MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016914	ATTT	2	8	257759	257766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_016914	AG	3	6	257809	257814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_016914	ATA	2	6	257817	257822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_016914	AAT	2	6	257855	257860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017424
6505	NC_016914	CT	3	6	257888	257893	0 %	50 %	0 %	50 %	379017424
6506	NC_016914	TTG	3	9	257894	257902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017424
6507	NC_016914	TGTT	2	8	257915	257922	0 %	75 %	25 %	0 %	379017424
6508	NC_016914	TTA	2	6	257931	257936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017424
6509	NC_016914	GTT	2	6	257981	257986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017424
6510	NC_016914	ACA	2	6	258001	258006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017424
6511	NC_016914	GCT	2	6	258010	258015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017424
6512	NC_016914	GCA	2	6	258031	258036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017424
6513	NC_016914	TGT	2	6	258046	258051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017424
6514	NC_016914	AT	3	6	258082	258087	50 %	50 %	0 %	0 %	379017424
6515	NC_016914	TTAT	2	8	258115	258122	25 %	75 %	0 %	0 %	379017425
6516	NC_016914	ATT	2	6	258159	258164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017425
6517	NC_016914	TCG	2	6	258217	258222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017425
6518	NC_016914	TTC	2	6	258246	258251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017425
6519	NC_016914	TCT	2	6	258298	258303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017425
6520	NC_016914	AT	3	6	258314	258319	50 %	50 %	0 %	0 %	379017425
6521	NC_016914	AGC	2	6	258335	258340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_016914	T	6	6	258398	258403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_016914	ATA	2	6	258404	258409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_016914	T	6	6	258441	258446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_016914	AGA	2	6	258449	258454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_016914	TGT	2	6	258521	258526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_016914	TTC	2	6	258536	258541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_016914	AAT	2	6	258543	258548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_016914	TTA	2	6	258660	258665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_016914	TTGT	2	8	258668	258675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_016914	AAGA	2	8	258724	258731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_016914	T	6	6	258733	258738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_016914	GTATT	2	10	258748	258757	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_016914	A	6	6	258799	258804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_016914	AGT	2	6	258810	258815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_016914	TA	3	6	258825	258830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_016914	ATTG	2	8	258848	258855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_016914	ATTA	2	8	258862	258869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_016914	TGTA	2	8	258895	258902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_016914	GCT	2	6	258945	258950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_016914	AG	4	8	259001	259008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_016914	TTA	2	6	259011	259016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_016914	AT	3	6	259068	259073	50 %	50 %	0 %	0 %	379017426
6544	NC_016914	ATT	2	6	259122	259127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017426
6545	NC_016914	TGT	2	6	259135	259140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017426
6546	NC_016914	TTA	2	6	259142	259147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017426
6547	NC_016914	T	6	6	259170	259175	0 %	100 %	0 %	0 %	379017426
6548	NC_016914	TTC	2	6	259179	259184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017426
6549	NC_016914	TCT	2	6	259207	259212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017426
6550	NC_016914	T	7	7	259251	259257	0 %	100 %	0 %	0 %	379017426
6551	NC_016914	CTA	2	6	259259	259264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017426
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6553	NC_016914	T	6	6	259389	259394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_016914	AT	3	6	259401	259406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_016914	GTT	2	6	259438	259443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_016914	AAT	2	6	259453	259458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_016914	TTC	2	6	259473	259478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_016914	T	7	7	259522	259528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_016914	TAC	2	6	259549	259554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017427
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6561	NC_016914	AAT	2	6	259592	259597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017427
6562	NC_016914	TCT	3	9	259651	259659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017427
6563	NC_016914	AT	3	6	259702	259707	50 %	50 %	0 %	0 %	379017427
6564	NC_016914	CGC	2	6	259753	259758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_016914	TAA	3	9	259774	259782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6568	NC_016914	TAT	2	6	259876	259881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_016914	T	6	6	259935	259940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_016914	TA	3	6	259947	259952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_016914	TGA	2	6	259965	259970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_016914	AT	3	6	260020	260025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_016914	TAA	2	6	260101	260106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_016914	TGAA	2	8	260187	260194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_016914	ATA	2	6	260334	260339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_016914	GCA	2	6	260358	260363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6578	NC_016914	TAT	3	9	260512	260520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_016914	TAG	2	6	260582	260587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6582	NC_016914	TAG	2	6	260719	260724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6585	NC_016914	TTG	2	6	260873	260878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_016914	T	6	6	260901	260906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_016914	TTA	2	6	260947	260952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_016914	CTA	2	6	260985	260990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6590	NC_016914	AGTA	2	8	261019	261026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_016914	TGAT	2	8	261062	261069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_016914	TTA	2	6	261155	261160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_016914	A	6	6	261160	261165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_016914	TAG	2	6	261198	261203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6597	NC_016914	AT	3	6	261260	261265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6602	NC_016914	TTA	2	6	261422	261427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_016914	ATA	2	6	261431	261436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_016914	GCT	2	6	261605	261610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_016914	TAC	2	6	261624	261629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6609	NC_016914	GCC	2	6	261784	261789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_016914	ATT	2	6	261799	261804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_016914	ATA	2	6	261885	261890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_016914	AGG	2	6	262036	262041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_016914	ATA	2	6	262053	262058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_016914	TAA	2	6	262077	262082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_016914	GA	3	6	262099	262104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_016914	GAC	2	6	262268	262273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_016914	CAT	2	6	262296	262301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6619	NC_016914	TAA	2	6	262348	262353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_016914	TAA	2	6	262403	262408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_016914	AT	5	10	262453	262462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_016914	TCA	2	6	262493	262498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_016914	ATA	2	6	262514	262519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_016914	T	6	6	262520	262525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_016914	TAA	2	6	262541	262546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_016914	A	6	6	262548	262553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_016914	TAA	2	6	262570	262575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_016914	TTA	2	6	262579	262584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_016914	ATT	2	6	262638	262643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_016914	CTTA	2	8	262644	262651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6631	NC_016914	TGC	2	6	262662	262667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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