MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016914	TTA	2	6	277121	277126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_016914	GA	3	6	277162	277167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_016914	ATTGCA	2	12	277201	277212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7004	NC_016914	A	6	6	277224	277229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_016914	AT	3	6	277237	277242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_016914	TGA	2	6	277248	277253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_016914	CAA	2	6	277256	277261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_016914	TAC	2	6	277326	277331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_016914	TAT	2	6	277359	277364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_016914	TA	3	6	277399	277404	50 %	50 %	0 %	0 %	379017443
7011	NC_016914	TAT	2	6	277447	277452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017443
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7013	NC_016914	CTT	2	6	277487	277492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017443
7014	NC_016914	TTA	2	6	277522	277527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017443
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7016	NC_016914	GTC	2	6	277589	277594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017443
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7019	NC_016914	A	7	7	277685	277691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_016914	A	6	6	277734	277739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_016914	TAT	2	6	277809	277814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_016914	TAG	2	6	277858	277863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_016914	TAT	2	6	277905	277910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_016914	ACC	2	6	277943	277948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_016914	GGT	2	6	277965	277970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7029	NC_016914	AAT	2	6	278178	278183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_016914	AT	3	6	278188	278193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_016914	GTC	2	6	278245	278250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_016914	A	6	6	278319	278324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_016914	TA	3	6	278357	278362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_016914	A	6	6	278371	278376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_016914	CAA	2	6	278417	278422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7038	NC_016914	TAT	2	6	278498	278503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_016914	TAT	2	6	278509	278514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_016914	TCT	3	9	278562	278570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017445
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7042	NC_016914	TATCT	2	10	278608	278617	20 %	60 %	0 %	20 %	379017445
7043	NC_016914	AGTA	2	8	278639	278646	50 %	25 %	25 %	0 %	379017445
7044	NC_016914	CATG	2	8	278705	278712	25 %	25 %	25 %	25 %	379017445
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7051	NC_016914	TA	4	8	279139	279146	50 %	50 %	0 %	0 %	379017445
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7060	NC_016914	AGT	2	6	279491	279496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017445
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7063	NC_016914	TGA	2	6	279580	279585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017445
7064	NC_016914	AAG	2	6	279592	279597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017445
7065	NC_016914	AGT	3	9	279626	279634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017445
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7097	NC_016914	CTG	2	6	281203	281208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017445
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7099	NC_016914	TCA	2	6	281352	281357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7101	NC_016914	TTG	2	6	281371	281376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_016914	CAA	2	6	281449	281454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_016914	AGC	2	6	281464	281469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7105	NC_016914	TTA	2	6	281555	281560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_016914	C	8	8	281586	281593	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7107	NC_016914	A	9	9	281594	281602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_016914	CT	3	6	281637	281642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_016914	ATA	2	6	281643	281648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_016914	T	7	7	281690	281696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_016914	ACT	2	6	281697	281702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7113	NC_016914	ATT	2	6	281775	281780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7120	NC_016914	ATT	2	6	282003	282008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_016914	TGTT	2	8	282027	282034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_016914	TA	3	6	282060	282065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_016914	AT	3	6	282067	282072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_016914	TTG	2	6	282127	282132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017447
7125	NC_016914	ATT	2	6	282148	282153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017447
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7255	NC_016914	CAT	2	6	287312	287317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7257	NC_016914	CAA	2	6	287365	287370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7258	NC_016914	CCTGAA	2	12	287639	287650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7260	NC_016914	GA	3	6	287788	287793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7263	NC_016914	AGG	2	6	287978	287983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7265	NC_016914	CGAAG	2	10	288245	288254	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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7270	NC_016914	TGA	2	6	288572	288577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7275	NC_016914	CTG	2	6	288857	288862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7277	NC_016914	TG	3	6	288960	288965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7282	NC_016914	GTA	2	6	289171	289176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7287	NC_016914	TGG	2	6	289278	289283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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