MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016914	AT	3	6	19830	19835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016914	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_016914	A	6	6	19872	19877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016914	A	7	7	19880	19886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016914	TTG	2	6	19887	19892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016914	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016914	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016914	ATT	2	6	19969	19974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016914	AT	3	6	20115	20120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016914	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016914	TTTAA	2	10	20162	20171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016914	AAC	2	6	20203	20208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017193
513	NC_016914	A	7	7	20216	20222	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
514	NC_016914	AAG	2	6	20302	20307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
515	NC_016914	TAA	2	6	20327	20332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
516	NC_016914	TTG	2	6	20334	20339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017193
517	NC_016914	GCA	2	6	20387	20392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017193
518	NC_016914	GTA	2	6	20536	20541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017193
519	NC_016914	A	6	6	20608	20613	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
520	NC_016914	TAA	2	6	20680	20685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
521	NC_016914	TAC	2	6	20750	20755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017193
522	NC_016914	TAC	2	6	20777	20782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017193
523	NC_016914	CAT	2	6	20797	20802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017193
524	NC_016914	ACC	2	6	20870	20875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017193
525	NC_016914	GCA	2	6	20892	20897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017193
526	NC_016914	CAA	2	6	20928	20933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017193
527	NC_016914	TCC	2	6	20972	20977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017193
528	NC_016914	A	7	7	21005	21011	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
529	NC_016914	GTAA	2	8	21039	21046	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
530	NC_016914	GAT	2	6	21065	21070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017193
531	NC_016914	A	6	6	21120	21125	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
532	NC_016914	A	6	6	21172	21177	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
533	NC_016914	TCAAG	2	10	21190	21199	40 %	20 %	20 %	20 %	379017193
534	NC_016914	ATAAA	2	10	21244	21253	80 %	20 %	0 %	0 %	379017193
535	NC_016914	AGAT	2	8	21293	21300	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
536	NC_016914	A	6	6	21316	21321	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
537	NC_016914	AGCA	2	8	21412	21419	50 %	0 %	25 %	25 %	379017193
538	NC_016914	TAA	2	6	21449	21454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
539	NC_016914	AAAT	2	8	21455	21462	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
540	NC_016914	AGAAA	2	10	21506	21515	80 %	0 %	20 %	0 %	379017193
541	NC_016914	A	6	6	21513	21518	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
542	NC_016914	AAG	2	6	21520	21525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
543	NC_016914	GCT	2	6	21600	21605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017193
544	NC_016914	AGA	2	6	21614	21619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
545	NC_016914	AATG	2	8	21656	21663	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
546	NC_016914	TTA	2	6	21705	21710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017193
547	NC_016914	TGT	2	6	21716	21721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017193
548	NC_016914	AAAGC	2	10	21762	21771	60 %	0 %	20 %	20 %	379017193
549	NC_016914	AAC	2	6	21814	21819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017193
550	NC_016914	CAG	2	6	21858	21863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017193
551	NC_016914	ATTA	2	8	21957	21964	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
552	NC_016914	GAATA	2	10	21968	21977	60 %	20 %	20 %	0 %	379017193
553	NC_016914	ATAG	2	8	22005	22012	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
554	NC_016914	ATAG	2	8	22017	22024	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
555	NC_016914	TAT	2	6	22246	22251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017193
556	NC_016914	ATC	2	6	22280	22285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017193
557	NC_016914	GAA	2	6	22293	22298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
558	NC_016914	ACA	2	6	22348	22353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017193
559	NC_016914	TTC	2	6	22376	22381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017193
560	NC_016914	TAA	2	6	22394	22399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
561	NC_016914	ATTTAG	2	12	22414	22425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379017193
562	NC_016914	CGTT	2	8	22435	22442	0 %	50 %	25 %	25 %	379017193
563	NC_016914	TAA	2	6	22489	22494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
564	NC_016914	AAT	2	6	22542	22547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
565	NC_016914	ACA	2	6	22571	22576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017193
566	NC_016914	A	6	6	22588	22593	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
567	NC_016914	GAT	2	6	22620	22625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017193
568	NC_016914	GAA	2	6	22668	22673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
569	NC_016914	A	6	6	22698	22703	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
570	NC_016914	TAATA	2	10	22709	22718	60 %	40 %	0 %	0 %	379017193
571	NC_016914	AG	3	6	22720	22725	50 %	0 %	50 %	0 %	379017193
572	NC_016914	CA	3	6	22752	22757	50 %	0 %	0 %	50 %	379017193
573	NC_016914	ATT	2	6	22759	22764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017193
574	NC_016914	CAAAG	2	10	22801	22810	60 %	0 %	20 %	20 %	379017193
575	NC_016914	TAGT	2	8	22882	22889	25 %	50 %	25 %	0 %	379017193
576	NC_016914	A	6	6	22898	22903	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
577	NC_016914	AAC	2	6	22955	22960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017193
578	NC_016914	TTAGT	2	10	22984	22993	20 %	60 %	20 %	0 %	379017193
579	NC_016914	TC	3	6	23035	23040	0 %	50 %	0 %	50 %	379017193
580	NC_016914	CAG	2	6	23049	23054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017193
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582	NC_016914	AGCAG	2	10	23127	23136	40 %	0 %	40 %	20 %	379017193
583	NC_016914	ATA	2	6	23149	23154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
584	NC_016914	A	6	6	23237	23242	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
585	NC_016914	TA	3	6	23278	23283	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
586	NC_016914	CAA	2	6	23298	23303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017193
587	NC_016914	TAA	2	6	23329	23334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
588	NC_016914	CTA	2	6	23410	23415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017193
589	NC_016914	TA	3	6	23414	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
590	NC_016914	TGA	2	6	23432	23437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017193
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592	NC_016914	ATT	2	6	23528	23533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017193
593	NC_016914	ATTTAG	2	12	23566	23577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379017193
594	NC_016914	AAGC	2	8	23622	23629	50 %	0 %	25 %	25 %	379017193
595	NC_016914	TGA	2	6	23813	23818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017193
596	NC_016914	GTG	2	6	23836	23841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017193
597	NC_016914	TAAA	2	8	23947	23954	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
598	NC_016914	ATG	2	6	24061	24066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017193
599	NC_016914	AGT	2	6	24072	24077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017193
600	NC_016914	TGT	2	6	24083	24088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017193
601	NC_016914	TAA	2	6	24119	24124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
602	NC_016914	TA	3	6	24141	24146	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
603	NC_016914	AGA	2	6	24176	24181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
604	NC_016914	AAG	2	6	24226	24231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
605	NC_016914	TA	3	6	24240	24245	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
606	NC_016914	A	6	6	24280	24285	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
607	NC_016914	TAA	2	6	24295	24300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
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609	NC_016914	A	6	6	24325	24330	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
610	NC_016914	TTC	2	6	24332	24337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017193
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612	NC_016914	TACCT	2	10	24419	24428	20 %	40 %	0 %	40 %	379017193
613	NC_016914	GAA	2	6	24438	24443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
614	NC_016914	AAG	2	6	24445	24450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
615	NC_016914	AAGT	2	8	24457	24464	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
616	NC_016914	TACCT	2	10	24506	24515	20 %	40 %	0 %	40 %	379017193
617	NC_016914	GAA	2	6	24525	24530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
618	NC_016914	AAG	2	6	24532	24537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
619	NC_016914	AAGT	2	8	24544	24551	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
620	NC_016914	TACCT	2	10	24593	24602	20 %	40 %	0 %	40 %	379017193
621	NC_016914	GAA	2	6	24612	24617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
622	NC_016914	AAG	2	6	24619	24624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
623	NC_016914	AAGT	2	8	24631	24638	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
624	NC_016914	GCATTA	2	12	24684	24695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379017193
625	NC_016914	GAA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
626	NC_016914	GAA	3	9	24777	24785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
627	NC_016914	TCCGAT	2	12	24801	24812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379017193
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629	NC_016914	AAATGC	2	12	24877	24888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379017193
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