914	GAT	2	6	435427	435432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11073	NC_016914	ATA	2	6	435460	435465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017614
11074	NC_016914	GTA	2	6	435495	435500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017614
11075	NC_016914	TCAA	2	8	435507	435514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11076	NC_016914	TCA	2	6	435538	435543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_016914	TTA	2	6	435592	435597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_016914	TAG	2	6	435644	435649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_016914	AGT	2	6	435737	435742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017615
11080	NC_016914	TCT	2	6	435747	435752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017615
11081	NC_016914	TAA	2	6	435784	435789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017615
11082	NC_016914	AAG	2	6	435814	435819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017615
11083	NC_016914	ATA	2	6	436044	436049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017615
11084	NC_016914	TTG	2	6	436053	436058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017615
11085	NC_016914	CTC	2	6	436110	436115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_016914	AAGCT	2	10	436119	436128	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11087	NC_016914	A	6	6	436176	436181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_016914	GCA	2	6	436205	436210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_016914	TCC	2	6	436239	436244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017616
11090	NC_016914	TGC	2	6	436266	436271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017616
11091	NC_016914	ACTA	2	8	436287	436294	50 %	25 %	0 %	25 %	379017616
11092	NC_016914	GTA	2	6	436322	436327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017616
11093	NC_016914	AGC	2	6	436417	436422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017616
11094	NC_016914	TAT	2	6	436522	436527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017617
11095	NC_016914	GATTT	2	10	436533	436542	20 %	60 %	20 %	0 %	379017617
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11097	NC_016914	AT	3	6	436615	436620	50 %	50 %	0 %	0 %	379017617
11098	NC_016914	GTT	2	6	436708	436713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017617
11099	NC_016914	TATGC	2	10	436721	436730	20 %	40 %	20 %	20 %	379017617
11100	NC_016914	TGAA	2	8	436755	436762	50 %	25 %	25 %	0 %	379017617
11101	NC_016914	TAAA	2	8	436767	436774	75 %	25 %	0 %	0 %	379017617
11102	NC_016914	TGCT	2	8	436824	436831	0 %	50 %	25 %	25 %	379017617
11103	NC_016914	TAA	2	6	436903	436908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017617
11104	NC_016914	GAC	2	6	437003	437008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_016914	AT	3	6	437056	437061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_016914	GAT	2	6	437066	437071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_016914	TAA	2	6	437097	437102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017618
11108	NC_016914	TTA	2	6	437126	437131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017618
11109	NC_016914	ATTT	2	8	437164	437171	25 %	75 %	0 %	0 %	379017618
11110	NC_016914	TAA	2	6	437238	437243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_016914	GAA	2	6	437293	437298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017619
11112	NC_016914	AT	3	6	437307	437312	50 %	50 %	0 %	0 %	379017619
11113	NC_016914	TAG	2	6	437370	437375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017619
11114	NC_016914	ATT	2	6	437408	437413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017619
11115	NC_016914	CTA	2	6	437414	437419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017619
11116	NC_016914	A	7	7	437421	437427	100 %	0 %	0 %	0 %	379017619
11117	NC_016914	ATA	2	6	437461	437466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017619
11118	NC_016914	A	6	6	437514	437519	100 %	0 %	0 %	0 %	379017620
11119	NC_016914	TA	3	6	437569	437574	50 %	50 %	0 %	0 %	379017620
11120	NC_016914	TGT	2	6	437591	437596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017620
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11122	NC_016914	ATG	2	6	437617	437622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017620
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11233	NC_016914	CGCTC	2	10	441525	441534	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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11242	NC_016914	ATA	2	6	441991	441996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11243	NC_016914	A	6	6	441996	442001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11495	NC_016914	TAT	2	6	451770	451775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017635
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