MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_016913	T	7	7	1020826	1020832	0 %	100 %	0 %	0 %	379016918
26003	NC_016913	ACCAT	2	10	1020834	1020843	40 %	20 %	0 %	40 %	379016918
26004	NC_016913	TA	3	6	1020888	1020893	50 %	50 %	0 %	0 %	379016918
26005	NC_016913	TTC	2	6	1020993	1020998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016918
26006	NC_016913	ATC	2	6	1021041	1021046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016918
26007	NC_016913	AGC	2	6	1021081	1021086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016918
26008	NC_016913	TAA	2	6	1021098	1021103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016918
26009	NC_016913	TAA	2	6	1021106	1021111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016918
26010	NC_016913	TAT	2	6	1021129	1021134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26011	NC_016913	GC	3	6	1021170	1021175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26012	NC_016913	GCA	2	6	1021202	1021207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26013	NC_016913	ATT	2	6	1021279	1021284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016919
26014	NC_016913	TCCT	2	8	1021295	1021302	0 %	50 %	0 %	50 %	379016919
26015	NC_016913	CAT	2	6	1021312	1021317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016919
26016	NC_016913	ATTT	2	8	1021333	1021340	25 %	75 %	0 %	0 %	379016919
26017	NC_016913	CAC	2	6	1021348	1021353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016919
26018	NC_016913	ACT	2	6	1021545	1021550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016919
26019	NC_016913	AATAA	2	10	1021594	1021603	80 %	20 %	0 %	0 %	379016919
26020	NC_016913	GTA	2	6	1021611	1021616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016919
26021	NC_016913	AAT	2	6	1021617	1021622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016919
26022	NC_016913	CTA	2	6	1021662	1021667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016919
26023	NC_016913	GCT	2	6	1021819	1021824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016919
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26025	NC_016913	T	6	6	1021927	1021932	0 %	100 %	0 %	0 %	379016919
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26027	NC_016913	ATAAC	2	10	1021998	1022007	60 %	20 %	0 %	20 %	379016919
26028	NC_016913	TAT	2	6	1022009	1022014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016919
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26030	NC_016913	TAA	2	6	1022096	1022101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016919
26031	NC_016913	AATA	2	8	1022105	1022112	75 %	25 %	0 %	0 %	379016919
26032	NC_016913	CTA	2	6	1022197	1022202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016919
26033	NC_016913	GTAT	2	8	1022249	1022256	25 %	50 %	25 %	0 %	379016919
26034	NC_016913	AAG	2	6	1022259	1022264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016919
26035	NC_016913	TCT	2	6	1022274	1022279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016919
26036	NC_016913	A	6	6	1022286	1022291	100 %	0 %	0 %	0 %	379016919
26037	NC_016913	CTA	2	6	1022293	1022298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016919
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26042	NC_016913	TA	3	6	1022500	1022505	50 %	50 %	0 %	0 %	379016919
26043	NC_016913	ACTA	2	8	1022552	1022559	50 %	25 %	0 %	25 %	379016919
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26050	NC_016913	TTAT	2	8	1022811	1022818	25 %	75 %	0 %	0 %	379016919
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26055	NC_016913	ATC	2	6	1023030	1023035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016919
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26058	NC_016913	TACA	2	8	1023202	1023209	50 %	25 %	0 %	25 %	379016919
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26090	NC_016913	CAT	2	6	1024656	1024661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016920
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26102	NC_016913	AAT	2	6	1025022	1025027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016920
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26114	NC_016913	TCTTTA	2	12	1025785	1025796	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379016920
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26118	NC_016913	CCT	2	6	1025914	1025919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016920
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26237	NC_016913	TAT	2	6	1031262	1031267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016922
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26479	NC_016913	TA	3	6	1041361	1041366	50 %	50 %	0 %	0 %	379016934
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