MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_016913	TTAA	2	8	1217206	1217213	50 %	50 %	0 %	0 %	379017125
31003	NC_016913	TAG	2	6	1217234	1217239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017125
31004	NC_016913	TGA	2	6	1217256	1217261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017125
31005	NC_016913	AGA	2	6	1217280	1217285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017125
31006	NC_016913	GCAA	2	8	1217291	1217298	50 %	0 %	25 %	25 %	379017125
31007	NC_016913	TTA	2	6	1217299	1217304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017125
31008	NC_016913	ATT	2	6	1217397	1217402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017125
31009	NC_016913	A	6	6	1217414	1217419	100 %	0 %	0 %	0 %	379017125
31010	NC_016913	TAT	2	6	1217477	1217482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017125
31011	NC_016913	T	6	6	1217509	1217514	0 %	100 %	0 %	0 %	379017125
31012	NC_016913	TTA	2	6	1217569	1217574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017125
31013	NC_016913	ATT	2	6	1217589	1217594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017125
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31017	NC_016913	AGCA	2	8	1217794	1217801	50 %	0 %	25 %	25 %	379017126
31018	NC_016913	TGA	2	6	1217819	1217824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017126
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31024	NC_016913	TAT	2	6	1218248	1218253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017126
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31032	NC_016913	CTGTT	2	10	1218665	1218674	0 %	60 %	20 %	20 %	379017127
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31040	NC_016913	AAAT	2	8	1219087	1219094	75 %	25 %	0 %	0 %	379017127
31041	NC_016913	TAA	2	6	1219114	1219119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017127
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31055	NC_016913	TCT	2	6	1219903	1219908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017127
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31067	NC_016913	T	8	8	1220326	1220333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31068	NC_016913	TA	3	6	1220380	1220385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31104	NC_016913	TGC	3	9	1221659	1221667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017130
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31109	NC_016913	ATTTT	2	10	1221884	1221893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31110	NC_016913	AAT	2	6	1221903	1221908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017131
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31119	NC_016913	CTA	2	6	1222168	1222173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017131
31120	NC_016913	ATA	2	6	1222291	1222296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017131
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31136	NC_016913	ATA	2	6	1222897	1222902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31179	NC_016913	GCGA	2	8	1224650	1224657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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31182	NC_016913	AT	4	8	1224768	1224775	50 %	50 %	0 %	0 %	379017134
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31203	NC_016913	A	6	6	1225615	1225620	100 %	0 %	0 %	0 %	379017134
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31207	NC_016913	TAC	2	6	1225737	1225742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31208	NC_016913	CAATGA	2	12	1225821	1225832	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31209	NC_016913	TTAAA	2	10	1225840	1225849	60 %	40 %	0 %	0 %	379017135
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31211	NC_016913	AT	4	8	1225935	1225942	50 %	50 %	0 %	0 %	379017135
31212	NC_016913	TCT	2	6	1225955	1225960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017135
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31220	NC_016913	T	7	7	1226246	1226252	0 %	100 %	0 %	0 %	379017135
31221	NC_016913	TAA	2	6	1226260	1226265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017135
31222	NC_016913	TTCATT	2	12	1226315	1226326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379017135
31223	NC_016913	CTT	2	6	1226340	1226345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017135
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31226	NC_016913	TAC	2	6	1226470	1226475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017135
31227	NC_016913	TAACAT	2	12	1226529	1226540	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379017135
31228	NC_016913	TAC	2	6	1226547	1226552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017135
31229	NC_016913	TAC	2	6	1226601	1226606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017135
31230	NC_016913	TAT	2	6	1226608	1226613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017135
31231	NC_016913	ATTTA	2	10	1226626	1226635	40 %	60 %	0 %	0 %	379017135
31232	NC_016913	CTTT	2	8	1226714	1226721	0 %	75 %	0 %	25 %	379017135
31233	NC_016913	T	6	6	1226729	1226734	0 %	100 %	0 %	0 %	379017135
31234	NC_016913	GCA	2	6	1226741	1226746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017135
31235	NC_016913	GTT	2	6	1226757	1226762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017135
31236	NC_016913	T	8	8	1226811	1226818	0 %	100 %	0 %	0 %	379017135
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31362	NC_016913	ATT	2	6	1231305	1231310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017139
31363	NC_016913	TCA	2	6	1231318	1231323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017139
31364	NC_016913	AT	3	6	1231329	1231334	50 %	50 %	0 %	0 %	379017139
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31377	NC_016913	T	6	6	1231972	1231977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31465	NC_016913	AAT	2	6	1235417	1235422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31469	NC_016913	AGTGA	2	10	1235480	1235489	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31470	NC_016913	A	6	6	1235539	1235544	100 %	0 %	0 %	0 %	379017146
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31480	NC_016913	AG	3	6	1236160	1236165	50 %	0 %	50 %	0 %	379017146
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