MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_016913	AGC	2	6	1120061	1120066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28502	NC_016913	T	6	6	1120073	1120078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28503	NC_016913	ATG	2	6	1120114	1120119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28504	NC_016913	ATA	2	6	1120126	1120131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28505	NC_016913	GAA	2	6	1120146	1120151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28506	NC_016913	A	8	8	1120150	1120157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28507	NC_016913	TACT	2	8	1120168	1120175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28508	NC_016913	TAA	2	6	1120193	1120198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28509	NC_016913	A	8	8	1120281	1120288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28510	NC_016913	T	6	6	1120344	1120349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28511	NC_016913	ATA	2	6	1120364	1120369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28512	NC_016913	ATC	2	6	1120442	1120447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28513	NC_016913	AT	3	6	1120457	1120462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28514	NC_016913	GTT	2	6	1120479	1120484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28515	NC_016913	ACT	2	6	1120498	1120503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28516	NC_016913	AAG	2	6	1120508	1120513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28517	NC_016913	CACAT	2	10	1120520	1120529	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28518	NC_016913	GAT	2	6	1120532	1120537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28519	NC_016913	ACT	2	6	1120547	1120552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28520	NC_016913	ATA	2	6	1120610	1120615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28521	NC_016913	A	8	8	1120692	1120699	100 %	0 %	0 %	0 %	379017015
28522	NC_016913	TTC	2	6	1120707	1120712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017015
28523	NC_016913	AGA	2	6	1120723	1120728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017015
28524	NC_016913	GAA	3	9	1120777	1120785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017015
28525	NC_016913	GTT	2	6	1120790	1120795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017015
28526	NC_016913	TAA	2	6	1120833	1120838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017015
28527	NC_016913	GAT	2	6	1120894	1120899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017015
28528	NC_016913	ATTT	2	8	1120907	1120914	25 %	75 %	0 %	0 %	379017015
28529	NC_016913	T	6	6	1120912	1120917	0 %	100 %	0 %	0 %	379017015
28530	NC_016913	GA	3	6	1120920	1120925	50 %	0 %	50 %	0 %	379017015
28531	NC_016913	TGT	3	9	1121027	1121035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28532	NC_016913	GAA	3	9	1121049	1121057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28533	NC_016913	ATG	3	9	1121134	1121142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28534	NC_016913	TAC	2	6	1121143	1121148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28535	NC_016913	CAA	2	6	1121149	1121154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28536	NC_016913	AT	3	6	1121196	1121201	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
28537	NC_016913	AATT	2	8	1121272	1121279	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
28538	NC_016913	GATA	2	8	1121297	1121304	50 %	25 %	25 %	0 %	379017016
28539	NC_016913	GAT	2	6	1121307	1121312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017016
28540	NC_016913	TGC	2	6	1121313	1121318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017016
28541	NC_016913	AAG	2	6	1121371	1121376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017016
28542	NC_016913	A	6	6	1121452	1121457	100 %	0 %	0 %	0 %	379017016
28543	NC_016913	A	6	6	1121480	1121485	100 %	0 %	0 %	0 %	379017016
28544	NC_016913	AAGA	2	8	1121511	1121518	75 %	0 %	25 %	0 %	379017016
28545	NC_016913	TAA	2	6	1121569	1121574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017016
28546	NC_016913	CTT	3	9	1121580	1121588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017016
28547	NC_016913	ATA	2	6	1121620	1121625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017016
28548	NC_016913	ATG	2	6	1121634	1121639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017016
28549	NC_016913	GCG	2	6	1121722	1121727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017016
28550	NC_016913	TGC	2	6	1121780	1121785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017016
28551	NC_016913	GCA	2	6	1121787	1121792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017016
28552	NC_016913	AG	3	6	1121842	1121847	50 %	0 %	50 %	0 %	379017016
28553	NC_016913	AGGC	2	8	1121855	1121862	25 %	0 %	50 %	25 %	379017016
28554	NC_016913	A	6	6	1121927	1121932	100 %	0 %	0 %	0 %	379017016
28555	NC_016913	ATA	2	6	1121937	1121942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017016
28556	NC_016913	GAAAC	2	10	1122003	1122012	60 %	0 %	20 %	20 %	379017016
28557	NC_016913	TA	4	8	1122077	1122084	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
28558	NC_016913	AAT	2	6	1122114	1122119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017016
28559	NC_016913	AT	3	6	1122152	1122157	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
28560	NC_016913	TGAT	2	8	1122166	1122173	25 %	50 %	25 %	0 %	379017016
28561	NC_016913	TAAAAA	2	12	1122224	1122235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379017016
28562	NC_016913	GAA	2	6	1122246	1122251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017016
28563	NC_016913	CAA	2	6	1122288	1122293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017016
28564	NC_016913	AT	3	6	1122348	1122353	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
28565	NC_016913	CTT	2	6	1122370	1122375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017016
28566	NC_016913	TTTCT	2	10	1122443	1122452	0 %	80 %	0 %	20 %	379017016
28567	NC_016913	GAA	2	6	1122527	1122532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28568	NC_016913	TGC	2	6	1122589	1122594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28569	NC_016913	T	6	6	1122605	1122610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28570	NC_016913	GCA	2	6	1122645	1122650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28571	NC_016913	TTA	2	6	1122665	1122670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28572	NC_016913	GCT	2	6	1122698	1122703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28573	NC_016913	TGG	2	6	1122774	1122779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017017
28574	NC_016913	TAT	2	6	1122781	1122786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017017
28575	NC_016913	TGC	2	6	1122790	1122795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017017
28576	NC_016913	GTAA	2	8	1122843	1122850	50 %	25 %	25 %	0 %	379017017
28577	NC_016913	TGC	2	6	1122883	1122888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017017
28578	NC_016913	AAAT	2	8	1122922	1122929	75 %	25 %	0 %	0 %	379017017
28579	NC_016913	AGTTA	2	10	1123055	1123064	40 %	40 %	20 %	0 %	379017017
28580	NC_016913	ACAT	2	8	1123081	1123088	50 %	25 %	0 %	25 %	379017017
28581	NC_016913	ATT	2	6	1123089	1123094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28582	NC_016913	TGC	2	6	1123111	1123116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28583	NC_016913	AGTATA	2	12	1123117	1123128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28584	NC_016913	CAT	2	6	1123185	1123190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017018
28585	NC_016913	TATTAA	2	12	1123207	1123218	50 %	50 %	0 %	0 %	379017018
28586	NC_016913	TAC	2	6	1123307	1123312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017018
28587	NC_016913	TTACG	2	10	1123327	1123336	20 %	40 %	20 %	20 %	379017018
28588	NC_016913	GAAT	2	8	1123437	1123444	50 %	25 %	25 %	0 %	379017018
28589	NC_016913	GTTTG	2	10	1123498	1123507	0 %	60 %	40 %	0 %	379017018
28590	NC_016913	CCTCT	2	10	1123550	1123559	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28591	NC_016913	TAG	3	9	1123568	1123576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28592	NC_016913	TTA	2	6	1123597	1123602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28593	NC_016913	AGCTTT	2	12	1123771	1123782	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28594	NC_016913	ATT	3	9	1123791	1123799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28595	NC_016913	CTA	2	6	1123820	1123825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28596	NC_016913	GTTA	2	8	1123866	1123873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28597	NC_016913	ATTAAT	2	12	1123950	1123961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28598	NC_016913	ATA	3	9	1123999	1124007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28599	NC_016913	TCAT	2	8	1124053	1124060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28600	NC_016913	AGA	2	6	1124073	1124078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28601	NC_016913	AAT	2	6	1124094	1124099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28602	NC_016913	CCG	2	6	1124102	1124107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28603	NC_016913	AGC	2	6	1124128	1124133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28604	NC_016913	TAC	2	6	1124138	1124143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28605	NC_016913	A	7	7	1124166	1124172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28606	NC_016913	TTA	2	6	1124181	1124186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28607	NC_016913	ACTTA	2	10	1124230	1124239	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28608	NC_016913	TATT	2	8	1124255	1124262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28609	NC_016913	ACG	2	6	1124264	1124269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28610	NC_016913	AAT	2	6	1124273	1124278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28611	NC_016913	TAA	2	6	1124279	1124284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28612	NC_016913	ATTA	2	8	1124310	1124317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28613	NC_016913	GTTT	2	8	1124386	1124393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28614	NC_016913	GGTA	2	8	1124394	1124401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28615	NC_016913	AAT	2	6	1124502	1124507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28616	NC_016913	TCA	2	6	1124548	1124553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017019
28617	NC_016913	TCA	2	6	1124599	1124604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017019
28618	NC_016913	AG	3	6	1124629	1124634	50 %	0 %	50 %	0 %	379017019
28619	NC_016913	ATT	2	6	1124643	1124648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017019
28620	NC_016913	AAT	2	6	1124732	1124737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017019
28621	NC_016913	CTC	2	6	1124762	1124767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017019
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