MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016914	TGG	2	6	239438	239443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017406
6003	NC_016914	CTA	2	6	239524	239529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017406
6004	NC_016914	GCA	2	6	239542	239547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017406
6005	NC_016914	ATT	2	6	239568	239573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017406
6006	NC_016914	CCG	2	6	239593	239598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017406
6007	NC_016914	AGC	2	6	239607	239612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017406
6008	NC_016914	AGC	2	6	239661	239666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017406
6009	NC_016914	TGC	2	6	239696	239701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017406
6010	NC_016914	TTGCT	2	10	239724	239733	0 %	60 %	20 %	20 %	379017406
6011	NC_016914	CGAA	2	8	239828	239835	50 %	0 %	25 %	25 %	379017406
6012	NC_016914	TCA	2	6	239875	239880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017406
6013	NC_016914	CTA	2	6	239933	239938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017406
6014	NC_016914	TTAG	2	8	239941	239948	25 %	50 %	25 %	0 %	379017406
6015	NC_016914	ATG	2	6	240000	240005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017406
6016	NC_016914	CAC	2	6	240050	240055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017406
6017	NC_016914	TGTA	2	8	240090	240097	25 %	50 %	25 %	0 %	379017406
6018	NC_016914	CTTCTA	2	12	240113	240124	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379017406
6019	NC_016914	T	7	7	240143	240149	0 %	100 %	0 %	0 %	379017406
6020	NC_016914	AGA	2	6	240156	240161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017406
6021	NC_016914	TTA	2	6	240184	240189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017406
6022	NC_016914	TA	3	6	240188	240193	50 %	50 %	0 %	0 %	379017406
6023	NC_016914	T	6	6	240199	240204	0 %	100 %	0 %	0 %	379017406
6024	NC_016914	TCT	2	6	240334	240339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017406
6025	NC_016914	T	6	6	240388	240393	0 %	100 %	0 %	0 %	379017406
6026	NC_016914	AGA	2	6	240498	240503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017406
6027	NC_016914	ATT	3	9	240507	240515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017406
6028	NC_016914	T	7	7	240525	240531	0 %	100 %	0 %	0 %	379017406
6029	NC_016914	TCA	2	6	240535	240540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017406
6030	NC_016914	ATT	2	6	240547	240552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017406
6031	NC_016914	TAT	3	9	240578	240586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017406
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6036	NC_016914	T	7	7	240701	240707	0 %	100 %	0 %	0 %	379017406
6037	NC_016914	TCT	2	6	240712	240717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017406
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6039	NC_016914	GTT	2	6	240743	240748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016914	TTC	2	6	240800	240805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_016914	TTA	2	6	240852	240857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016914	TA	3	6	240885	240890	50 %	50 %	0 %	0 %	379017407
6043	NC_016914	T	6	6	240905	240910	0 %	100 %	0 %	0 %	379017407
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6049	NC_016914	TA	3	6	241343	241348	50 %	50 %	0 %	0 %	379017407
6050	NC_016914	TGC	2	6	241353	241358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017407
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6053	NC_016914	ATAA	2	8	241450	241457	75 %	25 %	0 %	0 %	379017407
6054	NC_016914	AAT	2	6	241560	241565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017407
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6057	NC_016914	TTTA	2	8	241788	241795	25 %	75 %	0 %	0 %	379017407
6058	NC_016914	T	6	6	241812	241817	0 %	100 %	0 %	0 %	379017407
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6060	NC_016914	CTT	2	6	241928	241933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017407
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6065	NC_016914	TC	3	6	242093	242098	0 %	50 %	0 %	50 %	379017407
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6070	NC_016914	TAT	2	6	242357	242362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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