MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_016913	TTAAT	2	10	1159631	1159640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29502	NC_016913	TCT	2	6	1159641	1159646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29503	NC_016913	TAA	2	6	1159647	1159652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29504	NC_016913	T	7	7	1159685	1159691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29505	NC_016913	GTT	2	6	1159716	1159721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29506	NC_016913	TTA	2	6	1159791	1159796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29507	NC_016913	GCT	2	6	1159822	1159827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29508	NC_016913	GAC	2	6	1159834	1159839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29509	NC_016913	ATA	2	6	1159890	1159895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29510	NC_016913	TA	3	6	1159907	1159912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29511	NC_016913	AGT	2	6	1159951	1159956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017059
29512	NC_016913	T	6	6	1160004	1160009	0 %	100 %	0 %	0 %	379017059
29513	NC_016913	CCT	2	6	1160026	1160031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017059
29514	NC_016913	GCT	3	9	1160143	1160151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017059
29515	NC_016913	TTA	2	6	1160200	1160205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017059
29516	NC_016913	T	8	8	1160247	1160254	0 %	100 %	0 %	0 %	379017059
29517	NC_016913	CTA	2	6	1160276	1160281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017059
29518	NC_016913	AAT	2	6	1160283	1160288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017059
29519	NC_016913	TTG	2	6	1160300	1160305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017059
29520	NC_016913	A	6	6	1160325	1160330	100 %	0 %	0 %	0 %	379017059
29521	NC_016913	TA	3	6	1160335	1160340	50 %	50 %	0 %	0 %	379017059
29522	NC_016913	TTA	2	6	1160369	1160374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017059
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29524	NC_016913	TAT	2	6	1160388	1160393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017059
29525	NC_016913	TAGAA	2	10	1160442	1160451	60 %	20 %	20 %	0 %	379017059
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29529	NC_016913	ACT	2	6	1160620	1160625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017059
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29531	NC_016913	CGG	2	6	1160886	1160891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017059
29532	NC_016913	TAT	2	6	1160907	1160912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017059
29533	NC_016913	TAT	3	9	1160931	1160939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017059
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29535	NC_016913	TGT	2	6	1161003	1161008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29536	NC_016913	GTC	2	6	1161024	1161029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29537	NC_016913	AGC	2	6	1161036	1161041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29538	NC_016913	A	7	7	1161063	1161069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29539	NC_016913	ATT	2	6	1161118	1161123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29540	NC_016913	AGA	2	6	1161161	1161166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29541	NC_016913	TAAA	2	8	1161171	1161178	75 %	25 %	0 %	0 %	379017060
29542	NC_016913	TGGAT	2	10	1161203	1161212	20 %	40 %	40 %	0 %	379017060
29543	NC_016913	TAG	2	6	1161236	1161241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017060
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29547	NC_016913	TACGGT	2	12	1161546	1161557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379017060
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29552	NC_016913	TAA	2	6	1161879	1161884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017061
29553	NC_016913	GGC	2	6	1161925	1161930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017061
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29557	NC_016913	AAT	2	6	1162006	1162011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017061
29558	NC_016913	GTA	2	6	1162012	1162017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017061
29559	NC_016913	AAT	2	6	1162068	1162073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017061
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29570	NC_016913	AT	3	6	1162535	1162540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29588	NC_016913	ATTA	2	8	1163111	1163118	50 %	50 %	0 %	0 %	379017063
29589	NC_016913	ATT	3	9	1163183	1163191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017063
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29592	NC_016913	T	7	7	1163248	1163254	0 %	100 %	0 %	0 %	379017063
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29603	NC_016913	AAT	2	6	1163566	1163571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017063
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29609	NC_016913	AT	3	6	1163987	1163992	50 %	50 %	0 %	0 %	379017063
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